Vizualne abstrakcije ni lahko ustvariti, vendar je tu, da ostane. Zato vedno radi pokažemo neverjetna dela naših uporabnikov kot navdihujoč primer vizualne abstrakcije. Znanstvenike želimo opolnomočiti, da bi omogočili bolj vizualno in dosegljivo znanost.

V prispevku vam bom predstavil delček izvirne raziskave, ki jo je Yelena Sterlin in sodelavci. Je doktorska študentka na Fakulteti za kmetijstvo, prehrano in okolje na Hebrejski univerzi v Jeruzalemu.

Njen novi članek Optimizirani izvlečki majhnih molekul opredeljujejo MLBP1 kot beljakovino, ki veže acil-lipide osvetljuje interakcije med proteini in metaboliti v rastlinah, s poudarkom na receptorjih za abscisično kislino (ABA). Je tudi naročnica programa mind the graph, zato je ustvarila infografiko v upoštevajte graf pojasniti svojo metodologijo.

Pomen proteinov, povezanih z domeno START

 

Po podatkih Revija Natureabscisična kislina (ABA) je glavni fitohormon, ki sodeluje pri odzivanju na abiotski stres in prilagajanju nanj. Prav tako je kandidat za agrokemikalije. ABA je bila prvič odkrita v šestdesetih letih prejšnjega stoletja. Nato je bilo ugotovljeno, da je ključni regulator različnih procesov, kot so mirovanje, kalitev, razvoj semen ter odzivi na biotski in abiotski stres.

Najzgodnejši dogodki, ki vključujejo signalno pot ABA, vključujejo vezavo ABA na receptorje PYR/PYL/RCARs. Receptorji spadajo v naddružino z domeno START.

Proteinske domene START so domene, ki vežejo lipide in so prisotne v genomih bakterij, protistov, kvasovk, rastlin in živali. Vendar so pogostejše pri rastlinah. Po podatkih Schrick, prisotnost domen START pri evolucijsko oddaljenih vrstah, kot so živali in rastline, kaže na ohranjen mehanizem interakcije proteinov z lipidi/steroli.

Dokument, objavljen v Časopis za rastline se osredotoča na receptorje ABA PYR/PYL/RCAR. Raziskovalci so se odločili optimizirati metodo, ki bi omogočila identifikacijo ligandov domene START in z domeno START povezanih proteinov v rastlinah, ker "ligandi proteinov z domeno START so nepogrešljivi za pravilno delovanje njihovih proteinov tako pri živalih kot pri rastlinah, za rastlinske proteine z domeno START pa je bilo dokazano, da so vpleteni v bistvene fiziološke procese".

Vizualni povzetek metodologije

 

Da bi pojasnili svojo metodologijo, so znanstveniki pripravili infografiko z ilustracijami grafov. Ta je privlačna za oči in lažje razumljiva. 

 

Spodnja infografika prikazuje eksperimentalni potek dela. Kot lahko vidite, so izrazili in očistili štiri beljakovine START. Supernatant, ki je vseboval nativno topno frakcijo, so filtrirali in inkubirali s streptavidinsko sefarozo, afinitetno smolo za zanesljivo in visoko-čiščenje biomolekul z visoko ločljivostjo. Nato so alikvote analizirali z metodo western blot. Za identifikacijo liganda so eluirali domnevne ligande in jih analizirali s sistemom LC-MS (tekočinska kromatografija in masna spektrometrija). S tandemsko masno spektrometrijo so določili molekulsko strukturo domnevnih ligandov, ki so jih zanimali.

 

vizualna abstrakcija yelene sterlin

Avtorji so predstavili dobro tehniko za začetno sondiranje beljakovinskih ligandov v rastlinah. Prilagodili so pristop za odkrivanje ligandov START. S prilagoditvijo analitičnih pogojev pa lahko metodo uporabimo za ligande različne kemijske narave.

Če želite svoje raziskave prikazati z znanstvenimi ilustracijami in vizualnimi povzetki, lahko uporabite tudi Mind the Graph. Ste pripravljeni izboljšati svoje sporazumevanje v znanosti?

predogled_250

logotip-odjava

Naročite se na naše novice

Ekskluzivna visokokakovostna vsebina o učinkovitih vizualnih
komuniciranje v znanosti.

- Ekskluzivni vodnik
- Nasveti za oblikovanje
- Znanstvene novice in trendi
- Učni listi in predloge