Mind the Graph og 3D-billeddannelse af proteiner

Har du nogensinde prøvet at lave en molekylær illustration med klassiske molekylære viewers? Hvis svaret er ja, så kender du allerede kampen.

Du er nødt til at finde en gratis version, der ikke får din computer til at gå ned, og bruge timer på at finde ud af, hvordan det fungerer, muligvis med lidt kodning involveret. Kæmpe med programmer, der er komplicerede, uintuitive og ofte kræver en licens.

Der findes en løsning, og den hedder Protein-imager!

Lav effektive videnskabsfigurer på få minutter

Om Protein Imager

Protein-imager er en gratis webbaseret molekylær viewer, der kan skabe molekylære illustrationer med et par klik. Den er udviklet af forskere fra Studie til 3D-billeddannelse af proteiner med det formål at strømline proteinillustrationen.

Hvorfor Protein Imager?

Det, der adskiller Protein Imager fra andre molekylære viewere, er dens enkelhed og tilgængelighed. Du behøver kun at logge ind med din e-mail og en internetforbindelse for at få adgang til alle Protein Imagers funktioner.

Protein Imager har en brugervenlig grænseflade, der gør det muligt at tilpasse den molekylære illustration i alle detaljer. Brugeren kan vælge mellem forskellige forudindstillede stilarter (tegneserieagtig, realistisk, grovkornet overflade) eller tilpasse visualiseringen, som de vil.

Eksempler på forudindstillede stilarter, der kan bruges på Protein Imager.

Molekylære repræsentationer (overflade, tegneserie, kugler, pinde osv.), farvetilstande, baggrundsfarver, skygge og omgivende okklusion er blot nogle af de justerbare parametre, som brugerne kan lege med.

Dataanalyseværktøjer som strukturoverlejring, sekvensfremviser og selektioner er også tilgængelige for eksperter.

Desuden er det helt online, hvilket betyder ingen lokal installation, ingen håndtering af forældede versioner eller kompatibilitetsproblemer med dine operativsystemer. Hver gengivelse er afhængig af en dedikeret server, og gengivelsestiden er typisk mindre end 1 minut, afhængigt af illustrationens kompleksitet.

Begynd at skabe hos Mind the Graph nu

Hvem bruger Protein Imager?

Protein Imager er så nemt og intuitivt, at alle kan få gavn af det, lige fra studerende til erfarne forskere. Brugerne kan frit slippe deres kreativitet løs og skabe videnskabelige illustrationer til forskellige formål.

Mange forskere har brugt Protein Imager til at illustrere deres forskningsresultater i deres artikler eller grafiske sammendrag.

Protein Imager brugt af videnskabsmand Matteo Oliverio til at skabe grafiske abstrakter.

De mere kreative designer omslag til tidsskrifter med Protein Imager. De, der brænder for videnskabskommunikation, bruger Protein Imager til at designe iøjnefaldende billeder til deres opslag på de sociale medier.

Professor Syma Khalid fra University of Oxford har produceret designet til forsiden af tidsskriftet Structure, Volume 29, Issue 5, maj 2021.

Endelig har Protein Imager mulighed for at eksportere molekylerne som volumetriske filer (VRML2-format), der bruges af medicinske illustratorer i 3D-grafikprogrammer som Blender, Cinema 4D, Maya.

Portfoliobillede fra BioSciVisuals' videnskabelige illustrationsstudie. Protein Imager blev brugt til at illustrere de molekyler, der indgik i den endelige plakatgrafik, sammen med professionelle illustrationsværktøjer.

Er du klar til at komme i gang hos Mind the Graph?

Kickstart dine illustrationer

Lad os gennemgå de grundlæggende trin til at starte din illustrationsrejse, skal vi?

1 - Indlæs den molekylære struktur

Gå til Protein-imager og uploade enhver molekylær struktur fra din computer eller hente den fra biologiske databaser som Protein Data Bank eller OPM-databasen (Orientations of Proteins in Membranes).

2 - Tilpas

I strukturpanelet til højre kan du vælge molekylær repræsentation og farveskemaer, og i visualiseringspanelerne kan du indstille skygger, lys og omgivende okklusion og vælge en forudindstillet stil.

3 - Hent billedet

Når du er tilfreds med udseendet af din konstruktion, kan du bede om en rendering.

Om få minutter vil du kunne downloade illustrationen i høj kvalitet fra renderingspanelet. Bemærk, at du skal tilmelde dig med en gyldig e-mailadresse for at anmode om en gengivelse.

4 - Del den med dine samarbejdspartnere

Når du er tilfreds med dit arbejde, kan du gemme det i brugermappen, der gemmer op til 25 MB. Du kan få et link til hvert projekt, som du kan dele med samarbejdspartnere, så alle er på samme side.

Begynd at bruge Mind The Graph gratis lige nu!

Mind the Graph og 3D-billeddannelse af proteiner

Selvfølgelig udgør 3D Protein Imaging og Mind the Graph det bedste partnerskab nogensinde!

Du kan bruge dit 3D-proteinbillede og uploade det til din kreation på Mind the Graph på et sekund. For at lære at uploade billeder kan du se en tutorial-video lige her.

Eller gå til din Mind the Graph-oprettelse, klik på Mere i bunden af din venstre menu, og derefter Uploadvælg dit billede, og når det er indlæst, skal du vælge og trække billedet til dit arbejdsområde - og færdig!

Desuden kan du vælge enhver illustration, der er tilgængelig på Mind the Graph Gallery, til brug sammen med dine proteinbilleder.

Mind the Graph Gallery har mange visuelt tiltalende figurer til din forskning, med 40.000+ videnskabeligt nøjagtige illustrationer inden for 80+ populære områder. Hvis du har brug for en illustration, kan du finde den hos Mind the Graph.

Men hvis du ikke fandt, hvad du havde brug for, eller hvis du har brug for en meget specifik illustration, kan du anmode om en personlig illustration, og Mind the Graph's illustrationsteam vil designe den til dig. Alt, hvad du skal gøre, er at udfylde Mind the Graph Anmod om et ikon formular, inde i dit arbejdsområde, med en kort forklaring og et referencebillede. Inden for en uge vil du modtage din personlige illustration.

Utroligt, ikke?

Se videoen om, hvordan du kan skabe din videnskabelige figur ved hjælp af Mind the Graph og bruge eksterne billeder fra 3D Protein Imaging.