Vizuální abstrakci není snadné vytvořit, ale je tu, aby zůstala. Proto vždy rádi ukazujeme úžasné práce našich uživatelů jako inspirativní příklad vizuální abstrakce. Chceme vědcům umožnit, aby se věda stala vizuálnější a dosažitelnější.

V příspěvku vám ukážu něco málo z původního výzkumu, který provedl Yelena Sterlin a kolegové. Je studentkou doktorského studia na Fakultě zemědělství, potravinářství a životního prostředí Hebrejské univerzity v Jeruzalémě.

Její nový článek Optimalizované Pull-Downs s malými molekulami definují MLBP1 jako protein vázající acyl-lipidy vnáší světlo do interakcí mezi proteiny a metabolity v rostlinách se zaměřením na receptory kyseliny abscisové (ABA). Je také předplatitelkou programu mind the graph, a proto vytvořila infografiku ve formátu pozor na graf vysvětlit jejich metodiku.

Význam proteinů souvisejících s doménou START

 

Podle Časopis Nature, kyselina abscisová (ABA) je hlavním fytohormonem, který se podílí na reakci na abiotický stres a na adaptaci na něj. Je také kandidátem na agrochemikálie. ABA byla poprvé objevena v 60. letech 20. století. Poté bylo zjištěno, že je klíčovým regulátorem tak rozmanitých procesů, jako je dormance, klíčení, vývoj semen a reakce na biotický a abiotický stres.

Nejstarší události zahrnující signální dráhu ABA zahrnují vazbu ABA na receptory PYR/PYL/RCARs. Tyto receptory patří do superrodiny s doménou START.

Proteinové domény START jsou domény vázající lipidy, které se vyskytují v genomech bakterií, protist, kvasinek, rostlin a živočichů. Častěji se však vyskytují u rostlin. Podle Schrick, přítomnost domén START u evolučně vzdálených druhů, jako jsou živočichové a rostliny, naznačuje konzervovaný mechanismus interakce proteinů s lipidy/steroly.

Článek publikovaný v časopise Časopis The Plant Journal se zaměřuje na receptory ABA PYR/PYL/RCAR. Vědci se rozhodli optimalizovat metodu, která by umožnila identifikaci ligandů START domény a proteinů příbuzných START doméně v rostlinách, protože "ligandy proteinů s doménou START jsou nezbytné pro správné fungování jejich proteinů u živočichů i rostlin a bylo prokázáno, že rostlinné proteiny s doménou START se podílejí na základních fyziologických procesech".

Vizuální abstrakt metodiky

 

Pro vysvětlení své metodiky vytvořili vědci infografiku s ilustracemi grafů. Je poutavá a srozumitelnější. 

 

Níže uvedená infografika ukazuje experimentální pracovní postup. Jak vidíte, byly exprimovány a purifikovány čtyři proteiny START. Supernatant obsahující nativní rozpustnou frakci přefiltrovali a inkubovali pomocí streptavidinové sefarosy, afinitní pryskyřice pro spolehlivé a vysoce-purifikace biomolekul s vysokým rozlišením. Poté analyzovali alikvoty pomocí Western blotu. K identifikaci ligandů eluovali předpokládané ligandy a podrobili je analýze pomocí systému LC -MS (kapalinová chromatografie a hmotnostní spektrometrie). Molekulární struktury předpokládaných ligandů, které je zajímaly, byly určeny pomocí tandemové hmotnostní spektrometrie.

 

vizuální abstrakce od yeleny sterlin

Autoři představili dobrou techniku pro počáteční sondování proteinových ligandů v rostlinách. Přístup upravili tak, aby bylo možné objevit ligandy START. Metodu však lze přizpůsobit ligandům různé chemické povahy úpravou analytických podmínek.

Pokud chcete svůj výzkum prezentovat pomocí vědeckých ilustrací a vizuálních abstraktů, můžete použít i Mind the Graph. Jste tedy připraveni zlepšit svou komunikaci ve vědě?

náhled_250

Související články
logo-odběr

Přihlaste se k odběru našeho newsletteru

Exkluzivní vysoce kvalitní obsah o efektivním vizuálním
komunikace ve vědě.

- Exkluzivní průvodce
- Tipy pro návrh
- Vědecké novinky a trendy
- Výukové programy a šablony