{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/sv_se\/tankarna-i-grafen-och-3d-protein-imaging-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph och 3D-avbildning av proteiner"},"content":{"rendered":"

Har du n\u00e5gonsin f\u00f6rs\u00f6kt skapa en molekyl\u00e4r illustration med klassiska molekyl\u00e4ra tittare? Om svaret \u00e4r ja, d\u00e5 vet du redan hur sv\u00e5rt det \u00e4r. <\/p>\n\n\n\n

Du m\u00e5ste hitta en gratisversion som inte kraschar din dator och \u00e4gna timmar \u00e5t att f\u00f6rs\u00f6ka lista ut hur det fungerar, eventuellt med viss kodning inblandad. K\u00e4mpa med program som \u00e4r komplicerade, ointuitiva och ofta kr\u00e4ver en licens.<\/p>\n\n\n\n

Det finns en l\u00f6sning, den kallas Imager f\u00f6r protein<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Skapa effektiva vetenskapsfigurer p\u00e5 n\u00e5gra minuter<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Om Protein Imager<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Imager f\u00f6r protein<\/a> \u00e4r en kostnadsfri webbaserad molekylvisare som g\u00f6r det m\u00f6jligt att skapa molekylillustrationer med n\u00e5gra f\u00e5 klick. Den har utvecklats av forskare fr\u00e5n 3D-studio f\u00f6r avbildning av proteiner<\/a> med m\u00e5let att effektivisera proteinillustrationen.<\/p>\n\n\n\n

Varf\u00f6r Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Det som skiljer Protein Imager fr\u00e5n andra molekyl\u00e4ra visare \u00e4r dess enkelhet och tillg\u00e4nglighet. Du beh\u00f6ver bara logga in med din e-postadress och en internetanslutning f\u00f6r att f\u00e5 tillg\u00e5ng till alla funktioner i Protein Imager.<\/p>\n\n\n\n

Protein Imager har ett anv\u00e4ndarv\u00e4nligt gr\u00e4nssnitt som g\u00f6r det m\u00f6jligt att anpassa molekylillustrationen in i minsta detalj. Anv\u00e4ndaren kan v\u00e4lja mellan olika f\u00f6rinst\u00e4llda stilar (tecknad, realistisk, grovkornig yta) eller anpassa visualiseringen som de vill.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
Exempel p\u00e5 f\u00f6rinst\u00e4llda stilar som kan anv\u00e4ndas p\u00e5 Protein Imager.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Molekyl\u00e4ra representationer (yta, tecknad film, sf\u00e4rer, pinnar etc.), f\u00e4rgl\u00e4gen, bakgrundsf\u00e4rger, skuggning och omgivande ocklusion \u00e4r bara n\u00e5gra av de inst\u00e4llbara parametrar som anv\u00e4ndarna kan leka med.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Dataanalysverktyg som struktur\u00f6verlagring, sekvensvisare och urval finns ocks\u00e5 tillg\u00e4ngliga f\u00f6r experter.<\/p>\n\n\n\n

Dessutom \u00e4r den helt online, vilket inneb\u00e4r att du inte beh\u00f6ver installera den lokalt, hantera f\u00f6r\u00e5ldrade versioner eller f\u00e5 problem med kompatibiliteten med ditt operativsystem. Varje rendering g\u00f6rs p\u00e5 en dedikerad server och renderingstiden \u00e4r vanligtvis mindre \u00e4n 1 minut, beroende p\u00e5 hur komplicerad illustrationen \u00e4r.<\/p>\n\n\n\n

\n
B\u00f6rja skapa p\u00e5 Mind the Graph nu<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Vem anv\u00e4nder Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager \u00e4r s\u00e5 enkelt och intuitivt att alla kan dra nytta av det, fr\u00e5n nyb\u00f6rjare till erfarna forskare. Anv\u00e4ndarna kan sl\u00e4ppa loss sin kreativitet och skapa vetenskapliga illustrationer f\u00f6r olika \u00e4ndam\u00e5l. <\/p>\n\n\n\n

M\u00e5nga forskare har anv\u00e4nt Protein Imager f\u00f6r att illustrera sina forskningsresultat i sina artiklar eller grafiska sammanfattningar. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Protein Imager anv\u00e4nds av Forskare Matteo Oliverio<\/a> f\u00f6r att skapa grafiska abstraktioner.<\/p>\n\n\n\n

