Mind the Graph ir 3D baltymų vaizdavimas

Ar kada nors bandėte sukurti molekulinę iliustraciją naudodami klasikinius molekulinius žiūronus? Jei atsakymas yra teigiamas, tuomet jau žinote, kaip sunku tai padaryti.

Turite susirasti nemokamą versiją, kuri nesugadintų kompiuterio, ir praleisti valandų valandas bandydami išsiaiškinti, kaip ji veikia, galbūt ir šiek tiek programuodami. Kovokite su programomis, kurios yra sudėtingos, neintuityvios ir dažnai reikalauja licencijos.

Sprendimas yra, jis vadinamas Baltymų vaizduoklis!

Per kelias minutes sukurkite efektyvius mokslinius paveikslėlius

Apie "Protein Imager

Baltymų vaizduoklis yra nemokama internetinė molekulinė naršyklė, skirta molekulinėms iliustracijoms kurti keliais spustelėjimais. Ją sukūrė mokslininkai iš 3D baltymų vaizdavimo studija siekiant supaprastinti baltymų iliustravimą.

Kodėl reikia proteinų vaizduoklio?

"Protein Imager" skiriasi nuo kitų molekulinių naršyklių savo paprastumu ir prieinamumu. Norint naudotis visomis "Protein Imager" funkcijomis, tereikia prisijungti naudojant el. paštą ir interneto ryšį.

"Protein Imager" turi patogią vartotojo sąsają, leidžiančią pritaikyti kiekvieną molekulinės iliustracijos detalę. Vartotojas gali rinktis iš įvairių iš anksto nustatytų stilių (animacinis, realistinis, stambiagrūdis paviršius) arba pritaikyti vizualizaciją taip, kaip jam patinka.

Iš anksto nustatytų stilių, kuriuos galima naudoti "Protein Imager", pavyzdžiai.

Molekulių atvaizdavimas (paviršius, karikatūra, sferos, lazdelės ir t. t.), spalvinimo režimai, fono spalvos, šešėliai ir aplinkos užtemdymas - tai tik keli iš derinamų parametrų, su kuriais gali žaisti naudotojai.

Ekspertams taip pat prieinami tokie duomenų analizės įrankiai, kaip struktūrų superpozicija, sekų peržiūros programa ir atrankos.

Be to, ji yra visiškai internetinė, todėl jos nereikia diegti vietoje, spręsti pasenusių versijų ar suderinamumo su operacinėmis sistemomis problemų. Kiekvienas atvaizdavimas priklauso nuo specialaus serverio, o atvaizdavimo laikas, priklausomai nuo iliustracijos sudėtingumo, paprastai yra trumpesnis nei 1 minutė.

Pradėkite kurti Mind the Graph dabar

Kas naudoja "Protein Imager"?

"Protein Imager" yra toks paprastas ir intuityvus, kad juo gali naudotis visi - nuo studentų iki patyrusių mokslininkų. Naudotojai gali išlaisvinti savo kūrybiškumą ir kurti mokslines iliustracijas įvairiems tikslams.

Daugelis mokslininkų pritaikė "Protein Imager", kad galėtų iliustruoti savo mokslinių tyrimų rezultatus dokumentuose ar grafinėse santraukose.

Baltymų vaizduoklis, kurį naudoja mokslininkas Matteo Oliverio kurti grafines santraukas.

Kūrybingesnieji kuria žurnalų viršelius naudodami "Protein Imager". Aistringai besidomintys mokslo komunikacija naudoja "Protein Imager", kad sukurtų patrauklius vaizdinius savo socialinės žiniasklaidos pranešimams.

Oksfordo universiteto profesorė Syma Khalid sukūrė 2021 m. gegužės mėn. žurnalo "Structure" 29 tomo 5 numerio viršelio dizainą..

Galiausiai "Protein Imager" turi galimybę eksportuoti molekules kaip tūrinius failus (VRML2 formatu), kuriuos naudoja medicinos iliustratoriai 3D grafikos programose, pavyzdžiui, "Blender", "Cinema 4D", "Maya".

