Kas olete kunagi proovinud luua molekulaarillustratsiooni klassikaliste molekulaarvaatajatega? Kui vastus on jaatav, siis teate juba, millega tuleb võidelda. 

Sa pead leidma tasuta versiooni, mis ei lammuta su arvutit, ja kulutama tunde, et aru saada, kuidas see töötab, ja võib-olla on vaja natuke kodeerida. Võidelda programmidega, mis on keerulised, ebatsensuursed ja nõuavad sageli litsentsi.

On olemas lahendus, seda nimetatakse Valgu Imager!

Protein Imager'i kohta

Valgu Imager on tasuta veebipõhine molekulaarvaatleja, millega saab paari klikiga luua molekulaarseid illustratsioone. Selle on välja töötanud teadlased 3D valgu kujutamise stuudio eesmärgiga ühtlustada valkude illustreerimist.

Miks Protein Imager?

Protein Imager erineb teistest molekulaarvaatlustest selle lihtsuse ja ligipääsetavuse poolest. Kõikide Protein Imager'i funktsioonide kasutamiseks on vaja ainult oma e-posti ja internetiühenduse abil sisse logida.

Protein Imageril on kasutajasõbralik kasutajaliides, mis võimaldab molekulaarillustratsiooni iga detaili kohandamist. Kasutaja saab valida erinevate eelseadistatud stiilide vahel (karikatuurne, realistlik, jämedateraline pind) või kohandada visualiseerimist oma äranägemise järgi.

Näiteid eelseadistatud stiilidest, mida saab kasutada Protein Imageris.

Molekulide kujutised (pind, karikatuur, kerad, pulgad jne), värvimisrežiimid, taustavärvid, varjutamine ja ümbritseva keskkonna oklusioon on vaid mõned häälestatavad parameetrid, millega kasutajad saavad mängida.

Ekspertidele on kättesaadavad ka sellised andmeanalüüsi vahendid nagu struktuuride ülesseadmine, järjestuse vaatamine ja valikud.

Lisaks on see täielikult veebipõhine, mis tähendab, et ei ole vaja kohalikku paigaldust, ei ole vaja tegeleda vananenud versioonidega ega ühilduvusprobleeme teie operatsioonisüsteemidega. Iga renderdamine tugineb spetsiaalsele serverile ja renderdamise aeg on tavaliselt alla 1 minuti, sõltuvalt illustratsiooni keerukusest.

Kes kasutab Protein Imager'i?

Protein Imager on nii lihtne ja intuitiivne, et sellest saavad kasu kõik, alates üliõpilastest kuni kogenud teadlasteni. Kasutajad saavad vabalt kasutada oma loovust ja luua teaduslikke illustratsioone erinevatel eesmärkidel. 

Paljud teadlased võtsid Protein Imager'i kasutusele, et illustreerida oma uurimistulemusi oma töödes või graafilistes kokkuvõtetes. 

Protein Imager, mida kasutab teadlane Matteo Oliverio graafiliste kokkuvõtete loomiseks.

Loovamad kujundavad ajakirjade kaaned Protein Imageriga. Teaduskommunikatsiooniga kirglikult tegelejad kasutavad Protein Imagerit, et kujundada oma sotsiaalmeediapostituste jaoks pilkupüüdvaid visuaalseid kujundusi.

Professor Syma Khalid Oxfordi Ülikoolist koostas ajakirja Structure, 29. köide, 5. number, mai 2021 kaane kujunduse..

Lõpuks on Protein Imageril võimalus eksportida molekule mahufailidena (VRML2-vormingus), mida kasutavad meditsiinilised illustraatorid 3D-graafikaprogrammides, nagu Blender, Cinema 4D, Maya.

Portfoolio pilt BioSciVisuals teadusliku illustratsiooni stuudio portfooliost. Protein Imager'i kasutati molekulide illustreerimiseks, mis sisalduvad lõplikus plakatigraafikas koos professionaalsete illustreerimisvahenditega.

Käivitage oma illustratsioonid

Vaatame üle põhilised sammud, et alustada oma illustratsiooniteekonda.

1 - Molekulaarstruktuuri laadimine

Mine edasi Valgu Imager ja laadida üles mis tahes molekulaarstruktuuri oma arvutist või otsida seda bioloogilistest andmebaasidest, nagu Protein Data Bank või OPM (Orientations of Proteins in Membranes) andmebaas.

2 - Kohandamine

Paremal asuva struktuuri paneeli kaudu valige molekulaarsed kujutised ja värviskeemid, visualiseerimispaneelide kaudu häälestage varjud, tuled, ümbritsev oklusioon, valige lihtsalt eelseadistatud stiil.

3 - Hangi pilt

Kui olete oma konstruktsiooni välimusega rahul, küsige renderdamist.

Mõne minuti pärast saate illustratsiooni kvaliteetselt alla laadida renderduspaneelilt. Pange tähele, et renderduse taotlemiseks peate registreeruma kehtiva e-posti aadressiga.

4 - Jaga seda oma koostööpartneritega

Kui olete oma tööga rahul, saate selle salvestada kasutaja kausta, mis salvestab kuni 25 MB. Saate iga projekti kohta lingi, mida saate jagada kaastöötajatega, nii et kõik on ühel ja samal lehel.

Mind the Graph ja 3D-valgu kujutamine

Loomulikult moodustavad 3D Protein Imaging ja Mind the Graph parima partnerluse üldse! 

Saate kasutada oma 3D-valgu kujutist ja laadida selle oma loomingusse Mind the Graph-sse üles sekundiga. Piltide üleslaadimise õppimiseks saate vaadata õppevideot siinsamas

Või minge oma Mind the Graph loomisele, klõpsake nupule Rohkem vasakpoolse menüü allosas, seejärel Laadige üles, valige oma pilt, ja pärast laadimist valige ja lohistage pilt oma tööruumi, ja valmis! 

Lisaks saate valida Mind the Graph galeriis saadaval oleva illustratsiooni, mida saate kasutada koos oma valkude piltidega. 

Mind the Graph galeriis on palju visuaalselt atraktiivseid arvandmeid teie uurimistööde jaoks. 40 000+ teaduslikult täpset illustratsiooni 80+ populaarse valdkonna kohta. Kui vajate illustratsiooni, leiate selle Mind the Graph-st. 

Kui te siiski ei leidnud seda, mida vajate, või kui vajate väga spetsiifilist illustratsiooni, võite taotleda isikupärastatud illustratsiooni ja Mind the Graph illustratsioonimeeskond kujundab selle teie jaoks. Kõik, mida peate tegema, on täita Mind the Graph Ikooni taotlemine vorm, mis asub teie tööruumis, koos lühikese selgituse ja võrdluspildiga. Nädala jooksul saate oma isikupärastatud illustratsiooni. 

Hämmastav, eks ole? 

Vaadake videot selle kohta, kuidas saate luua oma teadusliku joonise Mind the Graph abil ja kasutada väliseid pilte 3D Protein Imaging'ist.

See artikkel on kirjutatud koostöös Martina Maritaniga., kommunikatsioonijuht aadressil 3D valkude kujutamine.

logo-subscribe

Tellige meie uudiskiri

Eksklusiivne kvaliteetne sisu tõhusa visuaalse
teabevahetus teaduses.

- Eksklusiivne juhend
- Disaini näpunäited
- Teaduslikud uudised ja suundumused
- Juhendid ja mallid