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Wissenschaftler haben eine Datenbank entwickelt, in der die Wechselwirkungen zwischen bestimmten Paaren von Signalwegen und den Arten und Geweben, in denen sie beobachtet werden, dokumentiert sind

Eine Forschergruppe unter der Leitung von Sarah Sam vom Fachbereich Biologische Wissenschaften (2016) berichtete, dass die Wahrnehmung eines externen Signals durch Rezeptoren dazu führt, dass sich die Aktivitäten von Zwischenproteinen ändern.

Dies führt zur Regulierung von Transkriptionsfaktoren, die die Expression von Zielgenen modulieren. Für jedes Pfadpaar zeichnet XTalkDB detaillierte Informationen zu den experimentellen Bedingungen auf, unter denen Crosstalk entdeckt wurde.

Zellen bewerten und reagieren auf ihre Umwelt über Signalwege. Ein Signalweg enthält in der Regel eine genau definierte Reihe von regulatorischen und physikalischen Interaktionen zwischen Rezeptoren, intermediären Signalproteinen, Transkriptionsfaktoren und Zielgenen.

Die XTalkDB-Website bietet Wissenschaftlern eine einfach zu bedienende Schnittstelle zum Durchsuchen von Crosstalk-Informationen, indem sie einen oder mehrere Signalwege oder Moleküle von Interesse abfragen.

Es wurden 650 Paare in die Studie aufgenommen.

Grafische Zusammenfassung powered by Mind the Graph

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Hergestellt mit Mind the Graph

Zu möglichen Verbesserungen: "Der manuelle Kuratierungsprozess, der XTalkDB zugrunde liegt, hat seine Einschränkungeninsbesondere im Hinblick auf die Erweiterung des Erfassungsbereichs der Datenbank.

Wir planen, einen Rahmen für die Verarbeitung natürlicher Sprache zu entwickeln, der Veröffentlichungen nach ihrer Wahrscheinlichkeit bewertet, Crosstalk zu dokumentieren. Ein Kurator kann sich dann auf hoch bewertete Publikationen konzentrieren", geben sie zu.

Papiere Wirkung und Leistung

Wir können analysieren mit Altmetric Daten, dass dieses Papier auf dem der oberste Anteil aller Metriken in allen von den NIH finanzierten Artikeln in den Dimensionen.

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