Mokslinės iliustracijų studijos "BioSciVisuals" portfolio nuotrauka. Galutinėje plakato grafinėje medžiagoje esančioms molekulėms iliustruoti kartu su profesionaliomis iliustravimo priemonėmis buvo naudojama "Protein Imager".

Ar esate pasirengę pradėti dirbti Mind the Graph?

Iliustracijų pradžia

Panagrinėkime pagrindinius žingsnius, kaip pradėti iliustravimo kelionę, ar ne?

1 - Įkelti molekulinę struktūrą

Eikite į Baltymų vaizduoklis ir įkelkite bet kokią molekulinę struktūrą iš savo kompiuterio arba paimkite ją iš biologinių duomenų bazių, pavyzdžiui, "Protein Data Bank" arba "Orientations of Proteins in Membranes" (OPM) duomenų bazės.

2 - Pritaikyti

Dešinėje esančiame struktūros skydelyje pasirinkite molekulių atvaizdavimą ir spalvų schemas, o vizualizavimo skydeliuose nustatykite šešėlius, šviesas, aplinkos užtemdymą, tiesiog pasirinkite iš anksto nustatytą stilių.

3 - Gaukite vaizdą

Kai būsite patenkinti savo konstrukcijos išvaizda, paprašykite pateikti vizualizaciją.

Po kelių minučių galėsite atsisiųsti aukštos kokybės iliustraciją iš atvaizdavimo skydelio. Atkreipkite dėmesį, kad norėdami paprašyti atvaizdavimo, turite užsiregistruoti naudodami galiojantį el. pašto adresą.

4 - Dalinkitės juo su bendradarbiais

Kai būsite patenkinti savo darbu, galite jį išsaugoti naudotojo aplanke, kuriame telpa iki 25 MB. Galite gauti kiekvieno projekto nuorodą, kurią galėsite bendrinti su bendradarbiais, kad visi būtų tame pačiame puslapyje.

Pradėkite naudotis "Mind The Graph" dabar nemokamai!

Mind the Graph ir 3D baltymų vaizdavimas

Žinoma, "3D Protein Imaging" ir "Mind the Graph" sudaro geriausią partnerystę!

Galite naudoti savo 3D baltymo atvaizdą ir įkelti jį į savo kūrinį Mind the Graph per sekundę. Norėdami sužinoti, kaip įkelti vaizdus, galite pažiūrėti mokomąjį vaizdo įrašą čia.

Arba eikite į savo Mind the Graph sukūrimą, spustelėkite Daugiau kairiojo meniu apačioje, tada Įkelti, pasirinkite paveikslėlį, o kai jis bus įkeltas, pasirinkite ir vilkite paveikslėlį į savo darbo sritį ir baigta!

Be to, galite pasirinkti bet kurią Mind the Graph galerijoje esančią iliustraciją ir naudoti ją kartu su savo baltymų vaizdais.

"Mind the Graph" galerijoje yra daug vizualiai patrauklių skaičių, skirtų jūsų tyrimams, su 40 000+ moksliškai tikslių iliustracijų iš 80+ populiarių sričių. Jei jums reikia iliustracijos, ją rasite Mind the Graph.

Jei vis dėlto neradote to, ko jums reikia, arba jums reikia labai konkrečios iliustracijos, galite paprašyti asmeninės iliustracijos ir Mind the Graph iliustratorių komanda sukurs ją jums. Viskas, ką jums reikia padaryti, tai užpildyti Mind the Graph Prašyti piktogramos formą, esančią jūsų darbo erdvėje, su trumpu paaiškinimu ir pavyzdiniu paveikslėliu. Per savaitę gausite asmeninę iliustraciją.

Nuostabu, tiesa?

Peržiūrėkite vaizdo įrašą, kuriame pasakojama, kaip galite sukurti mokslinę figūrą naudodami Mind the Graph ir naudoti išorinius vaizdus iš "3D Protein Imaging".