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<\/a><\/figure><\/div>\n\n\nConsid\u00e9rant l'\u00e9tude en d\u00e9tail<\/h2>\n\n\n\n
Dans les \u00e9chantillons biologiques cliniques, le rayonnement UV a \u00e9t\u00e9 associ\u00e9 au m\u00e9lanome cutan\u00e9, mais les m\u00e9canismes \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques qui sous-tendent ces m\u00e9canismes restent \u00e0 d\u00e9terminer. Une cohorte multiethnique de 112 cellules de m\u00e9lanome cutan\u00e9 a \u00e9t\u00e9 incluse dans cette \u00e9tude pour un profilage clinique, \u00e9pig\u00e9nomique (m\u00e9thylome de l'ADN), g\u00e9nomique et transcriptomique. Dans cette \u00e9tude, ils identifient les changements induits par les UV dans les voies immunologiques et de r\u00e9gulation qui peuvent \u00eatre des facteurs de cancer dans les multi-OMIC.<\/p>\n\n\n\n
En plus d'\u00eatre le g\u00e8ne le plus impliqu\u00e9, TAPBP (Tap binding protein gene) joue un r\u00f4le essentiel dans la fonction immunitaire, avec plusieurs sites de m\u00e9thylation alt\u00e9r\u00e9s par les UV qui ont \u00e9t\u00e9 valid\u00e9s par s\u00e9quen\u00e7age cibl\u00e9 et qui offrent des possibilit\u00e9s d'application clinique. Le CMH-I interagit avec le transporteur associ\u00e9 au traitement de l'antig\u00e8ne par l'interm\u00e9diaire de TAPBP, un membre de la superfamille des immunoglobulines. Un certain nombre de cancers ont montr\u00e9 une r\u00e9gulation \u00e0 la baisse de la prot\u00e9ine TAPBP (tapasin), qui est r\u00e9tablie apr\u00e8s l'exposition aux cytokines.\u00a0<\/p>\n\n\n\n
Cela sugg\u00e8re que l'expression d\u00e9ficiente de TAPBP pourrait \u00eatre caus\u00e9e par une dysr\u00e9gulation plut\u00f4t que par des changements structurels. Les chercheurs ont constat\u00e9 que les niveaux de m\u00e9thylation de l'ADN de la TAPBP sont inversement li\u00e9s \u00e0 la transcription et que cette derni\u00e8re est alt\u00e9r\u00e9e par l'exposition aux UV plut\u00f4t que par l'identit\u00e9 pathologique du m\u00e9lanome. Ni les m\u00e9lanomes cutan\u00e9s ni les m\u00e9lanomes acraux non mutants aux UV n'ont fait l'objet d'une m\u00e9thylation diff\u00e9rentielle.<\/p>\n\n\n\n
Outre les r\u00e9sultats centr\u00e9s sur le TAPBP, ils ont d\u00e9couvert que les mutations UV sont associ\u00e9es \u00e0 une s\u00e9rie d'alt\u00e9rations \u00e9pig\u00e9n\u00e9tiques qui affectent le m\u00e9thylome du m\u00e9lanome cutan\u00e9. Les r\u00e9sultats indiquent que les m\u00e9lanomes cutan\u00e9s, qu'ils soient mut\u00e9s par les UV ou non, doivent \u00eatre class\u00e9s s\u00e9par\u00e9ment m\u00eame s'ils sont cens\u00e9s avoir la m\u00eame origine pathologique\/cellulaire. En effet, le paysage \u00e9pig\u00e9nomique dont ils sont issus peut contenir \u00e0 la fois des marqueurs d'exposition et de lignage cellulaire. <\/p>\n\n\n\n
Plusieurs technologies puissantes ont \u00e9t\u00e9 appliqu\u00e9es aux \u00e9chantillons de m\u00e9lanomes cutan\u00e9s et acraux dans cette \u00e9tude, notamment le WGS, le WES, le s\u00e9quen\u00e7age de l'ARN et le profilage de l'ensemble du m\u00e9thylome de l'ADN, ainsi que des outils bioinformatiques de pointe. Les chercheurs ont utilis\u00e9 des donn\u00e9es accessibles au public et les ont compl\u00e9t\u00e9es par de nouveaux ensembles de donn\u00e9es, qui comprenaient des \u00e9chantillons de plus grande taille, une couverture g\u00e9nomique plus large, des \u00e9valuations ph\u00e9notypiques compl\u00e8tes, des \u00e9chantillons de tissus congel\u00e9s bien conserv\u00e9s, et l'\u00e9valuation de m\u00e9lanomes autres que cutan\u00e9s et d'ethnies autres qu'europ\u00e9ennes. <\/p>\n\n\n\n
Ces travaux ont abouti aux r\u00e9sultats suivants<\/h2>\n\n\n\n
(1) D\u00e9couvrir des biomarqueurs qui peuvent \u00eatre utilis\u00e9s pour stratifier le risque de cancer ;<\/p>\n\n\n\n
(2) Am\u00e9lioration de la classification des types de m\u00e9lanomes \u00e0 l'int\u00e9rieur de ceux-ci et entre eux ; <\/p>\n\n\n\n
(3) Identifier les moteurs mol\u00e9culaires qui pourraient \u00eatre responsables de la m\u00e9lanomag\u00e9n\u00e8se et qui peuvent \u00eatre cibl\u00e9s dans la th\u00e9rapie ; <\/p>\n\n\n\n
(4) Am\u00e9liorer les connaissances sur la pathobiologie du m\u00e9lanome afin de r\u00e9duire les disparit\u00e9s entre les populations.<\/p>\n\n\n\n
Cette \u00e9tude fournit une feuille de route pour des recherches similaires sur les g\u00e8nes et l'environnement dans d'autres types de m\u00e9lanome et couvre \u00e0 la fois les m\u00e9lanomes communs et moins fr\u00e9quents.<\/p>\n\n\n\n
Un moyen plus efficace de communiquer des informations scientifiques pr\u00e9cises<\/h2>\n\n\n\n
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