![\"\"](\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2023\/02\/banner-blog-trial-01.jpg\")
<\/a><\/figure><\/div>\n\n\nRozwa\u017caj\u0105c szczeg\u00f3\u0142owo badanie<\/h2>\n\n\n\n
W biopr\u00f3bkach klinicznych promieniowanie UV (UV) zosta\u0142o powi\u0105zane z czerniakiem sk\u00f3ry, ale mechanizmy epigenetyczne le\u017c\u0105ce u podstaw tych mechanizm\u00f3w nie zosta\u0142y jeszcze okre\u015blone. Wieloetniczna kohorta 112 kom\u00f3rek czerniaka sk\u00f3ry zosta\u0142a w\u0142\u0105czona do tego badania w celu profilowania klinicznego, epigenomu (metylomu DNA), genomu i transkryptomu. W badaniu tym zidentyfikowano indukowane promieniowaniem UV zmiany w szlakach immunologicznych i regulacyjnych, kt\u00f3re mog\u0105 by\u0107 czynnikami wywo\u0142uj\u0105cymi raka w wielu UMIC.<\/p>\n\n\n\n
Opr\u00f3cz tego, \u017ce jest najbardziej krytycznie zaanga\u017cowanym genem, TAPBP (gen bia\u0142ka wi\u0105\u017c\u0105cego Tap) jest krytycznie zaanga\u017cowany w funkcje odporno\u015bciowe, z kilkoma miejscami metylacji zmienionymi przez promieniowanie UV, kt\u00f3re zosta\u0142y zweryfikowane przez ukierunkowane sekwencjonowanie, zapewniaj\u0105c mo\u017cliwo\u015bci zastosowania klinicznego. MHC-I oddzia\u0142uje z transporterem zwi\u0105zanym z przetwarzaniem antygenu poprzez TAPBP, cz\u0142onka nadrodziny immunoglobulin. Wiele nowotwor\u00f3w wykaza\u0142o obni\u017con\u0105 regulacj\u0119 bia\u0142ka TAPBP (tapasin), kt\u00f3ra jest przywracana po ekspozycji na cytokiny.\u00a0<\/p>\n\n\n\n
Sugeruje to, \u017ce niedob\u00f3r ekspresji TAPBP mo\u017ce by\u0107 spowodowany raczej dysregulacj\u0105 ni\u017c zmianami strukturalnymi. Naukowcy odkryli, \u017ce poziomy metylacji DNA TAPBP s\u0105 znacz\u0105co odwrotnie zwi\u0105zane z transkrypcj\u0105 i \u017ce ta ostatnia jest zmieniana w wyniku ekspozycji na promieniowanie UV, a nie to\u017csamo\u015bci patologicznej czerniaka. Ani czerniaki sk\u00f3ry, ani czerniaki akralne bez mutacji UV nie wykaza\u0142y r\u00f3\u017cnic w metylacji.<\/p>\n\n\n\n
Opr\u00f3cz odkry\u0107 skoncentrowanych na TAPBP, odkryli oni, \u017ce mutacje UV s\u0105 zwi\u0105zane z szeregiem zmian epigenetycznych, kt\u00f3re wp\u0142ywaj\u0105 na metylom czerniaka sk\u00f3ry. Wyniki wskazuj\u0105, \u017ce czerniaki sk\u00f3ry, niezale\u017cnie od tego, czy s\u0105 zmutowane UV, czy nie, mog\u0105 wymaga\u0107 oddzielnej klasyfikacji, mimo \u017ce uwa\u017ca si\u0119, \u017ce maj\u0105 to samo patologiczne\/kom\u00f3rkowe pochodzenie. Wynika to z faktu, \u017ce krajobraz epigenomiczny, z kt\u00f3rego si\u0119 wywodz\u0105, mo\u017ce zawiera\u0107 zar\u00f3wno markery ekspozycji, jak i linii kom\u00f3rkowej. <\/p>\n\n\n\n
W badaniu tym zastosowano wiele zaawansowanych technologii do pr\u00f3bek czerniaka sk\u00f3ry i akralu, w tym WGS, WES, sekwencjonowanie RNA i profilowanie metylomu DNA, wraz z najnowocze\u015bniejszymi narz\u0119dziami bioinformatycznymi. Naukowcy wykorzystali publicznie dost\u0119pne dane i uzupe\u0142nili je o nowe zbiory danych, kt\u00f3re obejmowa\u0142y wi\u0119ksze rozmiary pr\u00f3bek, szersze pokrycie genomiczne, kompleksowe oceny fenotypowe, dobrze zachowane zamro\u017cone pr\u00f3bki tkanek oraz ocen\u0119 czerniak\u00f3w poza sk\u00f3rnymi i etnicznymi innymi ni\u017c Europejczycy. <\/p>\n\n\n\n
Praca ta zaowocowa\u0142a nast\u0119puj\u0105cymi wynikami<\/h2>\n\n\n\n
(1) Odkrywanie biomarker\u00f3w, kt\u00f3re mo\u017cna wykorzysta\u0107 do stratyfikacji ryzyka zachorowania na raka;<\/p>\n\n\n\n
(2) Ulepszona klasyfikacja typ\u00f3w czerniaka w ich obr\u0119bie i pomi\u0119dzy nimi; <\/p>\n\n\n\n
(3) Identyfikacja czynnik\u00f3w molekularnych, kt\u00f3re mog\u0105 by\u0107 odpowiedzialne za melanomagenez\u0119 i kt\u00f3re mog\u0105 by\u0107 celem terapii; <\/p>\n\n\n\n
(4) Zwi\u0119kszenie wiedzy na temat patobiologii czerniaka w celu zmniejszenia r\u00f3\u017cnic w populacji.<\/p>\n\n\n\n
Badanie to stanowi map\u0119 drogow\u0105 dla podobnych bada\u0144 genowo-\u015brodowiskowych w innych typach czerniaka i obejmuje zar\u00f3wno powszechne, jak i rzadsze czerniaki.<\/p>\n\n\n\n
Skuteczniejszy spos\u00f3b przekazywania dok\u0142adnych informacji naukowych<\/h2>\n\n\n\n
Ten artyku\u0142 badawczy jest bardzo interesuj\u0105cy i \u0142atwy do zrozumienia, g\u0142\u00f3wnie ze wzgl\u0119du na pi\u0119kne ilustracje graficzne. Wykresy zosta\u0142y utworzone przy u\u017cyciu Mind the Graph<\/a> narz\u0119dzie. Ilustracja graficzna mo\u017ce przynie\u015b\u0107 czytelnikowi korzy\u015bci na wiele sposob\u00f3w. Mo\u017cesz spr\u00f3bowa\u0107 podnie\u015b\u0107 poziom swoich bada\u0144, rejestruj\u0105c si\u0119 za darmo w Mind the Graph i wypr\u00f3bowuj\u0105c swoj\u0105 pierwsz\u0105 ilustracj\u0119 naukow\u0105.
Nie zapomnij zapozna\u0107 si\u0119 z naszym artyku\u0142em \"Ilustracja naukowa: Klucz do \u015bwiata wizualnej nauki<\/a>“. <\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/scientifically-accurate-posters.png\")
<\/figure><\/div>\n\n\n