Koronavirüs için RT-PCR Testi

2020'de COVID-19 hakkında duyduğunuz pek çok şeyden, hepsinin ortasında yer alan bir şey, birinin virüsle enfekte olup olmadığını tespit etmek için kullanılan test, ünlü RT-PCR testi veya sadece PCR.

Şüphesiz, bu testi daha önce duymuşsunuzdur. tıbbi profesyonel veya haberlerde. PCR testi, bir kişinin vücudunda virüsün varlığını (veya olmadığını) tespit etmek için kullanılır.

RT-PCR testi virüsü tespit edebilen tek test değildir, ancak diğer yöntemlerle karşılaştırıldığında en doğru ve güvenilir olanıdır. Bir diğer test ise kan örneklerinde spesifik antikor seviyelerini tespit eden geleneksel seroloji testidir.

RT-PCR'deki harflerin açılımı Ters Transkripsiyon Polimeraz Zincir Reaksiyonubilim insanları tarafından genetik materyalin birden fazla kopyasını üretmek için onlarca yıldır kullanılmaktadır.

Başka bir deyişle, bu durumda SARS-CoV-2'den daha fazla genetik materyal, hastalardan toplanan burun, kulak veya tükürük örneklerinde virüsün varlığını kanıtlamak için parmak izi olarak kullanılır. Numunede az miktarda bile olsa herhangi bir virüs gizlenmişse, kopyala-yapıştır döngüsü nedeniyle tespit edebilecektir. RT-PCR testinin bu kadar güvenilir olmasının nedeni budur.

Test DNA'lar veya RNA'lar olsun, bir parça genetik materyalin kopyalama-yapıştırma işlemini yapan, sıcaklık döngüsü içinde temel olarak iki adımı olan bir yöntemdir.

Test için bir termosiklör makinesi ki bu da kesin bir sıcaklık ve zaman kontrolü. Birden fazla sıcaklık döngüsü boyunca viral genetik materyal artacaktır. Bir sıcaklık döngüsü örneği aşağıda gösterilmiştir.

Yöntem iki ana enzim gerektirir, Ters Transkriptaz (bu yüzden "RT" başlık) ve DNA-polimeraz. Her birinin bir etki aşaması ve bir işlevi vardır. Yukarıdaki şekilde, döngünün sarı fazı RT'nin hareket ettiği, kırmızı fazı ise DNA-polimerazın işini yaptığı zamandır.

İlk enzim, RNA virüsünden tamamlayıcı DNA ipliğini oluşturarak ikinci enzimin yeni yapılan DNA ipliğinden kopyalama-yapıştırma işini gerçekleştirmesini sağlar ve mevcut genetik materyal miktarını artırır. Bu amplifikasyon, genetik materyalin karakterize edilmesini ve/veya manipüle edilmesini mümkün kılar, oysa daha küçük bir miktarda bu mümkün olmazdı.

Tüm bu işlemlerin gerçekleşmesi için enzimlerin küçük (veya büyük) bir yardıma ihtiyacı vardır molekül PRİMER denir. Primer işlevi, enzimin iplikçikleri uzatmaya başlaması gereken konumu belirtmektir, bu olmadan DNA-polimerazın kopyala-yapıştır işlemi başlamaz.

Primer rastgele veya belirli bir şekilde seçilebilir. Bu gibi durumlarda vírusun genetik haritasını bilmek çok önemlidir, böylece sonuçların verimliliğini ve güvenilirliğini artırmak için özel primerler kullanılabilir.

Siz de bizim gibi merak ediyorsanız ve RT-PCR hakkında daha fazla bilgi edinmek istiyorsanız, daha fazla ayrıntıya göz atabilirsiniz bu bilimsel makale tam burada ama özünde testi yapmak için gereken her şey burada:

Viral genetik materyal, RNA

Ters Transkriptaz ve DNA-polimeraz enzimleri

ÖNCÜLLER

Nükleozit trifosfatlar

Ve Floresan Reporter Boyalar:

COVID-19 virüsü ile kontamine olmuş veya olmamış bir numunenin sonuçlarını bilmek için, RT-PCR testi ile birlikte floresan raportör boyalar tahlili kullanılır. Test, bir numunenin floresan sinyalinin varlığına veya yokluğuna dayanmaktadır. Sinyal yokluğunda test negatif veya yanlış negatif olarak sonuçlandırılabilir. Yoğun bir sinyalin varlığında sadece vírus varlığı için pozitif değil, aynı zamanda ileri evre bir hastalık olarak da sonuçlandırılabilir.

