Ein visuelles Abstraktum ist nicht einfach zu erstellen, aber es ist hier, um zu bleiben. Deshalb zeigen wir immer gerne die erstaunlichen Arbeiten unserer Nutzer als inspirierende Beispiele für visuelle Abstraktionen. Wir möchten Wissenschaftlern die Möglichkeit geben, eine visuellere und zugänglichere Wissenschaft zu betreiben.
In diesem Beitrag zeige ich Ihnen ein wenig von der ursprünglichen Forschung von Jelena Sterlin und Kollegen. Sie ist Doktorandin an der Fakultät für Landwirtschaft, Ernährung und Umwelt an der Hebräischen Universität Jerusalem.
Ihr neues Papier Optimierte Small-Molecule Pull-Downs definieren MLBP1 als Acyl-Lipid-bindendes Protein beleuchtet die Wechselwirkungen zwischen Proteinen und Metaboliten in Pflanzen, wobei sie sich auf die Abscisinsäure (ABA)-Rezeptoren konzentriert. Sie ist auch eine Abonnentin von "Mind the Graph" und hat daher eine Infografik in Beachten Sie die Grafik um ihre Methodik zu erläutern.
Die Bedeutung der mit der START-Domäne verbundenen Proteine
Nach Angaben von Natur-MagazinAbscisinsäure (ABA) ist das wichtigste Phytohormon, das an der Reaktion auf abiotischen Stress und an dessen Anpassung beteiligt ist. Außerdem ist sie ein Kandidat für den Einsatz als Agrarchemikalie. ABA wurde erstmals in den 1960er Jahren entdeckt. Seitdem hat sich herausgestellt, dass es ein wichtiger Regulator für so unterschiedliche Prozesse wie Keimruhe, Keimung, Samenentwicklung und Reaktionen auf biotischen und abiotischen Stress ist.
Die frühesten Ereignisse des ABA-Signalwegs beinhalten die Bindung von ABA an PYR/PYL/RCARs-Rezeptoren. Die Rezeptoren gehören zur Superfamilie der START-Domänen.
Die START-Proteindomänen sind eine lipidbindende Domäne, die in Genomen von Bakterien, Protisten, Hefen, Pflanzen und Tieren vorkommt. In Pflanzen sind sie jedoch häufiger zu finden. Nach Angaben von SchrickDas Vorhandensein von START-Domänen in evolutionär weit entfernten Arten wie Tieren und Pflanzen lässt auf einen konservierten Mechanismus für die Interaktion von Proteinen mit Lipiden/Sterolen schließen.
Das Papier, das in Das Pflanzenjournal konzentriert sich auf PYR/PYL/RCARs ABA-Rezeptoren. Die Forscher beschlossen, eine Methode zu optimieren, die die Identifizierung von Liganden der START-Domäne und mit der START-Domäne verwandter Proteine in Pflanzen ermöglicht, da "Die Liganden der START-Domänenproteine sind für das ordnungsgemäße Funktionieren ihrer Proteine sowohl bei Tieren als auch bei Pflanzen unverzichtbar, und es wurde nachgewiesen, dass START-Domänenproteine bei Pflanzen an wesentlichen physiologischen Prozessen beteiligt sind".
Eine visuelle Zusammenfassung der Methodik
Um ihre Methodik zu erläutern, haben die Wissenschaftler eine Infografik mit anschaulichen Grafiken erstellt. Sie ist auffallend und leichter zu verstehen.
Die folgende Infografik zeigt den experimentellen Arbeitsablauf. Wie Sie sehen können, wurden vier START-Proteine exprimiert und gereinigt. Sie filtrierten und inkubierten den Überstand, der die native lösliche Fraktion enthielt, mit Streptavidin-Sepharose, einem Affinitätsharz für zuverlässige und hohe
Die Autoren präsentierten eine gute Technik für die anfängliche Erforschung von Proteinliganden in Pflanzen. Sie haben den Ansatz angepasst, um START-Liganden zu entdecken. Die Methode kann jedoch durch Anpassung der Analysebedingungen auf Liganden anderer chemischer Natur übertragen werden.
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