Visuaalset abstraktsiooni ei ole lihtne luua, kuid see on siin, et jääda. Nii et meile meeldib alati näidata meie kasutajate hämmastavaid töid visuaalse abstraktsiooni inspireeriva näitena. Me tahame anda teadlastele võimaluse muuta teadus visuaalsemaks ja kättesaadavamaks.

Postituses näitan teile natuke algset uurimistööd, mille on teinud Jelena Sterlin ja kolleegid. Ta on doktorant Jeruusalemma heebrea ülikooli põllumajanduse, toidu ja keskkonna teaduskonnas.

Tema uus raamat Optimeeritud väikemolekulide tõmbedistsipliinid määratlevad MLBP1 atsüül-lipiidi siduvate valkudega. valgustab valgude ja metaboliitide vastastikmõju taimedes, keskendudes abstsiinhappe (ABA) retseptoritele. Ta on ka mind the graph'i tellija, nii et ta lõi infograafika sisse vaata graafikut selgitada oma metoodikat.

START-domeeniga seotud valkude tähtsus

 

Vastavalt Looduse ajakiri, abscisiinhape (ABA) on peamine fütohormoon, mis osaleb abiootilisele stressile reageerimisel ja sellega kohanemisel. Samuti on see põllumajanduskemikaalide kandidaat. ABA avastati esmakordselt 1960ndatel aastatel. Pärast seda on leitud, et see on peamine regulaator sellistes erinevates protsessides nagu dormantsus, idanemine, seemnete areng ning reageerimine biootilisele ja abiootilisele stressile.

Varaseimad sündmused, mis hõlmavad ABA signaalirada, hõlmavad ABA seondumist PYR/PYL/RCARs retseptoritega. Retseptorid kuuluvad START-domeeni superperekonda.

START-valgu domeenid on lipiide siduv domeen, mis esineb bakterite, algloomade, pärmi, taimede ja loomade genoomides. Siiski on need sagedamini levinud taimedes. Vastavalt SchrickSTART-domeenide esinemine evolutsiooniliselt kaugel asuvatel liikidel, nagu loomad ja taimed, viitab konserveerunud mehhanismile, mis võimaldab valkude ja lipiidide/steroolide vahelist suhtlemist.

Väljaandes The Plant Journal keskendub PYR/PYL/RCARs ABA retseptoritele. Teadlased otsustasid optimeerida meetodit, mis võimaldaks identifitseerida START-domeeni ja START-domeeniga seotud valkude ligandid taimedes, sest "START-domeeni valkude ligandid on hädavajalikud nende valkude nõuetekohaseks toimimiseks nii loomadel kui ka taimedel ning on näidatud, et taimsed START-domeeni valgud on seotud oluliste füsioloogiliste protsessidega".

Visuaalne kokkuvõte metoodikast

 

Oma metoodika selgitamiseks lõid teadlased infograafika, millel on graafilised illustratsioonid. See on pilkupüüdev ja lihtsamini mõistetav. 

 

Allpool olev infograafika näitab eksperimentaalset töökorraldust. Nagu näha, ekspresseeriti ja puhastati neli START-valku. Nad filtreerisid ja inkubeerisid supernatanti, mis sisaldas natiivset lahustuvat fraktsiooni, kasutades streptavidiinsefaroosi, mis on afiinsusvaikuse vaik usaldusväärse ja kõrge kontsentratsiooniga-lahutusega biomolekulide puhastamine. Seejärel analüüsisid nad alikvoote Western blot'i abil. Ligandi identifitseerimiseks elueerisid nad oletatavad ligandid ja tegid neile LC -MS (vedelikkromatograafia ja massispektromeetria) süsteemianalüüsi. Huvipakkuvate putatiivsete ligandide molekulaarstruktuurid määrati tandem-massispektromeetria abil.

 

visuaalne abstrakt, mille autor on Jelena Sterlin

Autorid esitasid hea tehnika valguliigandite esialgseks sondeerimiseks taimedes. Nad kohandasid lähenemisviisi START-ligandide avastamiseks. Siiski saab meetodit kohandada erineva keemilise iseloomuga ligandidele, kohandades analüüsitingimusi.

Kui soovite oma uurimistööd näidata teaduslike illustratsioonide ja visuaalsete kokkuvõtete abil, võite kasutada ka Mind the Graph. Niisiis, kas olete valmis parandama oma teaduskommunikatsiooni?

eelvaade_250

Seotud artiklid
logo-subscribe

Tellige meie uudiskiri

Eksklusiivne kvaliteetne sisu tõhusa visuaalse
teabevahetus teaduses.

- Eksklusiivne juhend
- Disaini näpunäited
- Teaduslikud uudised ja suundumused
- Juhendid ja mallid