Mind the Graph in 3D slikanje proteinov

Ste kdaj poskušali ustvariti molekularno ilustracijo s klasičnimi molekularnimi pregledovalniki? Če je odgovor pritrdilen, potem že poznate težave.

Poiskati morate brezplačno različico, ki vam ne bo sesula računalnika, in porabiti več ur, da bi ugotovili, kako deluje, pri čemer lahko uporabite tudi nekaj programiranja. Borite se s programi, ki so zapleteni, neintuitivni in pogosto zahtevajo licenco.

Obstaja rešitev, ki se imenuje Proteinski prikazovalnik!

Ustvarjanje učinkovitih znanstvenih figur v nekaj minutah

O programu Protein Imager

Proteinski prikazovalnik je brezplačen spletni pregledovalnik molekul, ki omogoča ustvarjanje molekularnih ilustracij v nekaj klikih. Razvili so ga znanstveniki iz 3D studio za slikanje proteinov s ciljem racionalizacije ilustracije beljakovin.

Zakaj Protein Imager?

Protein Imager se od drugih molekularnih pregledovalnikov razlikuje po preprostosti in dostopnosti. Za dostop do vseh funkcij Protein Imagerja se morate le prijaviti s svojo e-pošto in internetno povezavo.

Protein Imager ima uporabniku prijazen vmesnik, ki omogoča prilagoditev molekularne ilustracije v vseh podrobnostih. Uporabnik lahko izbira med različnimi prednastavljenimi slogi (risani, realistični, grobozrnata površina) ali pa vizualizacijo prilagodi po svojih željah.

Primeri prednastavljenih slogov, ki jih je mogoče uporabiti v napravi Protein Imager.

Predstavitve molekul (površina, risanka, krogle, palice itd.), načini barvanja, barve ozadja, senčenje in okluzija okolice so le nekateri od nastavljivih parametrov, s katerimi se lahko uporabniki igrajo.

Strokovnjakom so na voljo tudi orodja za analizo podatkov, kot so superpozicija struktur, pregledovalnik zaporedij in izbire.

Poleg tega je v celoti spletna, kar pomeni, da ni lokalne namestitve, zastarelih različic ali težav z združljivostjo z operacijskimi sistemi. Vsako upodabljanje temelji na namenskem strežniku, čas upodabljanja pa je običajno krajši od 1 minute, odvisno od zahtevnosti ilustracije.

Začnite ustvarjati v Mind the Graph zdaj

Kdo uporablja Protein Imager?

Protein Imager je tako enostaven in intuitiven, da ga lahko izkoristi vsak, od študentov do izkušenih znanstvenikov. Uporabniki lahko sprostijo svojo ustvarjalnost in ustvarjajo znanstvene ilustracije za različne namene.

Številni znanstveniki so uporabili Protein Imager za ponazoritev svojih raziskovalnih ugotovitev v svojih člankih ali grafičnih povzetkih.

Protein Imager, ki ga uporablja znanstvenik Matteo Oliverio za ustvarjanje grafičnih izvlečkov.

Bolj ustvarjalni oblikujejo naslovnice revij s programom Protein Imager. Tisti, ki se navdušujejo nad znanstvenim komuniciranjem, uporabljajo Protein Imager za oblikovanje privlačnih vizualnih podob za svoje objave v družabnih medijih.

Profesor Syma Khalid z Univerze v Oxfordu oblikoval naslovnico revije Structure, letnik 29, številka 5, za maj 2021..

Nazadnje ima Protein Imager možnost izvoza molekul kot volumetričnih datotek (format VRML2), ki jih uporabljajo medicinski ilustratorji v programih za 3D grafiko, kot so Blender, Cinema 4D in Maya.

Slika iz portfelja studia za znanstveno ilustracijo BioSciVisuals. Za ponazoritev molekul, vključenih v končno grafično podobo plakata, je bil poleg profesionalnih orodij za ilustracijo uporabljen tudi program Protein Imager.

Ste pripravljeni, da začnete delati v Mind the Graph?

Zagon ilustracij

Preglejmo osnovne korake za začetek poti do ilustracije, kajne?

1 - naložite molekularno strukturo

Pojdi na Proteinski prikazovalnik in naložite katero koli molekularno strukturo iz svojega računalnika ali jo prenesite iz bioloških podatkovnih zbirk, kot sta Protein Data Bank ali podatkovna zbirka Orientations of Proteins in Membranes (OPM).

2 - Prilagoditev

Na desni strani plošče s strukturo izberite predstavitev molekul in barvne sheme, na ploščah z vizualizacijo pa nastavite senčenje, luči, okluzijo okolice in preprosto izberite prednastavljeni slog.

3 - Pridobite sliko

Ko ste zadovoljni z videzom svoje strukture, zahtevajte izris.

V nekaj minutah boste lahko s plošče za upodabljanje prenesli ilustracijo v visoki kakovosti. Upoštevajte, da se morate za zahtevo po upodabljanju registrirati z veljavnim e-poštnim naslovom.

4 - Delite ga s sodelavci

Ko ste z delom zadovoljni, ga lahko shranite v uporabniško mapo, v kateri lahko shranite do 25 MB. Za vsak projekt lahko dobite povezavo, ki jo lahko delite s sodelavci, tako da so vsi na isti strani.

Začnite uporabljati Mind The Graph prav zdaj brezplačno!

Mind the Graph in 3D slikanje proteinov

Seveda sta 3D Protein Imaging in Mind the Graph najboljše partnerstvo doslej!

Svojo 3D sliko proteina lahko uporabite in jo v sekundi prenesete v svojo kreacijo v Mind the Graph. Če želite izvedeti, kako naložiti slike, si lahko ogledate vadbeni videoposnetek tukaj.

Ali pa pojdite v svojo kreacijo Mind the Graph, kliknite na Več na dnu levega menija, nato pa Naložite, izberite sliko, po nalaganju pa jo povlecite v delovni prostor in končano!

Poleg tega lahko izberete katero koli ilustracijo, ki je na voljo v galeriji Mind the Graph, in jo uporabite skupaj s slikami svojih proteinov.

V galeriji Mind the Graph je veliko vizualno privlačnih številk za vaše raziskave, saj vsebuje več kot 40 000 znanstveno natančnih ilustracij na več kot 80 priljubljenih področjih. Če potrebujete ilustracijo, jo lahko najdete na Mind the Graph.

Če niste našli, kar potrebujete, ali če potrebujete zelo specifično ilustracijo, lahko zahtevate prilagojeno ilustracijo in ekipa ilustratorjev Mind the Graph jo bo oblikovala za vas. Vse, kar morate storiti, je, da izpolnite Mind the Graph Zahtevajte ikono v delovnem prostoru s kratko razlago in referenčno sliko. V enem tednu boste prejeli prilagojeno ilustracijo.

Neverjetno, kajne?

Oglejte si videoposnetek o tem, kako lahko ustvarite svojo znanstveno sliko z uporabo programa Mind the Graph in uporabite zunanje slike iz programa 3D Protein Imaging.