Mind the Graph og 3D-proteinavbildning

Har du noen gang prøvd å lage en molekylær illustrasjon med klassiske molekylære visningsverktøy? Hvis svaret er ja, vet du allerede hvor vanskelig det er.

Du må finne en gratisversjon som ikke får datamaskinen til å krasje, og du må bruke timevis på å finne ut hvordan det fungerer, eventuelt med litt koding involvert. Kjempe med programmer som er kompliserte, lite intuitive og ofte krever lisens.

Det finnes en løsning som heter Proteinavbildning!

Lag effektive vitenskapelige figurer på få minutter

Om Protein Imager

Proteinavbildning er en gratis, nettbasert molekylfremviser som kan brukes til å lage molekylære illustrasjoner med noen få klikk. Den ble utviklet av forskere fra Studio for 3D-proteinavbildning med mål om å effektivisere proteinillustrasjonen.

Hvorfor Protein Imager?

Det som skiller Protein Imager fra andre molekylære visningsverktøy, er enkelheten og tilgjengeligheten. Du trenger bare å logge på med e-postadressen din og en internettforbindelse for å få tilgang til alle funksjonene i Protein Imager.

Protein Imager har et brukervennlig grensesnitt som gjør det mulig å tilpasse den molekylære illustrasjonen i alle detaljer. Brukeren kan velge mellom ulike forhåndsinnstilte stiler (tegneserieaktig, realistisk, grovkornet overflate) eller tilpasse visualiseringen etter eget ønske.

Eksempler på forhåndsinnstilte stiler som kan brukes på Protein Imager.

Molekylære representasjoner (overflate, tegneserie, kuler, pinner osv.), fargemodus, bakgrunnsfarger, skyggelegging og omgivende okklusjon er bare noen av de justerbare parametrene som brukerne kan leke med.

Dataanalyseverktøy som strukturoverlagring, sekvensvisning og utvalg er også tilgjengelig for eksperter.

I tillegg er det helt nettbasert, noe som betyr at du slipper lokal installasjon, utdaterte versjoner og kompatibilitetsproblemer med operativsystemene dine. Hver gjengivelse skjer på en dedikert server, og gjengivelsestiden er vanligvis under 1 minutt, avhengig av illustrasjonens kompleksitet.

Begynn å skape hos Mind the Graph nå

Hvem bruker Protein Imager?

Protein Imager er så enkelt og intuitivt at alle kan dra nytte av det, fra studenter til erfarne forskere. Brukerne kan slippe kreativiteten løs og lage vitenskapelige illustrasjoner til ulike formål.

Mange forskere har tatt i bruk Protein Imager for å illustrere forskningsresultatene sine i artikler eller grafiske sammendrag.

Protein Imager brukt av forsker Matteo Oliverio for å lage grafiske abstrakter.

De mer kreative designer tidsskriftomslag med Protein Imager. De som er lidenskapelig opptatt av forskningskommunikasjon, bruker Protein Imager til å designe iøynefallende bilder til innlegg på sosiale medier.

Professor Syma Khalid fra Universitetet i Oxford laget designet til omslaget for mai 2021 av tidsskriftet Structure, Volume 29, Issue 5..

Til slutt har Protein Imager muligheten til å eksportere molekylene som volumetriske filer (VRML2-format) som brukes av medisinske illustratører i 3D-grafikkprogrammer som Blender, Cinema 4D og Maya.

Porteføljebilde fra porteføljen til BioSciVisuals vitenskapelige illustrasjonsstudio. Protein Imager ble brukt til å illustrere molekylene som inngår i den endelige plakatgrafikken, sammen med profesjonelle illustrasjonsverktøy.

Er du klar til å begynne hos Mind the Graph?

Få fart på illustrasjonene dine

Skal vi gå gjennom de grunnleggende trinnene for å starte illustrasjonsreisen?

1 - Last inn molekylstrukturen

Gå til Proteinavbildning og laste opp en hvilken som helst molekylstruktur fra datamaskinen eller hente den fra biologiske databaser som Protein Data Bank eller OPM-databasen (Orientations of Proteins in Membranes).

2 - Tilpass

I strukturpanelet til høyre kan du velge molekylær representasjon og fargevalg, og i visualiseringspanelene kan du stille inn skygger, lys og omgivende okklusjon og velge en forhåndsinnstilt stil.

3 - Hent bildet

Når du er fornøyd med konstruksjonens utseende, kan du be om rendering.

Om noen få minutter kan du laste ned illustrasjonen i høy kvalitet fra renderingspanelet. Merk at du må registrere deg med en gyldig e-postadresse for å be om en gjengivelse.

4 - Del den med samarbeidspartnerne dine

Når du er fornøyd med arbeidet ditt, kan du lagre det i brukermappen som kan lagre opptil 25 MB. Du kan få en lenke for hvert prosjekt som du kan dele med samarbeidspartnere, slik at alle er på samme side.

Begynn å bruke Mind The Graph gratis nå!

Mind the Graph og 3D-proteinavbildning

Selvfølgelig er 3D Protein Imaging og Mind the Graph det beste partnerskapet noensinne!

Du kan bruke 3D-proteinbildet ditt og laste det opp i skapelsen din på Mind the Graph på et øyeblikk. Hvis du vil vite hvordan du laster opp bilder, kan du se en opplæringsvideo. her.

Eller du kan gå til Mind the Graph-opprettelsen og klikke på Mer om dette nederst i menyen til venstre, og deretter Last oppvelg bildet ditt, og når det er lastet inn, velger du det og drar det til arbeidsområdet, og ferdig!

I tillegg kan du velge hvilken som helst illustrasjon som er tilgjengelig på Mind the Graph Gallery, og bruke den sammen med proteinbildene dine.

Mind the Graph Gallery har mange visuelt tiltalende figurer for forskningen din, med mer enn 40 000 vitenskapelig nøyaktige illustrasjoner innen mer enn 80 populære fagområder. Hvis du trenger en illustrasjon, finner du den hos Mind the Graph.

Hvis du likevel ikke finner det du trenger, eller hvis du trenger en helt spesiell illustrasjon, kan du be om en personlig illustrasjon, og Mind the Graphs illustrasjonsteam vil designe den for deg. Alt du trenger å gjøre er å fylle ut Mind the Graph Be om et ikon skjema, inne i arbeidsområdet ditt, med en kort forklaring og et referansebilde. I løpet av en uke får du din personlige illustrasjon.

Utrolig, ikke sant?

Se videoen om hvordan du kan lage en vitenskapelig figur ved hjelp av Mind the Graph og bruke eksterne bilder fra 3D Protein Imaging.