{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/hu\/elme-a-graf-es-3d-feherje-kepalkotas-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph \u00e9s 3D feh\u00e9rje k\u00e9palkot\u00e1s"},"content":{"rendered":"

Pr\u00f3b\u00e1lt\u00e1l m\u00e1r molekul\u00e1ris illusztr\u00e1ci\u00f3t k\u00e9sz\u00edteni klasszikus molekul\u00e1ris n\u00e9z\u0151kkel? Ha a v\u00e1lasz igen, akkor m\u00e1r ismeri a k\u00fczdelmet. <\/p>\n\n\n\n

Tal\u00e1lnia kell egy ingyenes verzi\u00f3t, amely nem \u00fcti \u00f6ssze a sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9p\u00e9t, \u00e9s \u00f3r\u00e1kat kell elt\u00f6ltenie azzal, hogy kital\u00e1lja, hogyan m\u0171k\u00f6dik, esetleg n\u00e9mi k\u00f3dol\u00e1ssal. K\u00fczdj olyan programokkal, amelyek bonyolultak, nem intuit\u00edvak, \u00e9s gyakran licencet ig\u00e9nyelnek.<\/p>\n\n\n\n

Van megold\u00e1s, a neve Protein Imager<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Hat\u00e9kony tudom\u00e1nyos \u00e1br\u00e1k l\u00e9trehoz\u00e1sa percek alatt<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

A Protein Imagerr\u0151l<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager<\/a> egy ingyenes, webes molekul\u00e1ris n\u00e9zeget\u0151 program, amellyel n\u00e9h\u00e1ny kattint\u00e1ssal molekul\u00e1ris illusztr\u00e1ci\u00f3kat k\u00e9sz\u00edthet. A tud\u00f3sok fejlesztett\u00e9k ki a 3D feh\u00e9rje k\u00e9palkot\u00f3 st\u00fadi\u00f3<\/a> a feh\u00e9rjeillusztr\u00e1ci\u00f3 racionaliz\u00e1l\u00e1s\u00e1nak c\u00e9lj\u00e1val.<\/p>\n\n\n\n

Mi\u00e9rt Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Ami a Protein Imager-t megk\u00fcl\u00f6nb\u00f6zteti a t\u00f6bbi molekul\u00e1ris n\u00e9z\u0151t\u0151l, az az egyszer\u0171s\u00e9ge \u00e9s hozz\u00e1f\u00e9rhet\u0151s\u00e9ge. A Protein Imager \u00f6sszes funkci\u00f3j\u00e1nak el\u00e9r\u00e9s\u00e9hez csak be kell jelentkeznie az e-mail c\u00edm\u00e9vel \u00e9s egy internetkapcsolattal.<\/p>\n\n\n\n

A Protein Imager felhaszn\u00e1l\u00f3bar\u00e1t fel\u00fclettel rendelkezik, amely lehet\u0151v\u00e9 teszi a molekul\u00e1ris illusztr\u00e1ci\u00f3 minden r\u00e9szlet\u00e9ben t\u00f6rt\u00e9n\u0151 testreszab\u00e1s\u00e1t. A felhaszn\u00e1l\u00f3 v\u00e1laszthat a k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 el\u0151re be\u00e1ll\u00edtott st\u00edlusok k\u00f6z\u00fcl (rajzfilmes, realisztikus, durva szemcs\u00e9s fel\u00fclet), vagy tetsz\u00e9se szerint testre szabhatja a vizualiz\u00e1ci\u00f3t.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
P\u00e9ld\u00e1k a Protein Imagerben haszn\u00e1lhat\u00f3 el\u0151re be\u00e1ll\u00edtott st\u00edlusokra.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

