![\"\"](\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2023\/02\/banner-blog-trial-01.jpg\")
<\/a><\/figure><\/div>\n\n\nDe studie in detail beschouwen<\/h2>\n\n\n\n
In klinische biospecimens is UV-straling (UV) in verband gebracht met cutane melanomen, maar de onderliggende epigenetische mechanismen zijn nog niet vastgesteld. Een multi-etnisch cohort van 112 cutane melanomen werd in deze studie opgenomen voor klinische, epigenome (DNA methylome), genoom en transcriptome profiling. In deze studie identificeren zij UV-ge\u00efnduceerde veranderingen in immunologische en regulerende pathways die kanker kunnen aanwakkeren in multi-OMICs.<\/p>\n\n\n\n
TAPBP (Tap binding protein gene) is niet alleen het meest kritisch betrokken gen, maar is ook kritisch betrokken bij de immuunfunctie, met verschillende door UV veranderde methyleringsplaatsen die door gerichte sequencing zijn gevalideerd en klinisch toepasbare mogelijkheden bieden. MHC-I interageert met de transporter geassocieerd met antigeenverwerking via TAPBP, een lid van de immunoglobuline superfamilie. Bij een aantal vormen van kanker is downregulatie van het TAPBP-eiwit (tapasin) aangetoond, die wordt hersteld na blootstelling aan cytokinen.\u00a0<\/p>\n\n\n\n
Dit suggereert dat gebrekkige TAPBP-expressie eerder veroorzaakt wordt door dysregulatie dan door structurele veranderingen. De onderzoekers vonden dat de DNA-methyleringsniveaus van TAPBP significant omgekeerd evenredig zijn met de transcriptie en dat deze laatste eerder verandert als gevolg van UV-blootstelling dan van de pathologische identiteit van melanomen. Noch bij niet-UV-mutante cutane noch bij acrale melanomen werd differenti\u00eble methylering gevonden.<\/p>\n\n\n\n
Naast de bevindingen met betrekking tot TAPBP vonden zij dat UV-mutaties in verband worden gebracht met een reeks epigenetische wijzigingen die het methyloom van cutane melanomen be\u00efnvloeden. De resultaten wijzen erop dat cutane melanomen, of zij nu UV-mutant of niet-UV-mutant zijn, wellicht afzonderlijk moeten worden geclassificeerd, ook al wordt aangenomen dat zij dezelfde pathologische\/cellulaire oorsprong hebben. Dit komt doordat het epigenomische landschap waarvan zij zijn afgeleid zowel markers van blootstelling als van cellijn kan bevatten. <\/p>\n\n\n\n
In deze studie werden meerdere krachtige technologie\u00ebn toegepast op cutane en acrale melanoommonsters, waaronder WGS, WES, RNA-sequencing en DNA-methyloombrede profilering, samen met geavanceerde bio-informatica-instrumenten. De onderzoekers gebruikten openbaar beschikbare gegevens en vulden deze aan met nieuwe datasets, waaronder grotere steekproefgrootten, een bredere genomische dekking, uitgebreide fenotypische beoordelingen, goed bewaarde ingevroren weefselmonsters en evaluatie van melanomen naast cutane en andere etniciteiten dan Europeanen. <\/p>\n\n\n\n
Deze werkzaamheden hebben de volgende resultaten opgeleverd<\/h2>\n\n\n\n
(1) Het ontdekken van biomarkers die kunnen worden gebruikt om het kankerrisico te stratificeren;<\/p>\n\n\n\n
(2) Verbeterde classificatie van melanoomtypes binnen en tussen deze types; <\/p>\n\n\n\n
(3) Moleculaire factoren identificeren die verantwoordelijk zouden kunnen zijn voor melanomagenese en waarop de therapie kan worden gericht; <\/p>\n\n\n\n
(4) Vergroten van de kennis over de pathobiologie van melanoom om verschillen tussen bevolkingsgroepen te verminderen.<\/p>\n\n\n\n
Deze studie biedt een routekaart voor vergelijkbaar gen-omgevingsonderzoek bij andere soorten melanoom en bestrijkt zowel veel voorkomende als minder frequente melanomen.<\/p>\n\n\n\n
Een effectievere manier om accurate wetenschappelijke informatie te communiceren<\/h2>\n\n\n\n
Dit onderzoeksdocument is zeer interessant en gemakkelijk te begrijpen, vooral vanwege de prachtige grafische illustraties. De grafieken zijn gemaakt met behulp van de Mind the Graph<\/a> gereedschap. Een grafische illustratie kan de lezer op verschillende manieren ten goede komen. U kunt proberen uw onderzoek op niveau te brengen door u gratis aan te melden bij Mind the Graph en uw eerste wetenschappelijke figuur uit te proberen.
Vergeet niet ons artikel \"Wetenschappelijke illustratie: De sleutel tot een wereld van visuele wetenschap<\/a>“. <\/p>\n\n\n\n![\"\"](\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/scientifically-accurate-posters.png\")
<\/figure><\/div>\n\n\n