{"id":8728,"date":"2019-04-23T16:35:01","date_gmt":"2019-04-23T19:35:01","guid":{"rendered":"https:\/\/blog.mindthegraph.com\/?p=8728"},"modified":"2022-10-18T08:23:59","modified_gmt":"2022-10-18T11:23:59","slug":"visual-abstract-example","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/visueel-abstract-voorbeeld\/","title":{"rendered":"Visuele samenvatting gemaakt door gebruiker om het onderzoeksartikel \"Optimized Small-Molecule Pull-Downs Define MLBP1 as an Acyl-Lipid-Binding Protein\" door Yelena Sterlin uit te leggen."},"content":{"rendered":"

Een visueel abstract is niet gemakkelijk te maken, maar het is een blijvertje. Daarom tonen we graag het geweldige werk van onze gebruikers als inspirerend voorbeeld van een visuele samenvatting. Wij willen wetenschappers in staat stellen een meer visuele en bereikbare wetenschap mogelijk te maken.<\/p>\n

In de post laat ik u een stukje van het oorspronkelijke onderzoek zien door Yelena Sterlin<\/a> en collega's. Zij is promovenda aan de faculteit Landbouw, Voedsel en Milieu van de Hebreeuwse Universiteit van Jeruzalem.<\/p>\n

Haar nieuwe paper Geoptimaliseerde Small-Molecule Pull-Downs defini\u00ebren MLBP1 als een acyl-lipide-bindend eiwit.<\/a> <\/strong>brengt licht op de eiwit-metaboliet interacties in planten, met focus op de abscisinezuur (ABA) receptoren. Ze is ook een mind the graph abonnee, dus maakte ze een infographic in let op de grafiek<\/a> om hun methodologie uit te leggen.<\/p>\n

Het belang van START-domein-gerelateerde eiwitten<\/strong><\/h2>\n

 <\/p>\n

Volgens Nature Magazine<\/a>abscisinezuur (ABA) is het belangrijkste fytohormoon dat betrokken is bij de abiotische stressrespons en de aanpassing daaraan. Het is ook een kandidaat-landbouwmiddel. ABA werd voor het eerst ontdekt in de jaren zestig. Sindsdien is gebleken dat het een belangrijke regulator is van uiteenlopende processen zoals dormantie, kieming, zaadontwikkeling en reacties op biotische en abiotische stress.<\/p>\n

De vroegste gebeurtenissen in de ABA-signaleringsroute zijn de binding van ABA aan de PYR\/PYL\/RCAR-receptoren. De receptoren behoren tot de START-domein superfamilie.<\/p>\n

De START-eiwitdomeinen zijn een lipide-bindend domein dat aanwezig is in genomen van bacteri\u00ebn, protisten, gist, planten en dieren. Ze komen echter vaker voor in planten. Volgens Schrick<\/a>De aanwezigheid van START-domeinen in evolutionair verre soorten zoals dieren en planten suggereert een geconserveerd mechanisme voor interactie van eiwitten met lipiden\/sterolen.<\/p>\n

Het artikel gepubliceerd in The Plant Journal<\/a> richt zich op PYR\/PYL\/RCARs ABA-receptoren. De onderzoekers besloten een methode te optimaliseren voor de identificatie van START-domein en START-domein-gerelateerde eiwitliganden in planten, omdat \"de liganden van START-domeinen zijn zowel bij dieren als bij planten onmisbaar voor de goede werking van hun eiwit, en van START-domeinen bij planten is aangetoond dat zij betrokken zijn bij essenti\u00eble fysiologische processen\".<\/em><\/p>\n

Een visueel overzicht van de methodologie<\/strong><\/h2>\n

 <\/p>\n

Om hun methodologie uit te leggen, maakten de wetenschappers een infographic met mind the graph illustraties. Het is opvallend en gemakkelijker te begrijpen. <\/strong><\/h4>\n

 <\/p>\n

De onderstaande infographic toont de experimentele workflow. Zoals u kunt zien, hebben zij vier START-eiwitten tot expressie gebracht en gezuiverd. Zij filtreerden en incubeerden het supernatant met native oplosbare fractie met behulp van streptavidine sepharose, een affiniteitshars voor betrouwbare en hoge-resolutie zuivering van biomoleculen. Vervolgens analyseerden zij aliquots met behulp van western blot. Om het ligand te identificeren, elueerden zij putatieve liganden en onderwierpen deze aan een LC-MS-systeemanalyse (vloeistofchromatografie en massaspectrometrie). De moleculaire structuur van de vermeende liganden van belang werd bepaald door tandem massaspectrometrie.<\/p>\n

