{"id":11803,"date":"2020-10-28T09:30:35","date_gmt":"2020-10-28T11:30:35","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=11803"},"modified":"2022-10-18T08:09:32","modified_gmt":"2022-10-18T11:09:32","slug":"rt-pcr-test-for-coronavirus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/it\/test-rt-pcr-per-coronavirus\/","title":{"rendered":"Il test RT-PCR per il Coronavirus"},"content":{"rendered":"<p><span style=\"font-weight: 400;\">Da molte cose che si sono sentite sul COVID-19 nel 2020, una cosa in mezzo a tutte \u00e8 il test usato per rilevare se qualcuno \u00e8 contaminato dal virus, il famoso test RT-PCR o solo PCR.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Sicuramente avrete gi\u00e0 sentito parlare di questo test, da un medico o nei notiziari. Il test PCR viene utilizzato per rilevare la presenza (o meno) del virus nel corpo di una persona.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il test RT-PCR non \u00e8 l'unico in grado di rilevare il virus, ma \u00e8, rispetto agli altri metodi, quello pi\u00f9 accurato e affidabile. Un altro test \u00e8 quello sierologico convenzionale che rileva i livelli di anticorpi specifici nei campioni di sangue.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Le lettere in RT-PCR stanno per <\/span><b>Reazione a catena della polimerasi a trascrizione inversa<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">\u00c8 stata utilizzata per decenni dagli scienziati per produrre copie multiple di materiale genetico.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">In altre parole, in questo caso, pi\u00f9 materiale genetico del SARS-CoV-2, che viene utilizzato come impronta digitale per attestare la presenza del virus in campioni di naso, orecchie o saliva raccolti dai pazienti. Se ci sono virus nascosti nel campione, anche in piccole quantit\u00e0, sar\u00e0 in grado di rilevarli grazie al suo ciclo di copia-incolla. Ecco perch\u00e9 il test RT-PCR \u00e8 cos\u00ec affidabile.<\/span><\/p>\n<p><b>Il test<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> \u00e8 un metodo con due fasi all'interno del ciclo di temperatura, che esegue un processo di copia-incolla di un pezzo di materiale genetico, sia esso DNA o RNA.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il test richiede un <\/span><b>macchina termociclatrice<\/b><span style=\"font-weight: 400;\"> che ha un preciso <\/span><b>controllo della temperatura e del tempo<\/b><span style=\"font-weight: 400;\">. Attraverso molteplici cicli di temperatura, il materiale genetico virale aumenter\u00e0. Un esempio di ciclo di temperatura \u00e8 mostrato qui di seguito.<\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/polymerase-chain-reaction-steps.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11804 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/polymerase-chain-reaction-steps.png\" alt=\"\" width=\"567\" height=\"391\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/polymerase-chain-reaction-steps.png 567w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/polymerase-chain-reaction-steps-300x207.png 300w\" sizes=\"(max-width: 567px) 100vw, 567px\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il metodo richiede due enzimi principali, la trascrittasi inversa (ecco perch\u00e9 \"RT\" nel titolo) e la DNA-polimerasi. Ognuno di essi ha una fase d'azione e una funzione. Nella figura sopra, la fase gialla del ciclo \u00e8 quella in cui agisce la RT, mentre la fase rossa \u00e8 quella in cui la DNA-polimerasi svolge il suo lavoro.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il primo enzima crea il filamento di DNA complementare dal virus RNA, permettendo al secondo enzima di svolgere il lavoro di copia-incolla dal nuovo filamento di DNA appena creato, aumentando la quantit\u00e0 di materiale genetico presente. Questa amplificazione permette di caratterizzare e\/o manipolare il materiale genetico, quando in una quantit\u00e0 minore non sarebbe possibile.<\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/dna-polyemrase.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11806 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/dna-polyemrase.png\" alt=\"\" width=\"375\" height=\"154\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/dna-polyemrase.png 375w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/dna-polyemrase-300x123.png 300w\" sizes=\"(max-width: 375px) 100vw, 375px\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Perch\u00e9 tutto questo processo avvenga, gli enzimi hanno bisogno dell'aiuto di una piccola (o grande) molecola chiamata PRIMER. La funzione del primer \u00e8 quella di indicare il punto in cui l'enzima deve iniziare a estendere i filamenti, senza di esso il processo di copia-incolla della DNA-polimerasi non inizierebbe.