Mind the Graph και τρισδιάστατη απεικόνιση πρωτεϊνών

Προσπαθήσατε ποτέ να δημιουργήσετε μια μοριακή εικονογράφηση με τα κλασικά μοριακά προγράμματα προβολής; Αν η απάντηση είναι ναι, τότε γνωρίζετε ήδη τον αγώνα.

Θα πρέπει να βρείτε μια δωρεάν έκδοση που δεν θα καταστρέψει τον υπολογιστή σας και να περάσετε ώρες προσπαθώντας να καταλάβετε πώς λειτουργεί, πιθανώς με κάποια κωδικοποίηση. Να παλέψετε με προγράμματα που είναι περίπλοκα, μη διαισθητικά και συχνά απαιτούν άδεια χρήσης.

Υπάρχει λύση, ονομάζεται Απεικονιστής πρωτεϊνών!

Δημιουργήστε αποτελεσματικά επιστημονικά στοιχεία σε λίγα λεπτά

Σχετικά με το Protein Imager

Απεικονιστής πρωτεϊνών είναι ένα δωρεάν πρόγραμμα προβολής μορίων στο διαδίκτυο για τη δημιουργία μοριακών απεικονίσεων με λίγα κλικ. Αναπτύχθηκε από επιστήμονες του 3D στούντιο απεικόνισης πρωτεϊνών με στόχο τον εξορθολογισμό της απεικόνισης των πρωτεϊνών.

Γιατί Protein Imager;

Αυτό που διαφοροποιεί το Protein Imager από άλλα προγράμματα προβολής μορίων είναι η απλότητα και η προσβασιμότητά του. Το μόνο που χρειάζεται είναι να συνδεθείτε με το email σας και μια σύνδεση στο διαδίκτυο για να έχετε πρόσβαση σε όλες τις λειτουργίες του Protein Imager.

Το Protein Imager διαθέτει ένα φιλικό προς το χρήστη περιβάλλον εργασίας που επιτρέπει την προσαρμογή της μοριακής απεικόνισης με κάθε λεπτομέρεια. Ο χρήστης μπορεί να επιλέξει μεταξύ διαφορετικών προκαθορισμένων στυλ (καρτουνίστικο, ρεαλιστικό, επιφάνεια χονδροειδούς κόκκου) ή να προσαρμόσει την απεικόνιση όπως επιθυμεί.

Παραδείγματα προκαθορισμένων στυλ που μπορούν να χρησιμοποιηθούν στο Protein Imager.

Οι μοριακές αναπαραστάσεις (επιφάνεια, καρτούν, σφαίρες, ραβδιά κ.λπ.), οι τρόποι χρωματισμού, τα χρώματα φόντου, η σκίαση και η απόκρυψη περιβάλλοντος είναι μερικές μόνο από τις ρυθμιζόμενες παραμέτρους με τις οποίες μπορούν να παίξουν οι χρήστες.

Τα εργαλεία ανάλυσης δεδομένων, όπως η υπέρθεση δομών, η προβολή ακολουθιών και οι επιλογές, είναι επίσης διαθέσιμα για τους ειδικούς.

Επιπλέον, είναι πλήρως online, πράγμα που σημαίνει ότι δεν χρειάζεται τοπική εγκατάσταση, δεν χρειάζεται να ασχοληθείτε με ξεπερασμένες εκδόσεις ή προβλήματα συμβατότητας με τα λειτουργικά σας συστήματα. Κάθε απόδοση βασίζεται σε έναν αποκλειστικό διακομιστή και ο χρόνος απόδοσης είναι συνήθως μικρότερος από 1 λεπτό, ανάλογα με την πολυπλοκότητα της απεικόνισης.

Ξεκινήστε να δημιουργείτε στο Mind the Graph τώρα

Ποιος χρησιμοποιεί το Protein Imager;

Από προπτυχιακούς έως έμπειρους επιστήμονες, το Protein Imager είναι τόσο εύκολο και διαισθητικό που όλοι μπορούν να επωφεληθούν από αυτό. Οι χρήστες είναι ελεύθεροι να απελευθερώσουν τη δημιουργικότητά τους και να δημιουργήσουν επιστημονικές απεικονίσεις για διαφορετικούς σκοπούς.

Πολλοί επιστήμονες υιοθέτησαν το Protein Imager για να απεικονίσουν τα ερευνητικά τους ευρήματα στις εργασίες τους ή στις γραφικές περιλήψεις τους.

Protein Imager που χρησιμοποιείται από επιστήμονας Matteo Oliverio για τη δημιουργία γραφικών περιλήψεων.

Οι πιο δημιουργικοί σχεδιάζουν εξώφυλλα περιοδικών με το Protein Imager. Οι παθιασμένοι με την επιστημονική επικοινωνία χρησιμοποιούν το Protein Imager για να σχεδιάσουν εντυπωσιακά οπτικά στοιχεία για τις αναρτήσεις τους στα μέσα κοινωνικής δικτύωσης.

Καθηγητής Syma Khalid από το Πανεπιστήμιο της Οξφόρδης δημιούργησε το σχέδιο για το εξώφυλλο του περιοδικού Structure, τόμος 29, τεύχος 5, Μάιος 2021.

Τέλος, το Protein Imager έχει τη δυνατότητα εξαγωγής των μορίων ως ογκομετρικά αρχεία (μορφή VRML2) που χρησιμοποιούνται από ιατρικούς εικονογράφους σε προγράμματα τρισδιάστατων γραφικών όπως το Blender, το Cinema 4D, το Maya.

