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Os cientistas desenvolveram um banco de dados que documenta o cruzamento entre pares específicos de caminhos de sinalização e as espécies e tecidos em que são observados.
Um grupo de pesquisa liderado por Sarah Sam do Departamento de Ciências Biológicas (2016) relatou que a percepção de um sinal externo pelos receptores faz com que as atividades das proteínas intermediárias mudem.
Isto resulta na regulamentação dos fatores de transcrição, que modulam a expressão dos genes alvo. Para cada par de caminhos, o XTalkDB registra informações detalhadas descrevendo as condições experimentais sob as quais o crosstalk foi descoberto.
Células assess and respond to their environment via signaling pathways. A signaling pathway typically contains a well-defined set of regulatory and physical interactions among receptors, intermediate signaling proteins, transcription factors and target genes.
O site XTalkDB fornece uma interface fácil de usar para os cientistas navegarem pelas informações de crosstalk, consultando um ou mais caminhos ou moléculas de interesse.
Havia 650 pares incluídos no estudo.
Resumo gráfico alimentado por Mind the Graph
Discussing possible improvements, “The manual curation process underlying XTalkDB has its limitações, especially as we seek to expand the coverage of the database.
Planejamos desenvolver uma estrutura de processamento de linguagem natural que classificará as publicações com base em sua probabilidade de documentar os crosstalk. Um curador pode então se concentrar em publicações altamente classificadas", eles admitem.
Impacto e desempenho dos trabalhos
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