{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/nb\/tankegrafen-og-3d-proteinavbildning-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph og 3D-proteinavbildning"},"content":{"rendered":"

Har du noen gang pr\u00f8vd \u00e5 lage en molekyl\u00e6r illustrasjon med klassiske molekyl\u00e6re visningsverkt\u00f8y? Hvis svaret er ja, vet du allerede hvor vanskelig det er. <\/p>\n\n\n\n

Du m\u00e5 finne en gratisversjon som ikke f\u00e5r datamaskinen til \u00e5 krasje, og du m\u00e5 bruke timevis p\u00e5 \u00e5 finne ut hvordan det fungerer, eventuelt med litt koding involvert. Kjempe med programmer som er kompliserte, lite intuitive og ofte krever lisens.<\/p>\n\n\n\n

Det finnes en l\u00f8sning som heter Proteinavbildning<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Lag effektive vitenskapelige figurer p\u00e5 f\u00e5 minutter<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Om Protein Imager<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Proteinavbildning<\/a> er en gratis, nettbasert molekylfremviser som kan brukes til \u00e5 lage molekyl\u00e6re illustrasjoner med noen f\u00e5 klikk. Den ble utviklet av forskere fra Studio for 3D-proteinavbildning<\/a> med m\u00e5l om \u00e5 effektivisere proteinillustrasjonen.<\/p>\n\n\n\n

Hvorfor Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Det som skiller Protein Imager fra andre molekyl\u00e6re visningsverkt\u00f8y, er enkelheten og tilgjengeligheten. Du trenger bare \u00e5 logge p\u00e5 med e-postadressen din og en internettforbindelse for \u00e5 f\u00e5 tilgang til alle funksjonene i Protein Imager.<\/p>\n\n\n\n

Protein Imager har et brukervennlig grensesnitt som gj\u00f8r det mulig \u00e5 tilpasse den molekyl\u00e6re illustrasjonen i alle detaljer. Brukeren kan velge mellom ulike forh\u00e5ndsinnstilte stiler (tegneserieaktig, realistisk, grovkornet overflate) eller tilpasse visualiseringen etter eget \u00f8nske.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
Eksempler p\u00e5 forh\u00e5ndsinnstilte stiler som kan brukes p\u00e5 Protein Imager.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Molekyl\u00e6re representasjoner (overflate, tegneserie, kuler, pinner osv.), fargemodus, bakgrunnsfarger, skyggelegging og omgivende okklusjon er bare noen av de justerbare parametrene som brukerne kan leke med.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Dataanalyseverkt\u00f8y som strukturoverlagring, sekvensvisning og utvalg er ogs\u00e5 tilgjengelig for eksperter.<\/p>\n\n\n\n

I tillegg er det helt nettbasert, noe som betyr at du slipper lokal installasjon, utdaterte versjoner og kompatibilitetsproblemer med operativsystemene dine. Hver gjengivelse skjer p\u00e5 en dedikert server, og gjengivelsestiden er vanligvis under 1 minutt, avhengig av illustrasjonens kompleksitet.<\/p>\n\n\n\n

\n
Begynn \u00e5 skape hos Mind the Graph n\u00e5<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Hvem bruker Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager er s\u00e5 enkelt og intuitivt at alle kan dra nytte av det, fra studenter til erfarne forskere. Brukerne kan slippe kreativiteten l\u00f8s og lage vitenskapelige illustrasjoner til ulike form\u00e5l. <\/p>\n\n\n\n

Mange forskere har tatt i bruk Protein Imager for \u00e5 illustrere forskningsresultatene sine i artikler eller grafiske sammendrag. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Protein Imager brukt av forsker Matteo Oliverio<\/a> for \u00e5 lage grafiske abstrakter.<\/p>\n\n\n\n

De mer kreative designer tidsskriftomslag med Protein Imager. De som er lidenskapelig opptatt av forskningskommunikasjon, bruker Protein Imager til \u00e5 designe i\u00f8ynefallende bilder til innlegg p\u00e5 sosiale medier.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Professor Syma Khalid fra Universitetet i Oxford laget designet til omslaget for mai 2021 av tidsskriftet Structure, Volume 29, Issue 5.<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Til slutt har Protein Imager muligheten til \u00e5 eksportere molekylene som volumetriske filer (VRML2-format) som brukes av medisinske illustrat\u00f8rer i 3D-grafikkprogrammer som Blender, Cinema 4D og Maya.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Portef\u00f8ljebilde fra portef\u00f8ljen til BioSciVisuals vitenskapelige illustrasjonsstudio.<\/a> Protein Imager ble brukt til \u00e5 illustrere molekylene som inng\u00e5r i den endelige plakatgrafikken, sammen med profesjonelle illustrasjonsverkt\u00f8y.<\/p>\n\n\n\n

