{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/mind-the-graph-ja-3d-proteiinikuvaus-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph ja 3D-proteiinikuvaus"},"content":{"rendered":"

Oletko koskaan yritt\u00e4nyt luoda molekyylikuvitusta klassisilla molekyylikatselukoneilla? Jos vastaus on \"kyll\u00e4\", tied\u00e4t jo, miten vaikeaa se on. <\/p>\n\n\n\n

Sinun on l\u00f6ydett\u00e4v\u00e4 ilmainen versio, joka ei kaada tietokonettasi, ja vietett\u00e4v\u00e4 tunteja yritt\u00e4en selvitt\u00e4\u00e4, miten se toimii, mahdollisesti koodaamalla. Taistele ohjelmien kanssa, jotka ovat monimutkaisia, vaikeaselkoisia ja vaativat usein lisenssin.<\/p>\n\n\n\n

On olemassa ratkaisu, sit\u00e4 kutsutaan Proteiinikuvantamislaite<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Luo tehokkaita tieteellisi\u00e4 lukuja minuuteissa<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Tietoja Protein Imagerista<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Proteiinikuvantamislaite<\/a> on ilmainen verkkopohjainen molekyylikuvausohjelma, jolla voit luoda molekyylikuvia muutamalla napsautuksella. Sen ovat kehitt\u00e4neet tutkijat 3D-proteiinikuvantamisen studio<\/a> tavoitteena on virtaviivaistaa proteiinien kuvitusta.<\/p>\n\n\n\n

Miksi Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager eroaa muista molekyylikuvausohjelmista sen yksinkertaisuuden ja helppok\u00e4ytt\u00f6isyyden ansiosta. Sinun tarvitsee vain kirjautua sis\u00e4\u00e4n s\u00e4hk\u00f6postiosoitteellasi ja internet-yhteydell\u00e4, jotta voit k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 kaikkia Protein Imagerin toimintoja.<\/p>\n\n\n\n

Protein Imager -ohjelmassa on k\u00e4ytt\u00e4j\u00e4yst\u00e4v\u00e4llinen k\u00e4ytt\u00f6liittym\u00e4, joka mahdollistaa molekyylikuvituksen mukauttamisen yksityiskohtaisesti. K\u00e4ytt\u00e4j\u00e4 voi valita eri esiasetetuista tyyleist\u00e4 (sarjakuvamainen, realistinen, karkearakeinen pinta) tai muokata visualisointia haluamallaan tavalla.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
Esimerkkej\u00e4 esiasetetuista tyyleist\u00e4, joita voidaan k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 Protein Imagerissa.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Molekyylien esitystavat (pinta, sarjakuva, pallot, tikut jne.), v\u00e4ritysmuodot, taustav\u00e4rit, varjostus ja ambient occlusion ovat vain joitakin parametreja, joilla k\u00e4ytt\u00e4j\u00e4t voivat leikki\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Asiantuntijoilla on my\u00f6s k\u00e4yt\u00f6ss\u00e4\u00e4n data-analyysity\u00f6kaluja, kuten rakenteiden p\u00e4\u00e4llekk\u00e4isyys, sekvenssin katselu ja valinnat.<\/p>\n\n\n\n

Lis\u00e4ksi se on t\u00e4ysin verkossa, mik\u00e4 tarkoittaa, ett\u00e4 sit\u00e4 ei tarvitse asentaa paikallisesti, ei k\u00e4sitell\u00e4 vanhentuneita versioita eik\u00e4 yhteensopivuusongelmia k\u00e4ytt\u00f6j\u00e4rjestelmien kanssa. Jokainen render\u00f6inti perustuu omaan palvelimeen, ja render\u00f6intiaika on tyypillisesti alle 1 minuutti kuvituksen monimutkaisuudesta riippuen.<\/p>\n\n\n\n

\n
Aloita luominen Mind the Graph:ss\u00e4 nyt<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Kuka k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 Protein Imageria?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager on niin helppok\u00e4ytt\u00f6inen ja intuitiivinen, ett\u00e4 kaikki voivat hy\u00f6ty\u00e4 siit\u00e4, olipa kyseess\u00e4 sitten opiskelija tai kokenut tutkija. K\u00e4ytt\u00e4j\u00e4t voivat vapauttaa luovuutensa ja luoda tieteellisi\u00e4 kuvituksia eri tarkoituksiin. <\/p>\n\n\n\n

Monet tutkijat ovat ottaneet Protein Imagerin k\u00e4ytt\u00f6\u00f6n havainnollistaakseen tutkimustuloksiaan papereissaan tai graafisissa tiivistelmiss\u00e4. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Proteiinikuvantamislaite, jota k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 tutkija Matteo Oliverio<\/a> graafisten abstraktien luomiseen.<\/p>\n\n\n\n

Luovimmat suunnittelevat lehden kannet Protein Imagerilla. Tieteellisest\u00e4 viestinn\u00e4st\u00e4 innostuneet k\u00e4ytt\u00e4v\u00e4t Protein Imageria suunnitellakseen huomiota her\u00e4tt\u00e4vi\u00e4 visuaalisia kuvia sosiaalisen median viesteihins\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Professori Syma Khalid Oxfordin yliopistosta. tuotti suunnittelun Structure-lehden toukokuun 2021 kanneksi, Volume 29, Issue 5.<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Lopuksi Protein Imager -ohjelmassa on mahdollisuus vied\u00e4 molekyylit tilavuustiedostoina (VRML2-muodossa), joita l\u00e4\u00e4ketieteelliset kuvittajat k\u00e4ytt\u00e4v\u00e4t 3D-grafiikkaohjelmissa, kuten Blenderiss\u00e4, Cinema 4D:ss\u00e4 ja Mayassa.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Portfolio kuva BioSciVisuals tieteellisen kuvitusstudion portfoliosta.<\/a> Protein Imageria k\u00e4ytettiin lopulliseen posterigrafiikkaan sis\u00e4ltyvien molekyylien havainnollistamiseen ammattimaisten kuvitusty\u00f6kalujen ohella.<\/p>\n\n\n\n

