Μια οπτική αφηρημένη εικόνα δεν είναι εύκολο να δημιουργηθεί, αλλά ήρθε για να μείνει. Έτσι, μας αρέσει πάντα να παρουσιάζουμε την εκπληκτική δουλειά των χρηστών μας ως ένα εμπνευσμένο παράδειγμα οπτικής αφαίρεσης. Θέλουμε να δώσουμε τη δυνατότητα στους επιστήμονες να ενεργοποιήσουν μια πιο οπτική και προσιτή επιστήμη.

Στην ανάρτηση, θα σας δείξω λίγη από την αρχική έρευνα του Yelena Sterlin και τους συναδέλφους του. Είναι διδακτορική φοιτήτρια στη Σχολή Γεωργίας, Τροφίμων και Περιβάλλοντος του Εβραϊκού Πανεπιστημίου της Ιερουσαλήμ.

Το νέο της έγγραφο Βελτιστοποιημένα Pull-Downs μικρών μορίων καθορίζουν την MLBP1 ως πρωτεΐνη δέσμευσης ακυλο-λιπιδίων ρίχνει φως στις αλληλεπιδράσεις πρωτεϊνών-μεταβολιτών στα φυτά, με έμφαση στους υποδοχείς του αψισικού οξέος (ABA). Είναι επίσης συνδρομητής του mind the graph, οπότε δημιούργησε ένα infographic στο προσέξτε το γράφημα να εξηγήσουν τη μεθοδολογία τους.

Η σημασία των πρωτεϊνών που σχετίζονται με τον τομέα START

 

Σύμφωνα με Περιοδικό Φύση, το αψισικό οξύ (ΑΒΑ) είναι η κύρια φυτοορμόνη που εμπλέκεται στην απόκριση στο αβιοτικό στρες και στην προσαρμογή του. Επίσης, είναι ένα υποψήφιο γεωργικό χημικό προϊόν. Το ΑΒΑ ανακαλύφθηκε για πρώτη φορά τη δεκαετία του 1960. Έκτοτε, διαπιστώθηκε ότι αποτελεί βασικό ρυθμιστή τόσο διαφορετικών διεργασιών όπως ο λήθαργος, η βλάστηση, η ανάπτυξη των σπόρων και οι αποκρίσεις σε βιοτικό και αβιοτικό στρες.

Τα πρώτα γεγονότα που αφορούν το μονοπάτι σηματοδότησης του ΑΒΑ περιλαμβάνουν τη σύνδεση του ΑΒΑ με τους υποδοχείς PYR/PYL/RCARs. Οι υποδοχείς αυτοί ανήκουν στην υπεροικογένεια των δομών START.

Οι πρωτεϊνικές περιοχές START είναι μια περιοχή δέσμευσης λιπιδίων που υπάρχει στα γονιδιώματα βακτηρίων, πρωτίστων, ζυμομυκήτων, φυτών και ζώων. Ωστόσο, είναι πιο συχνές στα φυτά. Σύμφωνα με Schrick, η παρουσία περιοχών START σε εξελικτικά απομακρυσμένα είδη όπως τα ζώα και τα φυτά υποδηλώνει έναν διατηρημένο μηχανισμό αλληλεπίδρασης των πρωτεϊνών με λιπίδια/στερόλες.

Το έγγραφο που δημοσιεύθηκε στο Το περιοδικό Plant Journal επικεντρώνεται στους υποδοχείς PYR/PYL/RCARs ABA. Οι ερευνητές αποφάσισαν να βελτιστοποιήσουν μια μέθοδο που να επιτρέπει την ταυτοποίηση των συνδέσμων της περιοχής START και των πρωτεϊνών που σχετίζονται με την περιοχή START στα φυτά, επειδή "οι συνδέτες των πρωτεϊνών του τομέα START είναι απαραίτητοι για τη σωστή λειτουργία της πρωτεΐνης τους τόσο στα ζώα όσο και στα φυτά, και οι φυτικές πρωτεΐνες του τομέα START αποδείχθηκε ότι εμπλέκονται σε βασικές φυσιολογικές διεργασίες".

Μια οπτική περίληψη της μεθοδολογίας

 

Για να εξηγήσουν τη μεθοδολογία τους, οι επιστήμονες δημιούργησαν ένα infographic με απεικονίσεις γραφικών παραστάσεων. Είναι εντυπωσιακό και πιο κατανοητό. 

 

Το παρακάτω infographic δείχνει την πειραματική ροή εργασίας. Όπως μπορείτε να δείτε, εκφράστηκαν και καθαρίστηκαν τέσσερις πρωτεΐνες START. Διήθυναν και επώασαν το υπερκείμενο που περιείχε το εγγενές διαλυτό κλάσμα χρησιμοποιώντας σεφαρόζη στρεπταβιδίνης, μια ρητίνη συγγένειας για αξιόπιστες και υψηλές-επιλυτικός καθαρισμός βιομορίων. Στη συνέχεια, ανέλυσαν τα aliquots χρησιμοποιώντας western blot. Για να ταυτοποιήσουν το ligand, εκλούστηκαν υποθετικοί ligands και υποβλήθηκαν σε ανάλυση συστήματος LC -MS (υγρή χρωματογραφία και φασματομετρία μάζας). Οι μοριακές δομές των υποθετικών συνδέσμων ενδιαφέροντος προσδιορίστηκαν με φασματομετρία μάζας tandem.

 

οπτική περίληψη από την yelena sterlin

Οι συγγραφείς παρουσίασαν μια καλή τεχνική για την αρχική ανίχνευση των πρωτεϊνικών συνδέσμων στα φυτά. Προσάρμοσαν την προσέγγιση για την ανακάλυψη συνδέσμων START. Ωστόσο, μπορείτε να υιοθετήσετε τη μέθοδο σε ligands διαφορετικής χημικής φύσης με προσαρμογή των αναλυτικών συνθηκών.

Αν θέλετε να παρουσιάσετε την έρευνά σας χρησιμοποιώντας επιστημονικές εικόνες και οπτικές περιλήψεις, μπορείτε επίσης να χρησιμοποιήσετε το Mind the Graph. Είστε λοιπόν έτοιμοι να βελτιώσετε την επικοινωνία σας στην επιστήμη;

preview_250

logo-subscribe

Εγγραφείτε στο ενημερωτικό μας δελτίο

Αποκλειστικό περιεχόμενο υψηλής ποιότητας σχετικά με την αποτελεσματική οπτική
επικοινωνία στην επιστήμη.

- Αποκλειστικός οδηγός
- Συμβουλές σχεδιασμού
- Επιστημονικά νέα και τάσεις
- Σεμινάρια και πρότυπα