\n
Er du klar til \u00e5 begynne hos Mind the Graph?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

F\u00e5 fart p\u00e5 illustrasjonene dine<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Skal vi g\u00e5 gjennom de grunnleggende trinnene for \u00e5 starte illustrasjonsreisen?<\/p>\n\n\n\n

1 - Last inn molekylstrukturen<\/h3>\n\n\n\n

G\u00e5 til Proteinavbildning<\/a> og laste opp en hvilken som helst molekylstruktur fra datamaskinen eller hente den fra biologiske databaser som Protein Data Bank eller OPM-databasen (Orientations of Proteins in Membranes).<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Tilpass<\/h3>\n\n\n\n

I strukturpanelet til h\u00f8yre kan du velge molekyl\u00e6r representasjon og fargevalg, og i visualiseringspanelene kan du stille inn skygger, lys og omgivende okklusjon og velge en forh\u00e5ndsinnstilt stil.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - Hent bildet<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e5r du er forn\u00f8yd med konstruksjonens utseende, kan du be om rendering.<\/p>\n\n\n\n

Om noen f\u00e5 minutter kan du laste ned illustrasjonen i h\u00f8y kvalitet fra renderingspanelet. Merk at du m\u00e5 registrere deg med en gyldig e-postadresse for \u00e5 be om en gjengivelse.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Del den med samarbeidspartnerne dine<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e5r du er forn\u00f8yd med arbeidet ditt, kan du lagre det i brukermappen som kan lagre opptil 25 MB. Du kan f\u00e5 en lenke for hvert prosjekt som du kan dele med samarbeidspartnere, slik at alle er p\u00e5 samme side.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
Begynn \u00e5 bruke Mind The Graph gratis n\u00e5!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph og 3D-proteinavbildning<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Selvf\u00f8lgelig er 3D Protein Imaging og Mind the Graph det beste partnerskapet noensinne! <\/p>\n\n\n\n

Du kan bruke 3D-proteinbildet ditt og laste det opp i skapelsen din p\u00e5 Mind the Graph p\u00e5 et \u00f8yeblikk. Hvis du vil vite hvordan du laster opp bilder, kan du se en oppl\u00e6ringsvideo. her<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Eller du kan g\u00e5 til Mind the Graph-opprettelsen og klikke p\u00e5 Mer om dette<\/strong> nederst i menyen til venstre, og deretter Last opp<\/strong>velg bildet ditt, og n\u00e5r det er lastet inn, velger du det og drar det til arbeidsomr\u00e5det, og ferdig! <\/p>\n\n\n\n

I tillegg kan du velge hvilken som helst illustrasjon som er tilgjengelig p\u00e5 Mind the Graph Gallery, og bruke den sammen med proteinbildene dine. <\/p>\n\n\n\n

Mind the Graph Gallery har mange visuelt tiltalende figurer for forskningen din, med mer enn 40 000 vitenskapelig n\u00f8yaktige illustrasjoner innen mer enn 80 popul\u00e6re fagomr\u00e5der. Hvis du trenger en illustrasjon, finner du den hos Mind the Graph. <\/p>\n\n\n\n

Hvis du likevel ikke finner det du trenger, eller hvis du trenger en helt spesiell illustrasjon, kan du be om en personlig illustrasjon, og Mind the Graphs illustrasjonsteam vil designe den for deg. Alt du trenger \u00e5 gj\u00f8re er \u00e5 fylle ut Mind the Graph Be om et ikon<\/strong> skjema, inne i arbeidsomr\u00e5det ditt, med en kort forklaring og et referansebilde. I l\u00f8pet av en uke f\u00e5r du din personlige illustrasjon. <\/p>\n\n\n\n

Utrolig, ikke sant? <\/p>\n\n\n\n

Se videoen om hvordan du kan lage en vitenskapelig figur ved hjelp av Mind the Graph og bruke eksterne bilder fra 3D Protein Imaging.<\/p>\n\n\n\n

\n