A molekul\u00e1ris \u00e1br\u00e1zol\u00e1sok (fel\u00fclet, rajzfilm, g\u00f6mb\u00f6k, p\u00e1lcik\u00e1k stb.), sz\u00ednez\u00e9si m\u00f3dok, h\u00e1tt\u00e9rsz\u00ednek, \u00e1rny\u00e9kol\u00e1s \u00e9s k\u00f6rnyezeti okkl\u00fazi\u00f3 csak n\u00e9h\u00e1ny a hangolhat\u00f3 param\u00e9terek k\u00f6z\u00fcl, amelyekkel a felhaszn\u00e1l\u00f3k j\u00e1tszhatnak.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Az adatelemz\u0151 eszk\u00f6z\u00f6k, mint p\u00e9ld\u00e1ul a strukt\u00fara szuperpoz\u00edci\u00f3, a szekvencia megtekint\u0151 \u00e9s a szelekci\u00f3k a szak\u00e9rt\u0151k sz\u00e1m\u00e1ra is rendelkez\u00e9sre \u00e1llnak.<\/p>\n\n\n\n

R\u00e1ad\u00e1sul teljesen online, ami azt jelenti, hogy nincs helyi telep\u00edt\u00e9s, nincs gond az elavult verzi\u00f3kkal vagy az oper\u00e1ci\u00f3s rendszerekkel val\u00f3 kompatibilit\u00e1si probl\u00e9m\u00e1kkal. Minden renderel\u00e9s egy dedik\u00e1lt szerverre t\u00e1maszkodik, \u00e9s a renderel\u00e9si id\u0151 jellemz\u0151en kevesebb mint 1 perc, az illusztr\u00e1ci\u00f3 \u00f6sszetetts\u00e9g\u00e9t\u0151l f\u00fcgg\u0151en.<\/p>\n\n\n\n

\n
Kezdjen alkotni az Mind the Graph-n\u00e9l most<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Ki haszn\u00e1lja a Protein Imager-t?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

A Protein Imager az egyetemist\u00e1kt\u00f3l a tapasztalt tud\u00f3sokig olyan egyszer\u0171 \u00e9s intuit\u00edv, hogy mindenki haszn\u00e1t veheti. A felhaszn\u00e1l\u00f3k szabadon engedhetik szabadj\u00e1ra kreativit\u00e1sukat, \u00e9s k\u00fcl\u00f6nb\u00f6z\u0151 c\u00e9lokra tudom\u00e1nyos illusztr\u00e1ci\u00f3kat k\u00e9sz\u00edthetnek. <\/p>\n\n\n\n

Sz\u00e1mos tud\u00f3s alkalmazta a Protein Imager-t, hogy kutat\u00e1si eredm\u00e9nyeit szeml\u00e9ltesse a tanulm\u00e1nyaiban vagy grafikus \u00f6sszefoglal\u00f3iban. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

A Protein Imager \u00e1ltal haszn\u00e1lt tud\u00f3s Matteo Oliverio<\/a> grafikus absztraktok l\u00e9trehoz\u00e1s\u00e1hoz.<\/p>\n\n\n\n

A kreat\u00edvabbak Protein Imagerrel terveznek napl\u00f3bor\u00edt\u00f3kat. A tudom\u00e1nyos kommunik\u00e1ci\u00f3 ir\u00e1nt szenved\u00e9lyesen \u00e9rdekl\u0151d\u0151k a Protein Imager seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel szemet gy\u00f6ny\u00f6rk\u00f6dtet\u0151 vizu\u00e1lis anyagokat terveznek k\u00f6z\u00f6ss\u00e9gi m\u00e9di\u00e1s bejegyz\u00e9seikhez.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Syma Khalid professzor az Oxfordi Egyetemr\u0151l a Structure foly\u00f3irat 2021. m\u00e1jusi, 29. k\u00f6tet, 5. sz\u00e1m\u00e1nak bor\u00edt\u00f3terv\u00e9t k\u00e9sz\u00edtette.<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

