Jau vairākus gadu desmitus dažās pasaules populācijās ir ziņots par melanomas saslimstības pieaugumu. Melanomu sauc par melanomu, kas veidojas no melanocītiem ādā, gļotādā vai uveā. Neraugoties uz tās 5% īpatsvaru starp visiem ādas ļaundabīgajiem audzējiem, tā ir atbildīga par vairāk nekā 75% no visiem nāves gadījumiem no ādas vēža. 

Lai gan pozitīvā saistība starp UV starojuma iedarbību un melanomas attīstību ir labi zināma, cilvēka melanomas audos pamatā esošie epiģenētiskie mehānismi lielā mērā nav izpētīti. Šajā rakstā tiks aplūkots ar patobioloģiju un ultravioleto staru iedarbību saistītais prognostiskais vēža ierosinātājs, kā arī autora atziņas par minēto tematu. 

Pētījuma mērķis

Izmantojot divas neatkarīgas ādas melanomas pacientu grupas, viņu mērķis ir atklāt un apstiprināt genoma mēroga metilācijas izmaiņas, kas saistītas ar UV mutācijām. Galvenais mērķis ir izpētīt DNS metilomu un transkriptomu, kā arī integrēto metilomu un transkriptomu diagnostisko potenciālu, lai atšķirtu ādas melanomas ar UV mutācijām no ādas melanomām bez UV mutācijām. 

Izmantojot integratīvo OMIC pieeju, tiek novērtēts, vai prioritāri izvēlēto atšķirīgi metilēto gēnu mazie nukleotīdu varianti (SNV) un kopiju skaita varianti (CNV) ir vēža ierosinātāju potenciāls. Šo pētījumu papildina vēl viens, kurā tiek pētīts, vai DNS metilomi var atšķirt patoloģiskās un ar UV starojumu saistītās atšķirības starp izteiktiem melanomas variantiem, kas ir saistīti ar ultravioleto staru iedarbību (ādas melanoma), un tiem, kas nav saistīti (akrālā melanoma). Dokumentā sniegtajā diagrammā ir parādīts pētījuma mērķis un process. Grafiskais attēlojums tika izveidots, izmantojot Mind the Graph.

Detalizēts pētījums

Klīniskajos biospecifikācijās UV starojums (UV) ir saistīts ar ādas melanomu, bet epigenētiskie mehānismi, kas ir šo mehānismu pamatā, vēl nav noskaidroti. Šajā pētījumā klīniskai, epigenoma (DNS metiloma), genoma un transkriptoma profilēšanai tika iekļauta 112 ādas melanomas šūnu kohorta, kas sastāv no dažādām etniskajām grupām. Šajā pētījumā tika identificētas UV starojuma izraisītas izmaiņas imunoloģiskajos un regulatīvajos ceļos, kas var būt vēža ierosinātāji dažādās multiOMIC.

Papildus tam, ka TAPBP (Tap saistošā proteīna gēns) ir viskritiskāk iesaistītais gēns, tas ir kritiski iesaistīts imūnsistēmas funkcijās, un vairākas UV izmainītas metilēšanas vietas, kas ir apstiprinātas ar mērķtiecīgu sekvenēšanu, sniedz klīniski pielietojamas iespējas. MHC-I mijiedarbojas ar transportieri, kas saistīts ar antigēna apstrādi, izmantojot TAPBP, imūnglobulīnu superģimenes locekli. Vairākos vēža gadījumos ir konstatēta TAPBP (tapasīna) proteīna lejupslīde, kas atjaunojas pēc citokīnu iedarbības. 

Tas liek domāt, ka TAPBP ekspresijas trūkumu varētu izraisīt nevis strukturālas izmaiņas, bet gan disregulācijas traucējumi. Pētnieki atklāja, ka TAPBP DNS metilācijas līmenis ir būtiski apgriezti proporcionāli saistīts ar transkripciju un ka tā mainās UV starojuma iedarbības, nevis melanomas patoloģiskās identitātes dēļ. Ne ādas, ne akrālās melanomas, kas nav mutētas UV starojuma ietekmē, netika konstatēta atšķirīga metilācija.

Papildus atklājumiem par TAPBP viņi konstatēja, ka UV mutācijas ir saistītas ar virkni epigenētisku izmaiņu, kas ietekmē ādas melanomas metilomu. Iegūtie rezultāti norāda, ka ādas melanomas, neatkarīgi no tā, vai tās ir ar UV mutāciju vai bez UV mutācijas, var būt jāklasificē atsevišķi, lai gan tiek uzskatīts, ka tām ir viena un tā pati patoloģiskā/šūnu izcelsme. Tas ir tāpēc, ka epigenomiskā ainava, no kuras tie ir atvasināti, var saturēt gan iedarbības, gan šūnu līnijas marķierus. 

Šajā pētījumā ādas un akrālās melanomas paraugiem tika izmantotas vairākas jaudīgas tehnoloģijas, tostarp WGS, WES, RNS sekvenēšana un DNS metiloma profilēšana, kā arī jaunākie bioinformātikas rīki. Pētnieki izmantoja publiski pieejamus datus un papildināja tos ar jaunām datu kopām, kas ietvēra lielākus paraugus, plašāku genomisko pārklājumu, visaptverošus fenotipiskos novērtējumus, labi saglabātus saldētu audu paraugus un novērtēja ne tikai ādas, bet arī citu tautību melanomas, izņemot eiropiešu. 

Šī darba rezultātā tika gūti šādi rezultāti.

(1) biomarķieru atklāšana, kurus var izmantot vēža riska stratifikācijai;

(2) melanomas tipu klasifikācijas uzlabošana to ietvaros un starp tiem; 

(3) identificēt molekulāros virzītājus, kas varētu būt atbildīgi par melanomagenēzi un uz kuriem var vērsties terapijā; 

(4) zināšanu par melanomas patobioloģiju paplašināšana, lai mazinātu atšķirības starp iedzīvotājiem.

Šis pētījums ir ceļvedis līdzīgiem gēnu un vides pētījumiem citu melanomas tipu gadījumā, un tas aptver gan bieži sastopamās, gan retāk sastopamās melanomas.

Efektīvāks veids, kā paziņot precīzu zinātnisko informāciju

Šis pētnieciskais darbs ir ļoti interesants un viegli saprotams, galvenokārt tāpēc, ka tajā ir skaistas grafiskās ilustrācijas. Grafiki tika izveidoti, izmantojot Mind the Graph instruments. Grafiskā ilustrācija lasītājam var sniegt dažādus ieguvumus. Varat izmēģināt paaugstināt savu pētījuma līmeni, reģistrējoties vietnē Mind the Graph bez maksas un izmēģinot savu pirmo zinātnisko attēlu.

Neaizmirstiet apskatīt mūsu rakstu "Zinātniskā ilustrācija: Ilustrācija: atslēga uz vizuālās zinātnes pasauli“.

Efektīvu zinātnisko figūru izveide dažu minūšu laikā
Saistītie raksti
logotipa abonements

Abonēt mūsu biļetenu

Ekskluzīvs augstas kvalitātes saturs par efektīvu vizuālo
komunikācija zinātnē.

- Ekskluzīvs ceļvedis
- Dizaina padomi
- Zinātnes jaunumi un tendences
- Mācību pamācības un veidnes