A visual abstract is not easy to create, but’s here to stay. So we always love to show off our users’ amazing work as an inspiring example of visual abstract. We want to empower scientists to enable a more more visual and reachable science.

I innlegget vil jeg vise deg litt av den opprinnelige forskningen av Jelena Sterlin og kolleger. Hun er doktorgradsstudent ved fakultetet for landbruk, mat og miljø ved Hebrew University of Jerusalem.

Hennes nye artikkel Optimaliserte småmolekylære pull-downs definerer MLBP1 som et acyllipidbindende protein brings light to the protein-metabolite interactions in plants, with focus on the abscisic acid (ABA) receptors. She is also a mind the graph subscriber, so she created a infographic in ta hensyn til grafen to explain their methodology.

Betydningen av START-domenerelaterte proteiner

 

Ifølge NaturmagasinetAbscisinsyre (ABA) er det viktigste plantehormonet som er involvert i abiotisk stressrespons og tilpasning. Det er også en kandidat til å bli et agrikjemikalie. ABA ble først oppdaget på 1960-tallet. Siden den gang har det vist seg å være en viktig regulator for så forskjellige prosesser som hvilemodus, spiring, frøutvikling og respons på biotisk og abiotisk stress.

De tidligste hendelsene i ABA-signalveien involverer ABA-binding til PYR/PYL/RCAR-reseptorer. Reseptorene tilhører START-domene-superfamilien.

The START protein domains are a lipid-binding domain present in genomes of bacteria, protists, yeast, plants and animals. However, they are more common in plants. According to SchrickTilstedeværelsen av START-domener i evolusjonært fjerne arter som dyr og planter tyder på at det finnes en konservert mekanisme for interaksjon mellom proteiner og lipider/steroler.

Artikkelen ble publisert i Plantejournalen fokuserer på PYR/PYL/RCARs ABA-reseptorer. Forskerne bestemte seg for å optimalisere en metode som gjør det mulig å identifisere START-domene og START-domene-relaterte proteinligander i planter. "START-domeneproteinligandene er uunnværlige for at proteinet skal fungere som det skal, både hos dyr og planter, og det ble påvist at START-domeneproteiner fra planter er involvert i viktige fysiologiske prosesser."

Et visuelt sammendrag av metoden

 

For å forklare metoden har forskerne laget en infografikk med grafiske illustrasjoner. Den er iøynefallende og lettere å forstå. 

 

Infografikken nedenfor viser den eksperimentelle arbeidsflyten. Som du kan se, har de uttrykt og renset fire START-proteiner. De filtrerte og inkuberte supernatanten som inneholdt den native, løselige fraksjonen, med streptavidin-sefarose, en affinitetsresin som gir pålitelig og høy oppløselighet.-oppløselig rensing av biomolekyler. Deretter analyserte de alikvoter ved hjelp av western blot. For å identifisere liganden eluerte de antatte ligander og analyserte dem med LC-MS-system (væskekromatografi og massespektrometri). De molekylære strukturene til de antatte ligandene av interesse ble bestemt ved hjelp av tandem-massespektrometri.

 

visuelt abstrakt av yelena sterlin

The authors presented a good technique for initial probing of protein ligands in plants. They adjusted the approach to discover START ligands. However, you can adopt the method to ligands of different chemical nature by adjustment of analytical conditions.

If you want to show your research using scientific illustrations and visual abstracts, you can use Mind the Graph as well. So, are you ready to improve your communication in science?

forhåndsvisning_250

Relaterte artikler
logo-abonnement

Abonner på nyhetsbrevet vårt

Eksklusivt innhold av høy kvalitet om effektiv visuell
kommunikasjon innen vitenskap.

- Eksklusiv guide
- Tips om design
- Vitenskapelige nyheter og trender
- Veiledninger og maler