Un visual abstract non è facile da creare, ma è qui per restare. Per questo ci piace sempre mostrare il lavoro straordinario dei nostri utenti come esempio ispiratore di visual abstract. Vogliamo dare agli scienziati la possibilità di creare una scienza più visiva e accessibile.

Nel post, vi mostrerò un po' della ricerca originale di Yelena Sterlin e colleghi. È dottoranda presso la Facoltà di Agricoltura, Alimentazione e Ambiente dell'Università Ebraica di Gerusalemme.

Il suo nuovo lavoro L'ottimizzazione dei pull-down di piccole molecole definisce MLBP1 come proteina legante gli acil-lipidi fa luce sulle interazioni tra proteine e metaboliti nelle piante, con particolare attenzione ai recettori dell'acido abscisico (ABA). È anche abbonata a mind the graph, per cui ha creato un'infografica in attenzione al grafico per spiegare la loro metodologia.

L'importanza delle proteine legate al dominio START

 

Secondo Rivista NatureL'acido abscisico (ABA) è il principale fitormone coinvolto nella risposta agli stress abiotici e nel loro adattamento. Inoltre, è un candidato agrofarmaco. L'ABA è stato scoperto per la prima volta negli anni Sessanta. Da allora si è scoperto che è un regolatore chiave di diversi processi come la dormienza, la germinazione, lo sviluppo dei semi e la risposta agli stress biotici e abiotici.

I primi eventi che coinvolgono la via di segnalazione dell'ABA comportano il legame dell'ABA con i recettori PYR/PYL/RCARs. Questi recettori appartengono alla superfamiglia dei domini START.

I domini della proteina START sono domini che legano i lipidi, presenti nei genomi di batteri, protisti, lieviti, piante e animali. Tuttavia, sono più comuni nelle piante. Secondo SchrickLa presenza di domini START in specie evolutivamente distanti come gli animali e le piante suggerisce un meccanismo conservato di interazione delle proteine con i lipidi/steroli.

Il documento pubblicato in Il giornale delle piante si concentra sui recettori ABA PYR/PYL/RCARs. I ricercatori hanno deciso di ottimizzare un metodo che permettesse l'identificazione dei ligandi del dominio START e delle proteine correlate al dominio START nelle piante, poiché "I ligandi delle proteine del dominio START sono indispensabili per il corretto funzionamento della loro proteina sia negli animali che nelle piante, e le proteine del dominio START delle piante hanno dimostrato di essere implicate in processi fisiologici essenziali".

Un abstract visivo della metodologia

 

Per spiegare la loro metodologia, gli scienziati hanno creato un'infografica con illustrazioni di grafici. È accattivante e più facile da capire. 

 

L'infografica sottostante mostra il flusso di lavoro sperimentale. Come si può vedere, hanno espresso e purificato quattro proteine START. Hanno filtrato e incubato il surnatante contenente la frazione solubile nativa con streptavidina sepharose, una resina di affinità per un'analisi affidabile e di alto livello.-purificazione a risoluzione di biomolecole. Quindi, hanno analizzato le aliquote utilizzando il western blot. Per identificare il ligando, hanno eluito i ligandi putativi e li hanno sottoposti all'analisi del sistema LC -MS (cromatografia liquida e spettrometria di massa). Le strutture molecolari dei ligandi putativi di interesse sono state determinate mediante spettrometria di massa tandem.

 

astratto visivo di yelena sterlin

Gli autori hanno presentato una buona tecnica per la ricerca iniziale di ligandi proteici nelle piante. Hanno adattato l'approccio per scoprire ligandi START. Tuttavia, è possibile adottare il metodo per ligandi di natura chimica diversa, adattando le condizioni analitiche.

Se volete mostrare la vostra ricerca utilizzando illustrazioni scientifiche e abstract visivi, potete usare anche Mind the Graph. Allora, siete pronti a migliorare la vostra comunicazione scientifica?

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