Já tentou criar uma ilustração molecular com os espectadores moleculares clássicos? Se a resposta for sim, então você já conhece a luta. 

Você tem que encontrar uma versão gratuita que não trave seu computador e passar horas tentando descobrir como ele funciona, possivelmente com alguma codificação envolvida. Lute com programas que são complicados, não intuitivos e muitas vezes exigem uma licença.

Existe uma solução, ela se chama Imaginador de proteínas!

Sobre o Protein Imager

Imaginador de proteínas é um visualizador molecular gratuito baseado na web para criar ilustrações moleculares em poucos cliques. Ele foi desenvolvido por cientistas da Estúdio de imagens proteicas 3D com o objetivo de racionalizar a ilustração proteica.

Por que o Protein Imager?

O que diferencia o Protein Imager de outros espectadores moleculares é sua simplicidade e acessibilidade. Para acessar todas as funcionalidades do Protein Imager, basta fazer o login com seu e-mail e uma conexão à Internet.

O Protein Imager tem uma interface de fácil utilização que permite a personalização da ilustração molecular em cada detalhe. O usuário pode escolher entre diferentes estilos predefinidos (cartoon, realista, superfície de grãos grossos) ou personalizar a visualização a seu gosto.

Exemplos de estilos pré-definidos que podem ser usados no Protein Imager.

Representações moleculares (superfície, desenho animado, esferas, bastões, etc.), modos de coloração, cores de fundo, sombreamento e oclusão ambiente são apenas alguns dos parâmetros sintonizáveis com os quais os usuários podem brincar.

Ferramentas de análise de dados como superposição de estruturas, visualizador de seqüências e seleções também estão disponíveis para especialistas.

Além disso, é completamente on-line, o que significa que não há instalação local, não há como lidar com versões desatualizadas ou problemas de compatibilidade com seus sistemas operacionais. Cada renderização depende de um servidor dedicado e o tempo de renderização é normalmente inferior a 1 minuto, dependendo da complexidade da ilustração.

Quem usa o Protein Imager?

Desde a graduação até os cientistas mais experientes, o Protein Imager é tão fácil e intuitivo que todos podem se beneficiar com ele. Os usuários são livres para liberar sua criatividade e criar ilustrações científicas para diferentes propósitos. 

Muitos cientistas adotaram o Protein Imager para ilustrar os resultados de suas pesquisas em seus trabalhos ou resumos gráficos. 

Protein Imager utilizado por o cientista Matteo Oliverio para criar resumos gráficos.

Os mais criativos projetam capas de revistas com Protein Imager. Aqueles apaixonados pela comunicação científica usam o Protein Imager para projetar visuais atraentes para seus posts nas mídias sociais.

Professora Syma Khalid, da Universidade de Oxford produziu o projeto para a capa da revista Estrutura, Volume 29, Edição 5 de maio de 2021.

Finalmente, o Protein Imager tem a opção de exportar as moléculas como arquivos volumétricos (formato VRML2) usados por ilustradores médicos em programas gráficos 3D como o Blender, Cinema 4D, Maya.

Imagem do portfólio do estúdio de ilustração científica BioSciVisuals. O Protein Imager foi usado para ilustrar as moléculas incluídas no gráfico final do pôster, juntamente com ferramentas de ilustração profissional.

Dê o pontapé inicial em suas ilustrações

Vamos rever os passos básicos para iniciar sua jornada de ilustração, certo?

1 - Carregar a estrutura molecular

Ir para Imaginador de proteínas e carregar qualquer estrutura molecular de seu computador ou buscá-la em bancos de dados biológicos como o banco de dados Protein Data Bank ou o banco de dados Orientations of Proteins in Membranes (OPM).

2 - Personalizar

Através do painel de estrutura à direita escolha a representação molecular e esquemas de cores, através dos painéis de visualização sintonize as sombras, luzes, oclusão ambiente apenas escolha um estilo pré-definido.

3 - Obter a imagem

Quando estiver satisfeito com a aparência de sua estrutura, solicite a renderização.

Em alguns minutos, você poderá baixar a ilustração em alta qualidade a partir do painel de renderização. Note que para solicitar uma renderização você deve se inscrever com um endereço de e-mail válido.

4 - Compartilhe-o com seus colaboradores

Quando você estiver satisfeito com seu trabalho, você pode salvá-lo na pasta do usuário que armazena até 25MB. Você pode obter um link para cada projeto para compartilhar com os colaboradores para que todos fiquem na mesma página.

Mind the Graph e 3D Protein Imaging

Naturalmente, o 3D Protein Imaging e o Mind the Graph formam a melhor parceria de todos os tempos! 

Você pode usar sua imagem de proteína 3D e carregá-la em sua criação no Mind the Graph em um segundo. Para aprender a carregar imagens, você pode assistir a um vídeo tutorial aqui mesmo

Ou, vá para sua criação do Mind the Graph, clique em Mais na parte inferior do seu menu esquerdo, então Uploadescolha sua imagem, e depois de carregada, escolha e arraste a imagem para seu espaço de trabalho, e pronto! 

Além disso, você pode escolher qualquer ilustração disponível na Galeria Mind the Graph para usar junto com suas imagens de proteínas. 

A Galeria Mind the Graph tem muitas figuras visualmente atraentes para sua pesquisa, com mais de 40 000 ilustrações cientificamente precisas em mais de 80 campos populares. Se você precisar de uma ilustração, você pode encontrá-la no Mind the Graph. 

Mesmo assim, se você não encontrou o que precisa ou se precisa de uma ilustração muito específica, você pode solicitar uma ilustração personalizada, e a equipe de ilustração do Mind the Graph irá projetá-la para você. Tudo o que você precisa fazer é preencher o Mind the Graph Solicite um Ícone dentro de seu espaço de trabalho, com uma breve explicação e uma imagem de referência. Dentro de uma semana, você receberá sua ilustração personalizada. 

Incrível, certo? 

Confira o vídeo sobre como você pode criar sua figura científica usando o Mind the Graph e usar imagens externas a partir de imagens de proteína 3D.

Este artigo foi escrito em colaboração com Martina Maritan, Oficial de Comunicação em Imagem de Proteína 3D.

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