XTALKDB: 신호 경로 누화 데이터베이스 논문 리뷰

이 놀라운 기사는 XTALKDB의 데이터를 요약한 통계를 보여줍니다. 저자는 단 몇 분 만에 XTALKDB에 있는 종의 분포를 설명하는 인포그래픽을 만들었습니다.

인간은 시각적 동물이기 때문에 이미지가 원하는 만큼 상세하게 연구를 설명할 수 있는 가장 좋은 방법입니다.

과학자들은 특정 신호 경로 쌍과 신호 경로가 관찰되는 종 및 조직 간의 혼선을 문서화하는 데이터베이스를 개발했습니다.

생명과학과 사라 샘이 이끄는 연구 그룹(2016)은 수용체가 외부 신호를 인식하면 중간 단백질의 활동이 변화한다고 보고했습니다.

그 결과 표적 유전자의 발현을 조절하는 전사 인자가 조절됩니다. 모든 경로 쌍에 대해 XTalkDB는 크로스토크가 발견된 실험 조건을 설명하는 자세한 정보를 기록합니다.

세포는 신호 전달 경로를 통해 환경을 평가하고 이에 반응합니다. 신호 경로는 일반적으로 수용체, 중간 신호 단백질, 전사 인자 및 표적 유전자 간에 잘 정의된 조절 및 물리적 상호 작용 세트를 포함합니다.

XTalkDB 웹사이트는 과학자들이 하나 이상의 관심 있는 경로 또는 분자를 쿼리하여 크로스토크 정보를 검색할 수 있는 사용하기 쉬운 인터페이스를 제공합니다.

이 연구에는 650쌍이 참여했습니다.

개선 가능성에 대해 논의하면서, "특히 데이터베이스의 범위를 확장하고자 할 때 XTalkDB의 기반이 되는 수동 큐레이션 프로세스에는 한계가 있습니다.

우리는 크로스토크 문서화 가능성에 따라 출판물을 평가하는 자연어 처리 프레임워크를 개발할 계획입니다. 그러면 큐레이터는 순위가 높은 출판물에 집중할 수 있습니다."라고 그들은 인정합니다.

다음을 사용하여 분석할 수 있습니다. 알트메트릭 이 백서에 있는 데이터는 Dimensions에서 NIH가 자금을 지원하는 모든 논문 내 모든 메트릭의 상위 부분을 차지합니다.

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