Tüm malzemeleri karıştırın ve termo-döngü makinesine koyun.

Testin ilk adımı aşağıda gösterilmiştir infografik Sonraki. RT enzimi, numunede bulunan virüsün genetik materyalinin ilk kopyasını oluşturur. Aşağıda RT-PCR yönteminin ikinci adımını görüyorsunuz. Primer başlangıç pozisyonunu gösterir ve enzimatik reaksiyon yoluyla DNA-polimeraz DNA iplikçiklerini uzatmaya başlar.

Son olarak, bu resim SARS-CoV-2 virüsünün elektron mikrograf görüntüsüdür ve virüsün yapısını mükemmel bir şekilde görmek mümkündür. yapı virüsün. Ne kadar güzel, değil mi?

Test şu şekildedir karmaşık ve göründüğü kadar basit değil, ama eminim infografiklerle nasıl çalıştığına dair büyük resmi anlamak çok daha kolay olmuştur, değil mi?

Bunu herhangi bir bilimsel kullanarak istediğiniz bilgileri Mind the Graph. Platform, daha iyi iletişim kurmanız için size özerklik vermek üzere burada Bilim Bilgi. Platformu nasıl kullanacağınız hakkında daha fazla bilgi edinin ve herhangi bir yardıma ihtiyacınız olursa lütfen bizimle iletişime geçin!

Referans

AI, T. ve diğerleri. 2019 Koronavirüs Hastalığı (COVID-19) için Göğüs BT ve RT-PCR Testinin Korelasyonu Çin: 1014 Olgudan Oluşan Bir Rapor. Radiology, v. 296, n. 2, p. E32-E40, 26 fev. 2020.

GIBELLINI, D. ve ark. HIV-1 seropozitif hastalarda SYBR green gerçek zamanlı RT-PCR tekniği ile insan immün yetmezlik virüsü tip 1 (HIV-1) viral yükünün kantitatif tespiti. Journal of Virological Methods, v. 115, n. 2, p. 183-189, 1 fev. 2004.

JAMES, D. RT-PCR ile ve multipleks PCR testinde elma kök kanal açma virüsünün tespiti için basit ve güvenilir bir protokol. Journal of Virological Methods, v. 83, n. 1, p. 1-9, 1 dez. 1999.

LI, Y. ve diğerleri. Klinik olarak COVID-19 teşhisi konan hastanede yatan hastalar için SARS-CoV-2'nin RT-PCR testinin stabilite sorunları. Journal of Medical Virology, v. 92, n. 7, s. 903-908, 2020.

LIAO, C.-S. ve diğerleri. RNA tabanlı virüslerin teşhisi için minyatür RT-PCR sistemi. Nükleik Asitler Araştırma, v. 33, n. 18, p. e156-e156, 1 out. 2005.

MOHAN, A. ve ark. KOAH akut alevlenmesi olan hastalarda PCR ve RT-PCR ile tespit edilen viral enfeksiyon prevalansı: Bir sistematik derleme. Respirology, v. 15, n. 3, p. 536-542, 2010.

NOLAN, T.; HANDS, R. E.; BUSTIN, S. A. Gerçek zamanlı RT-PCR kullanılarak mRNA miktarının belirlenmesi. Doğa Protocols, v. 1, n. 3, p. 1559-1582, ago. 2006.

Yeni Koronavirüs SARS-CoV-2 | Bu transmisyon elektron mik... | Flickr. Disponível em: . Erişim tarihi: 23 Temmuz 2020.

İlgili Makaleler

Haber bültenimize abone olun

Fabricio Pamplona Hakkında