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il primer pu\u00f2 essere scelto con una forma casuale o specifica. \u00c8 molto importante conoscere la mappa genetica del v\u00edrus in casi come questo, in modo da poter utilizzare primer specifici per aumentare l'efficienza e l'affidabilit\u00e0 dei risultati.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Se siete curiosi come noi e desiderate conoscere maggiori dettagli sulla RT-PCR, potete consultare ulteriori dettagli\u00a0<\/span><a href=\"https:\/\/pubmed.ncbi.nlm.nih.gov\/14667534\/\"><span style=\"font-weight: 400;\"> questo articolo scientifico <\/span><span style=\"font-weight: 400;\">qui<\/span><\/a><span style=\"font-weight: 400;\">\u00a0 ma in sostanza ecco tutto ci\u00f2 che serve per eseguire il test:<\/span><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><strong>Il materiale genetico virale, l'RNA<\/strong><\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/viral-genetic-material-the-rna.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11808 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/viral-genetic-material-the-rna.png\" alt=\"\" width=\"370\" height=\"157\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/viral-genetic-material-the-rna.png 370w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/viral-genetic-material-the-rna-300x127.png 300w\" sizes=\"(max-width: 370px) 100vw, 370px\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><b>Trascrittasi inversa ed enzimi DNA-polimerasi<\/b><\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/reverse-transcriptase-and-dna-polymerase-enzymes.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11809 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/reverse-transcriptase-and-dna-polymerase-enzymes.png\" alt=\"\" width=\"280\" height=\"143\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><b>PRIMER<\/b><\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/primers.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11810 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/primers.png\" alt=\"\" width=\"177\" height=\"94\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><b>Trifosfati nucleosidici<\/b><\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/nucleoside-triphosphates.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone size-full wp-image-11811\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/nucleoside-triphosphates.png\" alt=\"\" width=\"188\" height=\"70\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><b>E coloranti fluorescenti di segnalazione:\u00a0<\/b><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Per conoscere i risultati di un campione che pu\u00f2 essere o meno contaminato dal virus COVID-19, il test con coloranti reporter fluorescenti viene utilizzato in combinazione con il test RT-PCR. Il test si basa sulla presenza o meno del segnale fluorescente di un campione. In assenza di segnale, il test pu\u00f2 essere considerato negativo o falso negativo. In presenza di un segnale intenso si pu\u00f2 concludere non solo che il v\u00edrus \u00e8 positivo, ma anche che la malattia \u00e8 in fase avanzata.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"color: #000000;\"><b>Mescolare tutti gli ingredienti e metterli nella macchina termociclatrice.\u00a0<\/b><\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">La prima fase del test \u00e8 illustrata nell'infografica successiva. L'enzima RT crea la prima copia del materiale genetico del virus presente nel campione. Di seguito si vede la seconda fase del metodo RT-PCR. Il primer indica la posizione di partenza e la DNA-polimerasi, attraverso una reazione enzimatica, inizia a estendere i filamenti di DNA.