\n
Oletko valmis aloittamaan Mind the Graph:ss\u00e4?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

K\u00e4ynnist\u00e4 kuvituksesi<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

K\u00e4yd\u00e4\u00e4np\u00e4 l\u00e4pi perusaskeleet kuvitusmatkan aloittamiseksi.<\/p>\n\n\n\n

1 - Lataa molekyylirakenne<\/h3>\n\n\n\n

Siirry osoitteeseen Proteiinikuvantamislaite<\/a> ja ladata mink\u00e4 tahansa molekyylirakenteen tietokoneeltasi tai hakea sen biologisista tietokannoista, kuten Protein Data Bankista tai OPM-tietokannasta (Orientations of Proteins in Membranes).<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Mukauta<\/h3>\n\n\n\n

Oikealla olevan rakennepaneelin kautta voit valita molekyylien esityksen ja v\u00e4rimaailman, visualisointipaneelien kautta voit s\u00e4\u00e4t\u00e4\u00e4 varjostuksen, valot, ymp\u00e4rist\u00f6n peitt\u00e4vyyden ja valita esiasetetun tyylin.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - Hae kuva<\/h3>\n\n\n\n

Kun olet tyytyv\u00e4inen rakenteen ulkon\u00e4k\u00f6\u00f6n, pyyd\u00e4 render\u00f6inti\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

Muutamassa minuutissa voit ladata kuvituksen korkealaatuisena render\u00f6intipaneelista. Huomaa, ett\u00e4 render\u00f6inti\u00e4 pyyt\u00e4\u00e4kseen sinun on rekister\u00f6idytt\u00e4v\u00e4 voimassa olevalla s\u00e4hk\u00f6postiosoitteella.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Jaa se yhteisty\u00f6kumppaneidesi kanssa<\/h3>\n\n\n\n

Kun olet tyytyv\u00e4inen ty\u00f6h\u00f6si, voit tallentaa sen k\u00e4ytt\u00e4j\u00e4kansioon, johon mahtuu enint\u00e4\u00e4n 25 Mt. Voit saada jokaisesta projektista linkin, jonka voit jakaa yhteisty\u00f6kumppaneiden kanssa, jotta kaikki ovat samalla sivulla.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
Aloita Mind The Graphin k\u00e4ytt\u00f6 nyt ilmaiseksi!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph ja 3D-proteiinikuvaus<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Tietenkin 3D Protein Imaging ja Mind the Graph muodostavat parhaan mahdollisen kumppanuuden! <\/p>\n\n\n\n

Voit k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 3D-proteiinikuvaasi ja ladata sen luomukseesi Mind the Graph:ss\u00e4 sekunnissa. Jos haluat oppia, miten kuvia ladataan, voit katsoa opetusvideon. t\u00e4\u00e4ll\u00e4<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Tai siirry Mind the Graph-luomukseen, napsauta painiketta Lis\u00e4\u00e4<\/strong> vasemmanpuoleisen valikon alareunassa, sitten Lataa<\/strong>, valitse kuva, ja kun se on ladattu, valitse ja ved\u00e4 kuva ty\u00f6tilaan, ja valmis! <\/p>\n\n\n\n

Lis\u00e4ksi voit valita mink\u00e4 tahansa Mind the Graph-galleriassa saatavilla olevan kuvituksen k\u00e4ytett\u00e4v\u00e4ksi yhdess\u00e4 proteiinikuviesi kanssa. <\/p>\n\n\n\n

Mind the Graph-galleriassa on monia visuaalisesti houkuttelevia lukuja tutkimustasi varten. Yli 40 000 tieteellisesti tarkkaa kuvaa yli 80:lt\u00e4 suositulta alalta. Jos tarvitset kuvitusta, l\u00f6yd\u00e4t sen Mind the Graph:st\u00e4. <\/p>\n\n\n\n

Jos et kuitenkaan l\u00f6yt\u00e4nyt tarvitsemaasi kuvitusta tai jos tarvitset hyvin erityist\u00e4 kuvitusta, voit pyyt\u00e4\u00e4 henkil\u00f6kohtaista kuvitusta, ja Mind the Graph:n kuvitustiimi suunnittelee sen sinulle. Sinun ei tarvitse tehd\u00e4 muuta kuin t\u00e4ytt\u00e4\u00e4 Mind the Graph:n Kuvakkeen pyyt\u00e4minen<\/strong> lomake ty\u00f6tilan sis\u00e4ll\u00e4, jossa on lyhyt selitys ja viitekuva. Saat henkil\u00f6kohtaisen kuvituksesi viikon kuluessa. <\/p>\n\n\n\n

Uskomatonta, eik\u00f6? <\/p>\n\n\n\n

Katso video siit\u00e4, miten voit luoda tieteellisen hahmon Mind the Graph:n avulla ja k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 3D Protein Imagingin ulkoisia kuvia.<\/p>\n\n\n\n

\n