Εικόνα από το χαρτοφυλάκιο του στούντιο επιστημονικής εικονογράφησης BioSciVisuals. Το Protein Imager χρησιμοποιήθηκε για την απεικόνιση των μορίων που περιλαμβάνονται στο τελικό γραφικό της αφίσας μαζί με επαγγελματικά εργαλεία απεικόνισης.

Είστε έτοιμοι να ξεκινήσετε στο Mind the Graph;

Ξεκινήστε τις εικονογραφήσεις σας

Ας δούμε τα βασικά βήματα για να ξεκινήσετε το ταξίδι σας στην εικονογράφηση, εντάξει;

1 - Φορτώστε τη μοριακή δομή

Πηγαίνετε στο Απεικονιστής πρωτεϊνών και να φορτώσετε οποιαδήποτε μοριακή δομή από τον υπολογιστή σας ή να την αντλήσετε από βιολογικές βάσεις δεδομένων, όπως η Protein Data Bank ή η βάση δεδομένων Orientations of Proteins in Membranes (OPM).

2 - Προσαρμογή

Μέσω του πάνελ δομής στα δεξιά επιλέξτε τη μοριακή αναπαράσταση και τα χρωματικά σχήματα, μέσω των πάνελ οπτικοποίησης ρυθμίστε τη σκίαση, τα φώτα, την απόκρυψη περιβάλλοντος, απλά επιλέξτε ένα προκαθορισμένο στυλ.

3 - Πάρτε την εικόνα

Μόλις είστε ικανοποιημένοι με την εμφάνιση της κατασκευής σας, ζητήστε την απόδοση.

Σε λίγα λεπτά, θα μπορείτε να κατεβάσετε την απεικόνιση σε υψηλή ποιότητα από τον πίνακα απόδοσης. Σημειώστε ότι για να ζητήσετε μια απεικόνιση πρέπει να εγγραφείτε με μια έγκυρη διεύθυνση ηλεκτρονικού ταχυδρομείου.

4 - Μοιραστείτε το με τους συνεργάτες σας

Όταν είστε ευχαριστημένοι με την εργασία σας, μπορείτε να την αποθηκεύσετε στο φάκελο χρήστη που αποθηκεύει έως και 25MB. Μπορείτε να λάβετε έναν σύνδεσμο για κάθε έργο για να τον μοιραστείτε με τους συνεργάτες σας, ώστε όλοι να βρίσκονται στην ίδια σελίδα.

Ξεκινήστε να χρησιμοποιείτε το Mind The Graph τώρα δωρεάν!

Mind the Graph και τρισδιάστατη απεικόνιση πρωτεϊνών

Φυσικά, η 3D Protein Imaging και η Mind the Graph αποτελούν την καλύτερη συνεργασία που υπήρξε ποτέ!

Μπορείτε να χρησιμοποιήσετε την τρισδιάστατη εικόνα της πρωτεΐνης σας και να την ανεβάσετε στη δημιουργία σας στο Mind the Graph σε ένα δευτερόλεπτο. Για να μάθετε πώς να ανεβάζετε εικόνες μπορείτε να παρακολουθήσετε ένα εκπαιδευτικό βίντεο ακριβώς εδώ.

Ή, πηγαίνετε στη δημιουργία του Mind the Graph, κάντε κλικ στο Περισσότερα στο κάτω μέρος του αριστερού μενού, και στη συνέχεια Ανέβασμα, επιλέξτε την εικόνα σας, και αφού φορτωθεί επιλέξτε και σύρετε την εικόνα στο χώρο εργασίας σας, και έτοιμο!

Επιπλέον, μπορείτε να επιλέξετε οποιαδήποτε εικονογράφηση που είναι διαθέσιμη στη γκαλερί Mind the Graph για να τη χρησιμοποιήσετε μαζί με τις εικόνες των πρωτεϊνών σας.

Η γκαλερί Mind the Graph διαθέτει πολλά οπτικά ελκυστικά στοιχεία για την έρευνά σας, με 40.000+ επιστημονικά ακριβείς απεικονίσεις σε 80+ δημοφιλείς τομείς. Αν χρειάζεστε μια εικονογράφηση, μπορείτε να τη βρείτε στο Mind the Graph.

Ακόμα, αν δεν βρήκατε αυτό που χρειάζεστε ή αν χρειάζεστε μια πολύ συγκεκριμένη εικονογράφηση, μπορείτε να ζητήσετε μια εξατομικευμένη εικονογράφηση και η ομάδα εικονογράφησης του Mind the Graph θα τη σχεδιάσει για εσάς. Το μόνο που χρειάζεται να κάνετε είναι να συμπληρώσετε το Mind the Graph Αίτηση για ένα εικονίδιο φόρμα, μέσα στο χώρο εργασίας σας, με μια σύντομη επεξήγηση και μια εικόνα αναφοράς. Μέσα σε μια εβδομάδα θα λάβετε την εξατομικευμένη εικονογράφησή σας.

Καταπληκτικό, σωστά;

Δείτε το βίντεο για το πώς μπορείτε να δημιουργήσετε την επιστημονική σας φιγούρα χρησιμοποιώντας το Mind the Graph και να χρησιμοποιήσετε εξωτερικές εικόνες από την 3D Protein Imaging.