<\/span><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11812 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\" alt=\"Il test RT-PCR per il Coronavirus\" width=\"512\" height=\"150\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png 512w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine-300x88.png 300w\" sizes=\"(max-width: 512px) 100vw, 512px\" \/><\/a><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/01-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11813 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/01-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\" alt=\"\" width=\"472\" height=\"384\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/01-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png 472w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/01-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine-300x244.png 300w\" sizes=\"(max-width: 472px) 100vw, 472px\" \/><\/a><\/p>\n<p><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/02-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\"><img decoding=\"async\" loading=\"lazy\" class=\"alignnone wp-image-11814 size-full\" src=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/02-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png\" alt=\"\" width=\"466\" height=\"364\" srcset=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/02-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine.png 466w, https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/02-mix-all-the-ingredients-and-put-it-in-the-thermocycle-machine-300x234.png 300w\" sizes=\"(max-width: 466px) 100vw, 466px\" \/><\/a><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Infine, questa immagine \u00e8 una micrografia elettronica del virus SARS-CoV-2, ed \u00e8 possibile vedere perfettamente la struttura del virus. Non \u00e8 bellissimo?\u00a0\u00a0<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Il test \u00e8 complesso e non \u00e8 cos\u00ec semplice come sembra, ma scommetto che con le infografiche \u00e8 stato molto pi\u00f9 facile capire il quadro generale di come funziona, giusto?<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">\u00c8 possibile farlo con qualsiasi informazione scientifica che si desideri utilizzando\u00a0<\/span><a href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/\"> <span style=\"font-weight: 400;\">Mind the Graph<\/span><\/a><span style=\"font-weight: 400;\">. La piattaforma \u00e8 qui per darvi l'autonomia di comunicare meglio le informazioni scientifiche. Per saperne di pi\u00f9 su come utilizzare la piattaforma e se avete bisogno di aiuto, contattateci.<\/span><b>!<\/b><\/p>\n<p><b>Riferimento<\/b><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">AI, T. et al. Correlazione tra TAC del torace e test RT-PCR per la malattia da Coronavirus 2019 (COVID-19) in Cina: A Report of 1014 Cases. Radiology, v. 296, n. 2, pagg. E32-E40, 26 febbr. 2020.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">GIBELLINI, D. et al. Rilevazione quantitativa della carica virale del virus dell'immunodeficienza umana di tipo 1 (HIV-1) mediante tecnica SYBR green real-time RT-PCR in pazienti sieropositivi all'HIV-1. Journal of Virological Methods, v. 115, n. 2, p. 183-189, 1 febbraio 2004.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">JAMES, D. Un protocollo semplice e affidabile per il rilevamento del virus della scanalatura del fusto del melo mediante RT-PCR e in un saggio PCR multiplex. Journal of Virological Methods, v. 83, n. 1, p. 1-9, 1 dez. 1999.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">LI, Y. et al. Problemi di stabilit\u00e0 del test RT-PCR della SARS-CoV-2 per i pazienti ospedalizzati con diagnosi clinica di COVID-19. Journal of Medical Virology, v. 92, n. 7, pagg. 903-908, 2020.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">LIAO, C.-S. et al. Sistema RT-PCR miniaturizzato per la diagnosi di virus a base di RNA. Nucleic Acids Research, v. 33, n. 18, p. e156-e156, 1 out. 2005.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">MOHAN, A. et al. Prevalenza di infezioni virali rilevate mediante PCR e RT-PCR in pazienti con esacerbazione acuta della BPCO: una revisione sistematica. Respirology, v. 15, n. 3, pagg. 536-542, 2010.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">NOLAN, T.; HANDS, R. E.; BUSTIN, S. A. Quantificazione dell'mRNA mediante RT-PCR in tempo reale. Nature Protocols, v. 1, n. 3, p. 1559-1582, ago. 2006.<\/span><\/p>\n<p><span style=\"font-weight: 400;\">Nuovo Coronavirus SARS-CoV-2 | Questa trasmissione elettronica mi... | Flickr. Disponibile in: . Accesso em: 23 jul. 2020. <\/span><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":4,"featured_media":11847,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[959,28],"tags":[388,799,554,798,250],"yoast_head":"<!-- This site is optimized with the Yoast SEO plugin v19.9 - https:\/\/yoast.com\/wordpress\/plugins\/seo\/ -->\n<title>The RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. 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