Mind the Graph a 3D zobrazovanie proteínov

Skúšali ste niekedy vytvoriť molekulárnu ilustráciu pomocou klasických molekulárnych prehliadačov? Ak je odpoveď áno, potom už poznáte ten problém.

Musíte nájsť bezplatnú verziu, ktorá vám nezruší počítač, a stráviť hodiny hľadaním spôsobu jej fungovania, prípadne aj kódovaním. Bojujte s programami, ktoré sú komplikované, neintuitívne a často vyžadujú licenciu.

Existuje riešenie, ktoré sa nazýva Proteínová zobrazovacia jednotka!

Vytvárajte efektívne vedecké postavy za niekoľko minút

O aplikácii Protein Imager

Proteínová zobrazovacia jednotka je bezplatný webový prehliadač molekúl, ktorý umožňuje vytvárať molekulárne ilustrácie niekoľkými kliknutiami. Vyvinuli ho vedci z 3D štúdio na zobrazovanie proteínov s cieľom zefektívniť ilustráciu bielkovín.

Prečo Protein Imager?

Protein Imager sa od iných molekulárnych prehliadačov odlišuje jednoduchosťou a prístupnosťou. Na prístup ku všetkým funkciám Protein Imageru sa stačí prihlásiť pomocou e-mailu a pripojenia na internet.

Protein Imager má používateľsky prívetivé rozhranie, ktoré umožňuje prispôsobenie molekulárnej ilustrácie do najmenších detailov. Používateľ si môže vybrať z rôznych prednastavených štýlov (kreslený, realistický, hrubozrnný povrch) alebo si vizualizáciu prispôsobiť podľa svojich predstáv.

Príklady prednastavených štýlov, ktoré možno použiť v aplikácii Protein Imager.

Reprezentácie molekúl (povrch, kreslený film, gule, tyčinky atď.), režimy farbenia, farby pozadia, tieňovanie a okluzívne prostredie sú len niektoré z nastaviteľných parametrov, s ktorými sa môžu používatelia hrať.

Odborníci majú k dispozícii aj nástroje na analýzu údajov, ako je superpozícia štruktúr, prehliadač sekvencií a výbery.

Okrem toho je úplne online, čo znamená, že nie je potrebné inštalovať ho lokálne, riešiť zastarané verzie ani problémy s kompatibilitou s operačnými systémami. Každé vykresľovanie sa spolieha na vyhradený server a čas vykresľovania je zvyčajne kratší ako 1 minúta v závislosti od zložitosti ilustrácie.

Začnite tvoriť na Mind the Graph teraz

Kto používa Protein Imager?

Aplikácia Protein Imager je taká jednoduchá a intuitívna, že ju môže využívať každý, od študentov až po skúsených vedcov. Používatelia môžu uvoľniť svoju kreativitu a vytvárať vedecké ilustrácie na rôzne účely.

Mnohí vedci použili Protein Imager na ilustráciu svojich výskumných zistení vo svojich prácach alebo grafických abstraktoch.

Protein Imager používaný vedec Matteo Oliverio na vytváranie grafických abstraktov.

Tí kreatívnejší navrhujú obálky časopisov pomocou programu Protein Imager. Tí, ktorí sa venujú vedeckej komunikácii, používajú Protein Imager na navrhovanie pútavých vizuálov pre svoje príspevky na sociálnych sieťach.

Profesor Syma Khalid z Oxfordskej univerzity vytvorila návrh obálky časopisu Structure, ročník 29, číslo 5, máj 2021.

Nakoniec má Protein Imager možnosť exportovať molekuly ako objemové súbory (formát VRML2), ktoré používajú lekárski ilustrátori v 3D grafických programoch, ako sú Blender, Cinema 4D, Maya.

Obrázok z portfólia vedeckého ilustračného štúdia BioSciVisuals. Na znázornenie molekúl zahrnutých do konečnej grafickej podoby plagátu sa popri profesionálnych ilustračných nástrojoch použil nástroj Protein Imager.

Ste pripravení začať pracovať v Mind the Graph?

Naštartujte svoje ilustrácie

Prejdime si základné kroky na začiatku vašej cesty za ilustráciou, dobre?

1 - Načítanie molekulárnej štruktúry

Prejsť na Proteínová zobrazovacia jednotka a nahrať akúkoľvek molekulárnu štruktúru z počítača alebo ju načítať z biologických databáz, ako je Protein Data Bank alebo databáza Orientations of Proteins in Membranes (OPM).

2 - Prispôsobenie

Prostredníctvom panela štruktúry vpravo si vyberte molekulárne zastúpenie a farebné schémy, prostredníctvom panelov vizualizácie vylaďte tieňovanie, svetlá, ambientnú okluziu a vyberte si prednastavený štýl.

3 - Získajte obrázok

Keď ste spokojní so vzhľadom svojej stavby, požiadajte o jej vykreslenie.

O niekoľko minút si budete môcť stiahnuť ilustráciu vo vysokej kvalite z panela vykresľovania. Upozorňujeme, že ak chcete požiadať o renderovanie, musíte sa zaregistrovať s platnou e-mailovou adresou.

4 - Zdieľajte ho so svojimi spolupracovníkmi

Keď ste so svojou prácou spokojní, môžete ju uložiť do používateľského priečinka, ktorý má veľkosť až 25 MB. Ku každému projektu môžete získať odkaz, ktorý môžete zdieľať so spolupracovníkmi, aby boli všetci na rovnakej stránke.

Začnite používať Mind The Graph práve teraz zadarmo!

Mind the Graph a 3D zobrazovanie proteínov

Samozrejme, 3D Protein Imaging a Mind the Graph tvoria to najlepšie partnerstvo vôbec!

Môžete použiť svoj 3D obrázok proteínu a v sekunde ho nahrať do svojho výtvoru na Mind the Graph. Ak sa chcete naučiť, ako nahrať obrázky, môžete si pozrieť inštruktážne video priamo tu.

Alebo prejdite na vytvorenie Mind the Graph, kliknite na Viac na v dolnej časti ľavého menu a potom Nahrať, vyberte obrázok a po načítaní ho presuňte na pracovnú plochu a hotovo!

Okrem toho si môžete vybrať ľubovoľnú ilustráciu dostupnú v galérii Mind the Graph a použiť ju spolu s obrázkami svojich proteínov.

V galérii Mind the Graph nájdete množstvo vizuálne atraktívnych obrázkov pre váš výskum s viac ako 40 000 vedecky presnými ilustráciami vo viac ako 80 populárnych oblastiach. Ak potrebujete ilustráciu, nájdete ju na Mind the Graph.

Ak ste nenašli to, čo potrebujete, alebo ak potrebujete veľmi špecifickú ilustráciu, môžete požiadať o personalizovanú ilustráciu a ilustrátorský tím Mind the Graph ju pre vás navrhne. Všetko, čo musíte urobiť, je vyplniť Mind the Graph Vyžiadanie ikony formulára vo vašom pracovnom priestore so stručným vysvetlením a referenčným obrázkom. Do týždňa dostanete svoju personalizovanú ilustráciu.

Úžasné, však?

Pozrite si video o tom, ako môžete vytvoriť vedeckú postavu pomocou Mind the Graph a použiť externé obrázky z 3D Protein Imaging.