V\u00e9g\u00fcl, a Protein Imager lehet\u0151s\u00e9get biztos\u00edt a molekul\u00e1k t\u00e9rfogati f\u00e1jlokk\u00e9nt (VRML2 form\u00e1tum) t\u00f6rt\u00e9n\u0151 export\u00e1l\u00e1s\u00e1ra, amelyet az orvosi illusztr\u00e1torok haszn\u00e1lnak olyan 3D-s grafikai programokban, mint a Blender, Cinema 4D, Maya.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

K\u00e9p a BioSciVisuals tudom\u00e1nyos illusztr\u00e1ci\u00f3s st\u00fadi\u00f3 portf\u00f3li\u00f3j\u00e1b\u00f3l.<\/a> A Protein Imager-t a professzion\u00e1lis illusztr\u00e1ci\u00f3s eszk\u00f6z\u00f6k mellett a v\u00e9gleges poszter grafik\u00e1ban szerepl\u0151 molekul\u00e1k illusztr\u00e1l\u00e1s\u00e1ra is haszn\u00e1lt\u00e1k.<\/p>\n\n\n\n

\n
K\u00e9szen \u00e1ll az Mind the Graph-n\u00e9l val\u00f3 munkakezd\u00e9sre?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Ind\u00edtsa el az illusztr\u00e1ci\u00f3kat<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Vegy\u00fck \u00e1t az alapvet\u0151 l\u00e9p\u00e9seket, hogy elkezdhess\u00fck az illusztr\u00e1ci\u00f3s utaz\u00e1st, rendben?<\/p>\n\n\n\n

1 - A molekulaszerkezet bet\u00f6lt\u00e9se<\/h3>\n\n\n\n

Menjen a Protein Imager<\/a> \u00e9s t\u00f6lts\u00f6n fel b\u00e1rmilyen molekulaszerkezetet a sz\u00e1m\u00edt\u00f3g\u00e9p\u00e9r\u0151l, vagy t\u00f6ltse le biol\u00f3giai adatb\u00e1zisokb\u00f3l, p\u00e9ld\u00e1ul a Protein Data Bankb\u00f3l vagy az OPM (Orientations of Proteins in Membranes) adatb\u00e1zisb\u00f3l.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Testreszab\u00e1s<\/h3>\n\n\n\n

A jobb oldali strukt\u00fara panelen kereszt\u00fcl v\u00e1lassza ki a molekul\u00e1ris \u00e1br\u00e1zol\u00e1st \u00e9s a sz\u00edns\u00e9m\u00e1kat, a vizualiz\u00e1ci\u00f3s panelen kereszt\u00fcl pedig hangolja az \u00e1rny\u00e9kol\u00e1st, a f\u00e9nyeket, a k\u00f6rnyezeti elfed\u00e9st, csak v\u00e1lasszon egy el\u0151re be\u00e1ll\u00edtott st\u00edlust.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - Szerezd meg a k\u00e9pet<\/h3>\n\n\n\n

Ha el\u00e9gedett a szerkezet megjelen\u00e9s\u00e9vel, k\u00e9rje a renderel\u00e9st.<\/p>\n\n\n\n

N\u00e9h\u00e1ny perc m\u00falva az illusztr\u00e1ci\u00f3t j\u00f3 min\u0151s\u00e9gben let\u00f6ltheti a renderel\u00e9si panelr\u0151l. Ne feledje, hogy a renderel\u00e9s ig\u00e9nyl\u00e9s\u00e9hez \u00e9rv\u00e9nyes e-mail c\u00edmmel kell regisztr\u00e1lnia.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Ossza meg munkat\u00e1rsaival<\/h3>\n\n\n\n

Ha el\u00e9gedett a munk\u00e1j\u00e1val, elmentheti azt a felhaszn\u00e1l\u00f3i mapp\u00e1ba, amely legfeljebb 25 MB-ot t\u00e1rol. Minden projekthez kaphatsz egy linket, amelyet megoszthatsz a munkat\u00e1rsakkal, \u00edgy mindenki egy oldalon \u00e1ll.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
Kezdje el haszn\u00e1lni a Mind The Graph-ot most ingyen!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph \u00e9s 3D feh\u00e9rje k\u00e9palkot\u00e1s<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Term\u00e9szetesen a 3D Protein Imaging \u00e9s az Mind the Graph a valaha volt legjobb partners\u00e9get alkotja! <\/p>\n\n\n\n

