Mind the Graph un 3D proteīnu attēlveidošana

Vai esat mēģinājis izveidot molekulāro ilustrāciju ar klasiskajiem molekulārajiem skatītājiem? Ja atbilde ir "jā", tad jūs jau zināt, cik grūti tas ir.

Jums ir jāatrod bezmaksas versija, kas nesabojā datoru, un jāpavada stundas, mēģinot noskaidrot, kā tā darbojas, iespējams, izmantojot programmēšanu. Cīņa ar programmām, kas ir sarežģītas, neintuitīvas un bieži vien prasa licenci.

Risinājums ir, un to sauc par Proteīnu attēlveidotājs!

Efektīvu zinātnisko figūru izveide dažu minūšu laikā

Par Protein Imager

Proteīnu attēlveidotājs ir bezmaksas tīmekļa molekulāro attēlu pārlūks, kas ar dažiem klikšķiem ļauj izveidot molekulārās ilustrācijas. To izstrādājuši zinātnieki no 3D proteīnu attēlveidošanas studija ar mērķi racionalizēt proteīnu ilustrāciju.

Kāpēc Protein Imager?

Protein Imager atšķiras no citiem molekulārajiem meklētājiem ar savu vienkāršību un pieejamību. Lai piekļūtu visām Protein Imager funkcijām, jums tikai jāpiesakās, izmantojot savu e-pastu un interneta savienojumu.

Protein Imager ir lietotājam draudzīgs interfeiss, kas ļauj pielāgot molekulāro ilustrāciju ar visām detaļām. Lietotājs var izvēlēties no dažādiem iepriekš iestatītiem stiliem (karikatūrisks, reālistisks, rupjgraudaina virsma) vai pielāgot vizualizāciju pēc saviem ieskatiem.

Iepriekš iestatīto stilu piemēri, ko var izmantot Protein Imager.

Molekulu attēli (virsmas, karikatūra, sfēras, nūjiņas utt.), krāsošanas režīmi, fona krāsas, ēnojums un apkārtējās vides oklūzija ir tikai daži no pielāgojamiem parametriem, ar kuriem lietotāji var spēlēties.

Ekspertiem ir pieejami arī tādi datu analīzes rīki kā struktūru superpozīcija, sekvenču skatītājs un atlases.

Turklāt tas ir pilnībā pieejams tiešsaistē, kas nozīmē, ka nav nepieciešama lokāla instalēšana, nav jāstrādā ar novecojušām versijām un nav jāsaskaras ar savietojamības problēmām ar operētājsistēmām. Katra atveidošana ir atkarīga no īpaša servera, un atveidošanas laiks parasti ir mazāks par 1 minūti atkarībā no ilustrācijas sarežģītības.

Sāciet veidot Mind the Graph jau tagad

Kas izmanto Protein Imager?

Protein Imager ir tik vienkāršs un intuitīvs, ka to var izmantot ikviens, sākot no bakalaura līdz pat pieredzējušiem zinātniekiem. Lietotāji var brīvi izpaust savu radošumu un veidot zinātniskas ilustrācijas dažādiem mērķiem.

Daudzi zinātnieki izmanto Protein Imager, lai ilustrētu savus pētījumu rezultātus savos darbos vai grafiskos kopsavilkumos.

Proteīnu attēlveidotājs, ko izmanto zinātnieks Matteo Oliverio lai izveidotu grafiskus abstraktus.

Radošākie no viņiem izstrādā žurnālu vākus, izmantojot programmu Protein Imager. Tie, kas aizraujas ar zinātnes komunikāciju, izmanto Protein Imager, lai radītu pievilcīgus vizuālus sociālo mediju ziņām.

Oksfordas Universitātes profesore Syma Khalid izstrādāja dizainu žurnāla "Structure" 29. sējuma 5. numura 2021. gada maija vākam..

Visbeidzot, Protein Imager ir iespēja eksportēt molekulas kā tilpuma failus (VRML2 formātā), ko izmanto medicīnas ilustratori 3D grafikas programmās, piemēram, Blender, Cinema 4D, Maya.