De mer kreativa designar omslag till tidskrifter med Protein Imager. De som brinner f\u00f6r vetenskapskommunikation anv\u00e4nder Protein Imager f\u00f6r att utforma i\u00f6gonfallande bilder f\u00f6r sina inl\u00e4gg p\u00e5 sociala medier.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Professor Syma Khalid fr\u00e5n University of Oxford utformade omslaget f\u00f6r maj 2021 till tidskriften Structure, volym 29, nummer 5<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Slutligen har Protein Imager m\u00f6jlighet att exportera molekylerna som volymetriska filer (VRML2-format) som anv\u00e4nds av medicinska illustrat\u00f6rer i 3D-grafikprogram som Blender, Cinema 4D och Maya.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Portf\u00f6ljbild fr\u00e5n BioSciVisuals studio f\u00f6r vetenskapliga illustrationer.<\/a> Protein Imager anv\u00e4ndes f\u00f6r att illustrera de molekyler som ingick i den slutliga affischgrafiken tillsammans med professionella illustrationsverktyg.<\/p>\n\n\n\n

\n
\u00c4r du redo att komma ig\u00e5ng med Mind the Graph?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Kickstarta dina illustrationer<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

L\u00e5t oss g\u00e5 igenom de grundl\u00e4ggande stegen f\u00f6r att starta din illustrationsresa, ska vi?<\/p>\n\n\n\n

1 - Ladda den molekyl\u00e4ra strukturen<\/h3>\n\n\n\n

G\u00e5 till Imager f\u00f6r protein<\/a> och ladda upp valfri molekylstruktur fr\u00e5n din dator eller h\u00e4mta den fr\u00e5n biologiska databaser som Protein Data Bank eller OPM-databasen (Orientations of Proteins in Membranes).<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Anpassa<\/h3>\n\n\n\n

Via strukturpanelen till h\u00f6ger kan du v\u00e4lja molekyl\u00e4r representation och f\u00e4rgscheman, via visualiseringspanelerna kan du st\u00e4lla in skuggning, ljus, omgivande ocklusion och bara v\u00e4lja en f\u00f6rinst\u00e4lld stil.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - H\u00e4mta bilden<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e4r du \u00e4r n\u00f6jd med hur din struktur ser ut kan du beg\u00e4ra en rendering.<\/p>\n\n\n\n

Inom n\u00e5gra minuter kommer du att kunna ladda ner illustrationen i h\u00f6g kvalitet fr\u00e5n renderingspanelen. Observera att du m\u00e5ste registrera dig med en giltig e-postadress f\u00f6r att kunna beg\u00e4ra en rendering.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Dela den med dina medarbetare<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e4r du \u00e4r n\u00f6jd med ditt arbete kan du spara det i anv\u00e4ndarmappen som rymmer upp till 25 MB. Du kan f\u00e5 en l\u00e4nk f\u00f6r varje projekt som du kan dela med samarbetspartners s\u00e5 att alla \u00e4r p\u00e5 samma sida.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
B\u00f6rja anv\u00e4nda Mind The Graph just nu gratis!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph och 3D-avbildning av proteiner<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Naturligtvis utg\u00f6r 3D Protein Imaging och Mind the Graph det b\u00e4sta partnerskapet n\u00e5gonsin! <\/p>\n\n\n\n

Du kan anv\u00e4nda din 3D-proteinbild och ladda upp den till din skapelse p\u00e5 Mind the Graph p\u00e5 en sekund. F\u00f6r att l\u00e4ra dig hur du laddar upp bilder kan du titta p\u00e5 en handledningsvideo h\u00e4r<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Eller g\u00e5 till din Mind the Graph-skapelse, klicka p\u00e5 mer<\/strong> l\u00e4ngst ner i v\u00e4nstermenyn och sedan Uppladdning<\/strong>v\u00e4lj din bild och dra sedan bilden till din arbetsyta - klart! <\/p>\n\n\n\n

Dessutom kan du v\u00e4lja vilken illustration som helst som finns tillg\u00e4nglig p\u00e5 Mind the Graph Gallery f\u00f6r att anv\u00e4nda tillsammans med dina proteinbilder. <\/p>\n\n\n\n

Mind the Graph Gallery har m\u00e5nga visuellt tilltalande figurer f\u00f6r din forskning, med 40 000+ vetenskapligt korrekta illustrationer inom 80+ popul\u00e4ra omr\u00e5den. Om du beh\u00f6ver en illustration kan du hitta den p\u00e5 Mind the Graph. <\/p>\n\n\n\n

Men om du inte hittade vad du beh\u00f6ver eller om du beh\u00f6ver en mycket specifik illustration, kan du beg\u00e4ra en personlig illustration, och Mind the Graph illustrationsteam kommer att designa den \u00e5t dig. Allt du beh\u00f6ver g\u00f6ra \u00e4r att fylla i Mind the Graph Beg\u00e4r en ikon<\/strong> formul\u00e4r, inom din arbetsyta, med en kort f\u00f6rklaring och en referensbild. Inom en vecka f\u00e5r du din personliga illustration. <\/p>\n\n\n\n

Fantastiskt, eller hur? <\/p>\n\n\n\n

Se videon om hur du skapar din vetenskapsfigur med Mind the Graph och anv\u00e4nd externa bilder fr\u00e5n 3D Protein Imaging.<\/p>\n\n\n\n

\n