Mind the Graph et imagerie protéique 3D

Avez-vous déjà essayé de créer une illustration moléculaire avec des visionneuses moléculaires classiques ? Si la réponse est oui, alors vous connaissez déjà la difficulté.

Vous devez trouver une version gratuite qui ne plante pas votre ordinateur et passer des heures à essayer de comprendre son fonctionnement, éventuellement en codant un peu. Se battre avec des programmes qui sont compliqués, peu intuitifs et qui nécessitent souvent une licence.

Il existe une solution, elle s'appelle Imageur de protéines!

Créez des figures scientifiques efficaces en quelques minutes

À propos de Protein Imager

Imageur de protéines est un visualiseur moléculaire gratuit basé sur le web qui permet de créer des illustrations moléculaires en quelques clics. Il a été développé par des scientifiques de l Studio d'imagerie 3D des protéines dans le but de rationaliser l'illustration des protéines.

Pourquoi Protein Imager ?

Ce qui différencie Protein Imager des autres visionneuses moléculaires est sa simplicité et son accessibilité. Il vous suffit de vous connecter avec votre email et une connexion internet pour accéder à toutes les fonctionnalités de Protein Imager.

Protein Imager possède une interface conviviale qui permet de personnaliser l'illustration moléculaire dans ses moindres détails. L'utilisateur peut choisir parmi différents styles prédéfinis (cartoony, réaliste, surface à gros grains) ou personnaliser la visualisation à sa guise.

Exemples de styles prédéfinis qui peuvent être utilisés sur Protein Imager.

Les représentations moléculaires (surface, dessin animé, sphères, bâtons, etc.), les modes de coloration, les couleurs d'arrière-plan, l'ombrage et l'occlusion ambiante ne sont que quelques-uns des paramètres réglables avec lesquels les utilisateurs peuvent jouer.

Des outils d'analyse de données comme la superposition de structures, le visualiseur de séquences et les sélections sont également disponibles pour les experts.

De plus, il est entièrement en ligne, ce qui signifie qu'il n'y a pas d'installation locale, pas de problèmes de versions obsolètes ou de compatibilité avec vos systèmes d'exploitation. Chaque rendu s'appuie sur un serveur dédié et le temps de rendu est généralement inférieur à une minute, en fonction de la complexité de l'illustration.

Commencez à créer à Mind the Graph maintenant

Qui utilise Protein Imager ?

De l'étudiant de premier cycle au scientifique chevronné, Protein Imager est si simple et intuitif que tout le monde peut en profiter. Les utilisateurs sont libres de laisser libre cours à leur créativité et de créer des illustrations scientifiques à des fins diverses.

De nombreux scientifiques ont adopté Protein Imager pour illustrer les résultats de leurs recherches sur leurs articles ou leurs résumés graphiques.

Imageur de protéines utilisé par scientifique Matteo Oliverio pour créer des abstractions graphiques.

Les plus créatifs conçoivent des couvertures de journaux avec Protein Imager. Les passionnés de communication scientifique utilisent Protein Imager pour concevoir des visuels accrocheurs pour leurs posts sur les médias sociaux.

Professeur Syma Khalid de l'Université d'Oxford a réalisé le design de la couverture de mai 2021 de la revue Structure, Volume 29, Numéro 5.

Enfin, Protein Imager a la possibilité d'exporter les molécules sous forme de fichiers volumétriques (format VRML2) utilisés par les illustrateurs médicaux dans les programmes de graphisme 3D tels que Blender, Cinema 4D, Maya.

Image tirée du portfolio du studio d'illustration scientifique BioSciVisuals. Protein Imager a été utilisé pour illustrer les molécules incluses dans le graphique final du poster, parallèlement à des outils d'illustration professionnels.

Prêt à démarrer chez Mind the Graph ?

Donnez un coup de pouce à vos illustrations

Passons en revue les étapes de base pour commencer votre voyage d'illustration, d'accord ?

1 - Chargement de la structure moléculaire

Aller à Imageur de protéines et téléchargez n'importe quelle structure moléculaire à partir de votre ordinateur ou récupérez-la dans des bases de données biologiques telles que la banque de données sur les protéines ou la base de données OPM (Orientations of Proteins in Membranes).

2 - Personnaliser

Grâce au panneau de structure sur la droite, choisissez la représentation moléculaire et les schémas de couleurs, grâce aux panneaux de visualisation, réglez l'ombrage, les lumières, l'occlusion ambiante et choisissez un style prédéfini.

3 - Obtenir l'image

Une fois que vous êtes satisfait de l'apparence de votre structure, demandez le rendu.

Dans quelques minutes, vous pourrez télécharger l'illustration en haute qualité à partir du panneau de rendu. Notez que pour demander un rendu, vous devez vous inscrire avec une adresse électronique valide.

4 - Partagez-le avec vos collaborateurs

Lorsque vous êtes satisfait de votre travail, vous pouvez l'enregistrer dans le dossier de l'utilisateur, qui peut contenir jusqu'à 25 Mo. Vous pouvez obtenir un lien pour chaque projet afin de le partager avec vos collaborateurs, de sorte que tout le monde soit sur la même longueur d'onde.

Commencez à utiliser Mind The Graph dès maintenant et gratuitement !

Imagerie protéique Mind the Graph et 3D

Bien sûr, 3D Protein Imaging et Mind the Graph forment le meilleur partenariat qui soit !

Vous pouvez utiliser votre image de protéine 3D et la télécharger dans votre création sur Mind the Graph en une seconde. Pour apprendre à télécharger des images, vous pouvez regarder un tutoriel vidéo. ici même.

Ou bien, allez dans votre création Mind the Graph, cliquez sur Plus de en bas de votre menu de gauche, puis Téléchargerchoisissez votre image, et une fois chargée, choisissez et faites glisser l'image vers votre espace de travail, et voilà !

En outre, vous pouvez choisir n'importe quelle illustration disponible dans la galerie Mind the Graph pour l'utiliser avec les images de vos protéines.

La galerie Mind the Graph propose de nombreuses figures visuellement attrayantes pour vos recherches, avec plus de 40 000 illustrations scientifiquement précises dans plus de 80 domaines populaires. Si vous avez besoin d'une illustration, vous pouvez la trouver chez Mind the Graph.

Toutefois, si vous n'avez pas trouvé ce dont vous avez besoin ou si vous avez besoin d'une illustration très spécifique, vous pouvez demander une illustration personnalisée, et l'équipe d'illustration de Mind the Graph la concevra pour vous. Tout ce que vous avez à faire est de remplir le formulaire Mind the Graph Demander une icône à l'intérieur de votre espace de travail, avec une brève explication et une image de référence. Dans une semaine, vous recevrez votre illustration personnalisée.

Incroyable, non ?

Regardez la vidéo sur la façon dont vous pouvez créer votre figure scientifique à l'aide de Mind the Graph et utiliser des images externes de 3D Protein Imaging.