Attēls no BioSciVisuals zinātniskās ilustrācijas studijas portfolio. Lai ilustrētu galīgajā plakāta grafikā iekļautās molekulas, līdztekus profesionāliem ilustrēšanas rīkiem tika izmantots Protein Imager.

Vai esat gatavs sākt strādāt ar Mind the Graph?

Ilustrāciju uzsākšana

Apskatīsim galvenos soļus, lai sāktu savu ilustrēšanas ceļojumu, vai ne?

1 - ielādējiet molekulāro struktūru

Iet uz Proteīnu attēlveidotājs un augšupielādēt jebkuru molekulāro struktūru no sava datora vai iegūt to no bioloģiskajām datubāzēm, piemēram, Proteīnu datu bankas vai datubāzes Orientations of Proteins in Membranes (OPM).

2 - Pielāgošana

Izmantojot struktūras paneli labajā pusē, izvēlieties molekulāro attēlojumu un krāsu shēmas, vizualizācijas paneļos pielāgojiet ēnojumu, apgaismojumu, apkārtējās vides oklūziju, vienkārši izvēlieties iepriekš iestatītu stilu.

3 - Iegūstiet attēlu

Kad esat apmierināts ar konstrukcijas izskatu, pieprasiet tās atveidi.

Pēc dažām minūtēm no renderēšanas paneļa varēsiet lejupielādēt ilustrāciju augstā kvalitātē. Ņemiet vērā, ka, lai pieprasītu renderēšanu, jums jāreģistrējas, norādot derīgu e-pasta adresi.

4 - Kopīgojiet to ar saviem sadarbības partneriem

Kad esat apmierināts ar savu darbu, varat to saglabāt lietotāja mapē, kurā var saglabāt līdz 25 MB. Katram projektam varat izveidot saiti, lai to varētu kopīgot ar sadarbības partneriem un visi būtu vienkopus.

Sāciet lietot Mind The Graph tieši tagad bez maksas!

Mind the Graph un 3D proteīnu attēlveidošana

Protams, 3D Protein Imaging un Mind the Graph veido vislabāko partnerību!

Varat izmantot savu 3D olbaltumvielas attēlu un pēc sekundes to augšupielādēt savā radījumā vietnē Mind the Graph. Lai uzzinātu, kā augšupielādēt attēlus, varat noskatīties mācību videoklipu. tieši šeit.

Vai arī dodieties uz savu Mind the Graph izveidi, noklikšķiniet uz Vairāk kreisās izvēlnes apakšā, pēc tam Augšupielādēt, izvēlieties attēlu un pēc ielādes izvēlieties un velciet attēlu uz darbvietu, un viss!

Turklāt varat izvēlēties jebkuru Mind the Graph galerijā pieejamo ilustrāciju, lai to izmantotu kopā ar saviem proteīnu attēliem.

Mind the Graph galerijā ir daudz vizuāli pievilcīgu skaitļu jūsu pētījumiem - vairāk nekā 40 000 zinātniski precīzu ilustrāciju vairāk nekā 80 populārās jomās. Ja jums nepieciešama ilustrācija, jūs to atradīsiet Mind the Graph.

Tomēr, ja neesat atradis to, kas jums nepieciešams, vai ja jums nepieciešama ļoti specifiska ilustrācija, varat pieprasīt personalizētu ilustrāciju, un Mind the Graph ilustrāciju komanda to izstrādās jūsu vietā. Viss, kas jums jādara, ir jāaizpilda Mind the Graph Pieprasīt ikonu veidlapas iekšpusē savā darbvietā, pievienojot īsu paskaidrojumu un atsauces attēlu. Nedēļas laikā jūs saņemsiet personalizētu ilustrāciju.

Apbrīnojami, vai ne?

Skatiet videoklipu par to, kā varat izveidot savu zinātnisko figūru, izmantojot Mind the Graph un izmantojot ārējos attēlus no 3D proteīnu attēlveidošanas.