 <\/p>\n

\"visuele<\/p>\n

De auteurs presenteerden een goede techniek voor het eerste onderzoek naar eiwitliganden in planten. Zij pasten de aanpak aan om START-liganden te ontdekken. De methode kan echter worden toegepast op liganden van verschillende chemische aard door aanpassing van de analysecondities.<\/p>\n

Als u uw onderzoek wilt laten zien met behulp van wetenschappelijke illustraties en visuele samenvattingen, kunt u ook Mind the Graph gebruiken. Dus, ben je klaar om je communicatie in de wetenschap te verbeteren?<\/p>\n

\"voorbeeld_250\"<\/a><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Een visueel abstract is niet gemakkelijk te maken, maar het is een blijvertje. Daarom tonen we graag het geweldige werk van onze gebruikers als inspirerend voorbeeld van een visuele samenvatting. We willen wetenschappers in staat stellen om een meer visuele en bereikbare wetenschap mogelijk te maken. In deze post laat ik u een stukje zien van de [...]<\/p>","protected":false},"author":11,"featured_media":8741,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"image","meta":[],"categories":[193,40],"tags":[291,96,292,245,294,295,554,775,293,382],"yoast_head":"\nVisual abstract created by Mind the Graph user. Attractive scientific figure!<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"See the visual abstract created by the MindtheGraph subscriber Yelena Sterling to explain her research in an attractive and instructive way. Awesome job!\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/visueel-abstract\/visual-abstract-example\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"nl_NL\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"Visual abstract created by Mind the Graph user. Attractive scientific figure!\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"See the visual abstract created by the MindtheGraph subscriber Yelena Sterling to explain her research in an attractive and instructive way. Awesome job!\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/visueel-abstract\/visual-abstract-example\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Mind the Graph Blog\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2019-04-23T19:35:01+00:00\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2022-10-18T11:23:59+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2019\/04\/cover-yelena.png\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"622\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"379\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Fabiola Soares\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Geschreven door\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Fabiola Soares\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Geschatte leestijd\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"3 minuten\" \/>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"Visual abstract created by Mind the Graph user. Attractive scientific figure!","description":"See the visual abstract created by the MindtheGraph subscriber Yelena Sterling to explain her research in an attractive and instructive way. Awesome job!","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/visueel-abstract\/visual-abstract-example\/","og_locale":"nl_NL","og_type":"article","og_title":"Visual abstract created by Mind the Graph user. Attractive scientific figure!","og_description":"See the visual abstract created by the MindtheGraph subscriber Yelena Sterling to explain her research in an attractive and instructive way. Awesome job!","og_url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/visueel-abstract\/visual-abstract-example\/","og_site_name":"Mind the Graph Blog","article_published_time":"2019-04-23T19:35:01+00:00","article_modified_time":"2022-10-18T11:23:59+00:00","og_image":[{"width":622,"height":379,"url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2019\/04\/cover-yelena.png","type":"image\/png"}],"author":"Fabiola Soares","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Geschreven door":"Fabiola Soares","Geschatte leestijd":"3 minuten"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/visual-abstract-example\/","url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/visual-abstract-example\/","name":"Visual abstract created by Mind the Graph user. Attractive scientific figure!","isPartOf":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#website"},"datePublished":"2019-04-23T19:35:01+00:00","dateModified":"2022-10-18T11:23:59+00:00","author":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/5592c012d89648325be9b0f3c3f91132"},"description":"See the visual abstract created by the MindtheGraph subscriber Yelena Sterling to explain her research in an attractive and instructive way. Awesome job!","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/visual-abstract-example\/#breadcrumb"},"inLanguage":"nl","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/visual-abstract-example\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/visual-abstract-example\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"Visual abstract created by user to explain the research paper “Optimized Small\u2010Molecule Pull\u2010Downs Define MLBP1 as an Acyl\u2010Lipid\u2010Binding Protein” by Yelena Sterlin"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#website","url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/","name":"Mind the Graph Blog","description":"Your science can be beautiful!","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"nl"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/5592c012d89648325be9b0f3c3f91132","name":"Fabiola Soares","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"nl","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/7dca2c6a766aff1db898cc74c18284d8?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/7dca2c6a766aff1db898cc74c18284d8?s=96&d=mm&r=g","caption":"Fabiola Soares"},"url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/author\/fabiola\/"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8728"}],"collection":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/users\/11"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=8728"}],"version-history":[{"count":23,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8728\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":14568,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/8728\/revisions\/14568"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media\/8741"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=8728"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=8728"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nl\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=8728"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}