XTALKDB：シグナル伝達経路のクロストークに関するデータベース論文レビュー

この驚くべき記事は、XTALKDBのデータを要約した統計を持ち出しています。著者はわずか数分で、XTALKDBにある種の分布を説明するインフォグラフィックを作成しました。

人間は視覚的な生き物ですから、研究内容をいくらでも詳しく説明するには、やはり画像が一番です。

科学者たちは、特定のシグナル伝達経路のペアと、それらが観察される生物種や組織との間のクロストークを記録したデータベースを開発した

生物科学科のサラ・サム率いる研究グループ（2016年）は、受容体が外部シグナルを感知することで、中間タンパク質の活動が変化することを報告しました。

その結果、転写因子が制御され、標的遺伝子の発現が調節される。XTalkDBは、パスウェイのペアごとに、クロストークが発見された実験条件について詳細な情報を記録している。

細胞はシグナル伝達経路を経由して環境を評価し、応答する。シグナル伝達経路は通常、受容体、中間シグナル伝達タンパク質、転写因子および標的遺伝子の間の制御的および物理的相互作用の明確に定義されたセットを含んでいる。

XTalkDBのウェブサイトでは、研究者が興味のあるパスウェイや分子を1つ以上指定してクエリーを実行することで、クロストーク情報を閲覧できる使いやすいインターフェイスが提供されています。

調査対象となったのは650組。

XTalkDBの根底にある手作業によるキュレーションプロセスには限界があり、特にデータベースのカバレッジを広げようとすると限界があります」と、改善の可能性を語ります。

私たちは、クロストークを記録する可能性に基づいて出版物を評価する自然言語処理のフレームワークを開発する予定です。そうすれば、キュレーターは格付けの高い論文に注目することができます」と彼らは認めています。

で分析することができます。アルトメトリック本紙が載っているデータ 次元でNIHから資金提供を受けた全論文の中で、すべての指標の最上位部分を占める。

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