Cet article étonnant fait ressortir des statistiques résumant les données dans XTALKDB. En quelques minutes, l'auteur a créé une infographie expliquant la répartition des espèces dans XTALKDB.
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Les scientifiques ont développé une base de données qui documente la diaphonie entre des paires spécifiques de voies de signalisation et les espèces et tissus dans lesquels elles sont observées.
Un groupe de recherche dirigé par Sarah Sam du département des sciences biologiques (2016) a rapporté que la perception d'un signal externe par les récepteurs entraîne une modification des activités des protéines intermédiaires.
Il en résulte une régulation des facteurs de transcription, qui modulent l'expression des gènes cibles. Pour chaque paire de voies, XTalkDB enregistre des informations détaillées décrivant les conditions expérimentales dans lesquelles la diaphonie a été découverte.
Les cellules évaluent leur environnement et y répondent par des voies de signalisation. Une voie de signalisation contient généralement un ensemble bien défini d'interactions réglementaires et physiques entre les récepteurs, les protéines de signalisation intermédiaires, les facteurs de transcription et les gènes cibles.
Le site Web XTalkDB offre une interface conviviale permettant aux scientifiques de parcourir les informations sur la diaphonie en interrogeant une ou plusieurs voies ou molécules d'intérêt.
L'étude a porté sur 650 paires.
Abrégé graphique alimenté par Mind the Graph
En ce qui concerne les améliorations possibles, "le processus de curation manuelle qui sous-tend XTalkDB a ses limites, en particulier lorsque nous cherchons à étendre la couverture de la base de données.
Nous prévoyons de développer un cadre de traitement du langage naturel qui classera les publications en fonction de leur probabilité de documenter la diaphonie. Un conservateur peut alors se concentrer sur les publications hautement classées", admettent-ils.
Impact et performance des documents
Nous pouvons analyser avec Altmetric données que ce document est sur le partie supérieure de tous les paramètres dans tous les articles financés par les NIH dans les Dimensions.
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