En visuell abstraktion är inte lätt att skapa, men den är här för att stanna. Så vi älskar alltid att visa upp våra användares fantastiska arbete som ett inspirerande exempel på visuell abstraktion. Vi vill ge forskare möjlighet att skapa en mer visuell och lättillgänglig vetenskap.

I inlägget kommer jag att visa dig lite av den ursprungliga forskningen av Jelena Sterlin och medarbetare. Hon är doktorand vid fakulteten för jordbruk, livsmedel och miljö vid Hebrew University of Jerusalem.

Hennes nya uppsats Optimerade småmolekylära pull-downs definierar MLBP1 som ett acyl-lipidbindande protein belyser protein-metabolit-interaktioner i växter, med fokus på abscisinsyra (ABA)-receptorer. Hon är också en "mind the graph"-abonnent, så hon skapade en infografik i Tänk på grafen att förklara sin metod.

Betydelsen av START-domänrelaterade proteiner

 

Enligt Tidskriften NatureAbscisinsyra (ABA) är det viktigaste fytohormonet som är involverat i abiotisk stressrespons och dess anpassning. Det är också ett kandidatämne för jordbrukskemikalier. ABA upptäcktes för första gången på 1960-talet. Sedan dess har det visat sig vara en viktig regulator för så olika processer som viloläge, groning, fröutveckling och reaktioner på biotisk och abiotisk stress.

De tidigaste händelserna som involverar ABA-signalvägen involverar ABA-bindning till PYR/PYL/RCARs-receptorer. Receptorerna tillhör superfamiljen START-domäner.

START-proteindomänerna är en lipidbindande domän som finns i arvsmassan hos bakterier, protister, jäst, växter och djur. De är dock vanligare i växter. Enligt SchrickFörekomsten av START-domäner i evolutionärt avlägsna arter som djur och växter tyder på en bevarad mekanism för interaktion mellan proteiner och lipider/steroler.

Artikeln publicerades i Tidskriften för växter fokuserar på PYR/PYL/RCARs ABA-receptorer. Forskarna bestämde sig för att optimera en metod för identifiering av START-domäner och START-domänrelaterade proteinligander i växter, eftersom "START-domänproteinliganderna är nödvändiga för att deras protein skall fungera korrekt både hos djur och växter, och START-domänproteiner i växter har visat sig vara inblandade i viktiga fysiologiska processer".

En visuell sammanfattning av metoden

 

För att förklara sin metodik skapade forskarna en infografik med grafillustrationer. Det är iögonfallande och lättare att förstå. 

 

Infografiken nedan visar det experimentella arbetsflödet. Som du kan se uttryckte och renade de fyra START-proteinerna. De filtrerade och inkuberade supernatanten som innehöll den nativa lösliga fraktionen med streptavidinsefaros, ett affinitetsharts för tillförlitlig och hög-upplösande rening av biomolekyler. Därefter analyserade de alikvoter med hjälp av western blot. För att identifiera liganden eluerade de putativa ligander och utsattes för en LC -MS (vätskekromatografi och masspektrometri) systemanalys. De molekylära strukturerna hos de förmodade liganderna av intresse bestämdes med tandem-masspektrometri.

 

visuell abstraktion av yelena sterlin

Författarna presenterade en bra teknik för inledande sondering av proteinligander i växter. De anpassade metoden för att upptäcka START-ligander. Det går dock att anpassa metoden till ligander av olika kemisk natur genom att justera de analytiska förhållandena.

Om du vill visa din forskning med hjälp av vetenskapliga illustrationer och visuella sammanfattningar kan du också använda Mind the Graph. Så, är du redo att förbättra din kommunikation inom vetenskap?

förhandsgranskning_250

Relaterade artiklar
logotyp-abonnemang

Prenumerera på vårt nyhetsbrev

Exklusivt innehåll av hög kvalitet om effektiv visuell
kommunikation inom vetenskap.

- Exklusiv vägledning
- Tips för design
- Vetenskapliga nyheter och trender
- Handledningar och mallar