Vizuálnu abstrakciu nie je ľahké vytvoriť, ale je tu, aby zostala. Preto vždy radi ukážeme úžasné práce našich používateľov ako inšpiratívny príklad vizuálnej abstrakcie. Chceme umožniť vedcom, aby umožnili vizuálnejšiu a dosiahnuteľnejšiu vedu.

V príspevku vám ukážem časť pôvodného výskumu Yelena Sterlin a kolegami. Je doktorandkou na Fakulte poľnohospodárstva, potravinárstva a životného prostredia Hebrejskej univerzity v Jeruzaleme.

Jej nový dokument Optimalizované Pull-Downs s malými molekulami definujú MLBP1 ako proteín viažuci acyl-lypidy vnáša svetlo do interakcií medzi proteínmi a metabolitmi v rastlinách so zameraním na receptory kyseliny abscisovej (ABA). Je tiež predplatiteľom mind the graph, takže vytvorila infografiku v Pozor na graf vysvetliť svoju metodiku.

Význam proteínov súvisiacich s doménou START

 

Podľa Časopis Nature, kyselina abscisová (ABA) je hlavným fytohormónom, ktorý sa podieľa na reakcii na abiotický stres a na adaptácii naň. Je tiež kandidátom na agrochemikálie. ABA bola prvýkrát objavená v 60. rokoch 20. storočia. Potom sa zistilo, že odvtedy je kľúčovým regulátorom takých rozmanitých procesov, ako je dormancia, klíčenie, vývoj semien a reakcie na biotický a abiotický stres.

Najstaršie udalosti zahŕňajúce signálnu dráhu ABA zahŕňajú väzbu ABA na receptory PYR/PYL/RCARs. Tieto receptory patria do superrodiny s doménou START.

Proteínové domény START sú domény viažuce lipidy, ktoré sa nachádzajú v genómoch baktérií, protistov, kvasiniek, rastlín a živočíchov. Častejšie sa však vyskytujú v rastlinách. Podľa Schrick, prítomnosť domén START u evolučne vzdialených druhov, ako sú živočíchy a rastliny, naznačuje konzervovaný mechanizmus interakcie proteínov s lipidmi/sterolmi.

Dokument uverejnený v časopise Rastlinný časopis sa zameriava na receptory ABA PYR/PYL/RCAR. Výskumníci sa rozhodli optimalizovať metódu, ktorá by umožnila identifikovať ligandy START domény a proteínov príbuzných START doméne v rastlinách, pretože "ligandy proteínov s doménou START sú nevyhnutné pre správne fungovanie ich proteínov u živočíchov aj rastlín a bolo preukázané, že rastlinné proteíny s doménou START sa podieľajú na základných fyziologických procesoch".

Vizuálna Abstrakt metodiky

 

Na vysvetlenie svojej metodiky vedci vytvorili infografiku s ilustráciami grafov. Je pútavá a ľahšie pochopiteľná. 

 

Na infografike nižšie je znázornený experimentálny pracovný postup. Ako môžete vidieť, exprimovali a purifikovali štyri proteíny START. Supernatant obsahujúci natívnu rozpustnú frakciu prefiltrovali a inkubovali pomocou streptavidínovej sefarózy, afinitnej živice na spoľahlivé a vysoko-purifikácia biomolekúl s vysokým rozlíšením. Potom analyzovali alikvoty pomocou western blotu. Na identifikáciu ligandu eluovali predpokladané ligandy a podrobili ich analýze systémom LC -MS (kvapalinová chromatografia a hmotnostná spektrometria). Molekulové štruktúry predpokladaných ligandov, ktoré ich zaujímali, sa určili pomocou tandemovej hmotnostnej spektrometrie.

 

vizuálna abstrakcia od yeleny sterlin

Autori predstavili dobrú techniku na počiatočné skúmanie proteínových ligandov v rastlinách. Prístup upravili tak, aby bolo možné objaviť START ligandy. Metódu však možno prispôsobiť ligandom rôznej chemickej povahy úpravou analytických podmienok.

Ak chcete svoj výskum prezentovať pomocou vedeckých ilustrácií a vizuálnych abstraktov, môžete použiť aj Mind the Graph. Takže ste pripravení zlepšiť svoju komunikáciu vo vede?

náhľad_250

Súvisiace články
logo-odhláška

Prihláste sa na odber nášho newslettera

Exkluzívny vysokokvalitný obsah o efektívnom vizuálnom
komunikácia vo vede.

- Exkluzívny sprievodca
- Tipy na dizajn
- Vedecké novinky a trendy
- Návody a šablóny