Mind the Graph és 3D fehérje képalkotás

Próbáltál már molekuláris illusztrációt készíteni klasszikus molekuláris nézőkkel? Ha a válasz igen, akkor már ismeri a küzdelmet.

Találnia kell egy ingyenes verziót, amely nem üti össze a számítógépét, és órákat kell eltöltenie azzal, hogy kitalálja, hogyan működik, esetleg némi kódolással. Küzdj olyan programokkal, amelyek bonyolultak, nem intuitívak, és gyakran licencet igényelnek.

Van megoldás, a neve Protein Imager!

Hatékony tudományos ábrák létrehozása percek alatt

A Protein Imagerről

Protein Imager egy ingyenes, webes molekuláris nézegető program, amellyel néhány kattintással molekuláris illusztrációkat készíthet. A tudósok fejlesztették ki a 3D fehérje képalkotó stúdió a fehérjeillusztráció racionalizálásának céljával.

Miért Protein Imager?

Ami a Protein Imager-t megkülönbözteti a többi molekuláris nézőtől, az az egyszerűsége és hozzáférhetősége. A Protein Imager összes funkciójának eléréséhez csak be kell jelentkeznie az e-mail címével és egy internetkapcsolattal.

A Protein Imager felhasználóbarát felülettel rendelkezik, amely lehetővé teszi a molekuláris illusztráció minden részletében történő testreszabását. A felhasználó választhat a különböző előre beállított stílusok közül (rajzfilmes, realisztikus, durva szemcsés felület), vagy tetszése szerint testre szabhatja a vizualizációt.

Példák a Protein Imagerben használható előre beállított stílusokra.

A molekuláris ábrázolások (felület, rajzfilm, gömbök, pálcikák stb.), színezési módok, háttérszínek, árnyékolás és környezeti okklúzió csak néhány a hangolható paraméterek közül, amelyekkel a felhasználók játszhatnak.

Az adatelemző eszközök, mint például a struktúra szuperpozíció, a szekvencia megtekintő és a szelekciók a szakértők számára is rendelkezésre állnak.

Ráadásul teljesen online, ami azt jelenti, hogy nincs helyi telepítés, nincs gond az elavult verziókkal vagy az operációs rendszerekkel való kompatibilitási problémákkal. Minden renderelés egy dedikált szerverre támaszkodik, és a renderelési idő jellemzően kevesebb mint 1 perc, az illusztráció összetettségétől függően.

Kezdjen alkotni az Mind the Graph-nél most

Ki használja a Protein Imager-t?

A Protein Imager az egyetemistáktól a tapasztalt tudósokig olyan egyszerű és intuitív, hogy mindenki hasznát veheti. A felhasználók szabadon engedhetik szabadjára kreativitásukat, és különböző célokra tudományos illusztrációkat készíthetnek.

Számos tudós alkalmazta a Protein Imager-t, hogy kutatási eredményeit szemléltesse a tanulmányaiban vagy grafikus összefoglalóiban.

A Protein Imager által használt tudós Matteo Oliverio grafikus absztraktok létrehozásához.

A kreatívabbak Protein Imagerrel terveznek naplóborítókat. A tudományos kommunikáció iránt szenvedélyesen érdeklődők a Protein Imager segítségével szemet gyönyörködtető vizuális anyagokat terveznek közösségi médiás bejegyzéseikhez.

Syma Khalid professzor az Oxfordi Egyetemről a Structure folyóirat 2021. májusi, 29. kötet, 5. számának borítótervét készítette..

Végül, a Protein Imager lehetőséget biztosít a molekulák térfogati fájlokként (VRML2 formátum) történő exportálására, amelyet az orvosi illusztrátorok használnak olyan 3D-s grafikai programokban, mint a Blender, Cinema 4D, Maya.

Kép a BioSciVisuals tudományos illusztrációs stúdió portfóliójából. A Protein Imager-t a professzionális illusztrációs eszközök mellett a végleges poszter grafikában szereplő molekulák illusztrálására is használták.

Készen áll az Mind the Graph-nél való munkakezdésre?

Indítsa el az illusztrációkat

Vegyük át az alapvető lépéseket, hogy elkezdhessük az illusztrációs utazást, rendben?

1 - A molekulaszerkezet betöltése

Menjen a Protein Imager és töltsön fel bármilyen molekulaszerkezetet a számítógépéről, vagy töltse le biológiai adatbázisokból, például a Protein Data Bankból vagy az OPM (Orientations of Proteins in Membranes) adatbázisból.

2 - Testreszabás

A jobb oldali struktúra panelen keresztül válassza ki a molekuláris ábrázolást és a színsémákat, a vizualizációs panelen keresztül pedig hangolja az árnyékolást, a fényeket, a környezeti elfedést, csak válasszon egy előre beállított stílust.

3 - Szerezd meg a képet

Ha elégedett a szerkezet megjelenésével, kérje a renderelést.

Néhány perc múlva az illusztrációt jó minőségben letöltheti a renderelési panelről. Ne feledje, hogy a renderelés igényléséhez érvényes e-mail címmel kell regisztrálnia.

4 - Ossza meg munkatársaival

Ha elégedett a munkájával, elmentheti azt a felhasználói mappába, amely legfeljebb 25 MB-ot tárol. Minden projekthez kaphatsz egy linket, amelyet megoszthatsz a munkatársakkal, így mindenki egy oldalon áll.

Kezdje el használni a Mind The Graph-ot most ingyen!

Mind the Graph és 3D fehérje képalkotás

Természetesen a 3D Protein Imaging és az Mind the Graph a valaha volt legjobb partnerséget alkotja!

A 3D-s fehérje képét használhatja, és egy másodperc alatt feltöltheti az Mind the Graph-ben található alkotásába. A képek feltöltésének megtanulásához megnézhet egy oktatóvideót itt.

Vagy menjen az Mind the Graph létrehozásához, kattintson a További a bal oldali menü alján, majd Feltöltés, válassza ki a képet, majd miután betöltődött, válassza ki és húzza a képet a munkaterületre, és kész!

Továbbá, bármelyik, az Mind the Graph Galériában elérhető illusztrációt kiválaszthatja, hogy a fehérjék képeivel együtt használja.

Az Mind the Graph Galéria számos vizuálisan vonzó ábrát tartalmaz az Ön kutatásaihoz, több mint 40 000 tudományosan pontos illusztrációval több mint 80 népszerű területen. Ha szüksége van egy illusztrációra, az Mind the Graph-nél megtalálhatja.

Ha mégsem találta meg, amire szüksége van, vagy ha nagyon különleges illusztrációra van szüksége, kérhet személyre szabott illusztrációt, és az Mind the Graph illusztrációs csapata megtervezi Önnek. Mindössze annyit kell tennie, hogy kitölti az Mind the Graph Ikon kérése űrlapot a munkaterületen belül, egy rövid magyarázattal és egy referencia képpel. Egy héten belül megkapja a személyre szabott illusztrációt.

Csodálatos, igaz?

Nézze meg a videót arról, hogyan hozhatja létre tudományos ábráját az Mind the Graph segítségével, és hogyan használhatja a 3D Protein Imaging külső képeit.