A 3D-s feh\u00e9rje k\u00e9p\u00e9t haszn\u00e1lhatja, \u00e9s egy m\u00e1sodperc alatt felt\u00f6ltheti az Mind the Graph-ben tal\u00e1lhat\u00f3 alkot\u00e1s\u00e1ba. A k\u00e9pek felt\u00f6lt\u00e9s\u00e9nek megtanul\u00e1s\u00e1hoz megn\u00e9zhet egy oktat\u00f3vide\u00f3t itt<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Vagy menjen az Mind the Graph l\u00e9trehoz\u00e1s\u00e1hoz, kattintson a Tov\u00e1bbi<\/strong> a bal oldali men\u00fc alj\u00e1n, majd Felt\u00f6lt\u00e9s<\/strong>, v\u00e1lassza ki a k\u00e9pet, majd miut\u00e1n bet\u00f6lt\u0151d\u00f6tt, v\u00e1lassza ki \u00e9s h\u00fazza a k\u00e9pet a munkater\u00fcletre, \u00e9s k\u00e9sz! <\/p>\n\n\n\n

Tov\u00e1bb\u00e1, b\u00e1rmelyik, az Mind the Graph Gal\u00e9ri\u00e1ban el\u00e9rhet\u0151 illusztr\u00e1ci\u00f3t kiv\u00e1laszthatja, hogy a feh\u00e9rj\u00e9k k\u00e9peivel egy\u00fctt haszn\u00e1lja. <\/p>\n\n\n\n

Az Mind the Graph Gal\u00e9ria sz\u00e1mos vizu\u00e1lisan vonz\u00f3 \u00e1br\u00e1t tartalmaz az \u00d6n kutat\u00e1saihoz, t\u00f6bb mint 40 000 tudom\u00e1nyosan pontos illusztr\u00e1ci\u00f3val t\u00f6bb mint 80 n\u00e9pszer\u0171 ter\u00fcleten. Ha sz\u00fcks\u00e9ge van egy illusztr\u00e1ci\u00f3ra, az Mind the Graph-n\u00e9l megtal\u00e1lhatja. <\/p>\n\n\n\n

Ha m\u00e9gsem tal\u00e1lta meg, amire sz\u00fcks\u00e9ge van, vagy ha nagyon k\u00fcl\u00f6nleges illusztr\u00e1ci\u00f3ra van sz\u00fcks\u00e9ge, k\u00e9rhet szem\u00e9lyre szabott illusztr\u00e1ci\u00f3t, \u00e9s az Mind the Graph illusztr\u00e1ci\u00f3s csapata megtervezi \u00d6nnek. Mind\u00f6ssze annyit kell tennie, hogy kit\u00f6lti az Mind the Graph Ikon k\u00e9r\u00e9se<\/strong> \u0171rlapot a munkater\u00fcleten bel\u00fcl, egy r\u00f6vid magyar\u00e1zattal \u00e9s egy referencia k\u00e9ppel. Egy h\u00e9ten bel\u00fcl megkapja a szem\u00e9lyre szabott illusztr\u00e1ci\u00f3t. <\/p>\n\n\n\n

Csod\u00e1latos, igaz? <\/p>\n\n\n\n

N\u00e9zze meg a vide\u00f3t arr\u00f3l, hogyan hozhatja l\u00e9tre tudom\u00e1nyos \u00e1br\u00e1j\u00e1t az Mind the Graph seg\u00edts\u00e9g\u00e9vel, \u00e9s hogyan haszn\u00e1lhatja a 3D Protein Imaging k\u00fcls\u0151 k\u00e9peit.<\/p>\n\n\n\n

\n