{"id":11803,"date":"2020-10-28T09:30:35","date_gmt":"2020-10-28T11:30:35","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=11803"},"modified":"2022-10-18T08:09:32","modified_gmt":"2022-10-18T11:09:32","slug":"rt-pcr-test-for-coronavirus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/rt-pcr-testi-koronavirukselle\/","title":{"rendered":"Koronaviruksen RT-PCR-testi"},"content":{"rendered":"

Monista asioista, joita olet kuullut COVID-19:st\u00e4 vuonna 2020, yksi asia kaiken keskell\u00e4 on testi, jota k\u00e4ytet\u00e4\u00e4n havaitsemaan, onko joku saanut viruksen, kuuluisa RT-PCR-testi tai vain PCR.<\/span><\/p>\n

Olet varmasti kuullut t\u00e4st\u00e4 testist\u00e4 jo aiemmin, joko l\u00e4\u00e4ketieteen ammattilaiselta tai uutisista. PCR-testi\u00e4 k\u00e4ytet\u00e4\u00e4n havaitsemaan viruksen esiintyminen (tai puuttuminen) jonkun elimist\u00f6ss\u00e4.<\/span><\/p>\n

RT-PCR-testi ei ole ainoa, jolla virus voidaan havaita, mutta se on muihin menetelmiin verrattuna tarkin ja luotettavin. Toinen testi on perinteinen serologinen testi, jolla havaitaan spesifiset vasta-ainepitoisuudet verin\u00e4ytteist\u00e4.<\/span><\/p>\n

Kirjaimet RT-PCR:ss\u00e4 tarkoittavat <\/span>K\u00e4\u00e4nteinen transkriptio polymeraasiketjureaktio<\/b>Tutkijat ovat k\u00e4ytt\u00e4neet sit\u00e4 vuosikymmeni\u00e4 geneettisen materiaalin moninkertaisten kopioiden tuottamiseen.<\/span><\/p>\n

Toisin sanoen t\u00e4ss\u00e4 tapauksessa SARS-CoV-2:n geneettist\u00e4 materiaalia, jota k\u00e4ytet\u00e4\u00e4n sormenj\u00e4lken\u00e4 viruksen esiintymisen osoittamiseksi potilaiden nen\u00e4st\u00e4, korvista tai syljest\u00e4 ker\u00e4tyiss\u00e4 n\u00e4ytteiss\u00e4. Jos n\u00e4ytteeseen on k\u00e4tketty viruksia jopa pieni\u00e4 m\u00e4\u00e4ri\u00e4, se pystyy havaitsemaan sen copy-paste-syklin vuoksi. Siksi RT-PCR-testi on niin luotettava.<\/span><\/p>\n

Testi<\/b> on menetelm\u00e4, jossa on periaatteessa kaksi vaihetta l\u00e4mp\u00f6tilajakson sis\u00e4ll\u00e4, jolloin geneettisen materiaalin, joko DNA:n tai RNA:n, kopiointi- ja liitt\u00e4misprosessi suoritetaan.<\/span><\/p>\n

Testi edellytt\u00e4\u00e4 <\/span>termosyklerikone<\/b> jolla on tarkka <\/span>l\u00e4mp\u00f6tilan ja ajan s\u00e4\u00e4t\u00f6<\/b>. Viruksen geneettinen materiaali lis\u00e4\u00e4ntyy useiden l\u00e4mp\u00f6tilasyklien aikana. Seuraavassa on esimerkki l\u00e4mp\u00f6tilakierrosta.<\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Menetelm\u00e4\u00e4n tarvitaan kaksi p\u00e4\u00e4entsyymi\u00e4, k\u00e4\u00e4nteinen transkriptaasi (siksi \"RT\" otsikossa) ja DNA-polymeraasi. Kummallakin niist\u00e4 on oma toimintavaiheensa ja teht\u00e4v\u00e4ns\u00e4. Yll\u00e4 olevassa kuvassa syklin keltainen vaihe on se, jolloin RT toimii, ja punainen vaihe on se, jolloin DNA-polymeraasi tekee teht\u00e4v\u00e4ns\u00e4.<\/span><\/p>\n

Ensimm\u00e4inen entsyymi tekee RNA-viruksesta komplementaarisen DNA-juosteen, jolloin toinen entsyymi voi suorittaa kopiointity\u00f6n uudesta, juuri tehdyst\u00e4 DNA-juosteesta, mik\u00e4 lis\u00e4\u00e4 geneettisen materiaalin m\u00e4\u00e4r\u00e4\u00e4. T\u00e4m\u00e4 monistaminen mahdollistaa geneettisen materiaalin karakterisoinnin ja\/tai manipuloinnin, kun se ei olisi mahdollista pienemm\u00e4ll\u00e4 m\u00e4\u00e4r\u00e4ll\u00e4.<\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Jotta kaikki t\u00e4m\u00e4 prosessi voisi tapahtua, entsyymit tarvitsevat apua pienelt\u00e4 (tai suurelta) molekyylilt\u00e4 nimelt\u00e4 PRIMER. Alukkeen teht\u00e4v\u00e4n\u00e4 on osoittaa paikka, jossa entsyymin pit\u00e4isi aloittaa s\u00e4ikeiden pident\u00e4minen, sill\u00e4 ilman sit\u00e4 DNA-polymeraasin kopiointiprosessi ei k\u00e4ynnisty.<\/span><\/p>\n

Pohjustusaine voidaan valita satunnaisesti tai tietyn muotoisena. T\u00e4llaisissa tapauksissa on eritt\u00e4in t\u00e4rke\u00e4\u00e4 tuntea viruksen geneettinen kartta, jotta voidaan k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 erityisi\u00e4 alukkeita tulosten tehokkuuden ja luotettavuuden lis\u00e4\u00e4miseksi.<\/span><\/p>\n

Jos olet utelias kuten mekin ja haluat tiet\u00e4\u00e4 lis\u00e4\u00e4 yksityiskohtia RT-PCR:st\u00e4, voit tarkistaa lis\u00e4tietoja\u00a0<\/span> t\u00e4m\u00e4 tieteellinen artikkeli <\/span>t\u00e4\u00e4ll\u00e4<\/span><\/a>\u00a0 mutta pohjimmiltaan t\u00e4ss\u00e4 on kaikki, mit\u00e4 testin tekemiseen tarvitaan:<\/span><\/p>\n

Viruksen geneettinen materiaali, RNA<\/strong><\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

K\u00e4\u00e4nteinen transkriptaasi ja DNA-polymeraasientsyymit<\/b><\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

PRIMERS<\/b><\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Nukleosiditrifosfaatit<\/b><\/span><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Ja fluoresoivat raportointiv\u00e4rit:\u00a0<\/b><\/span><\/p>\n

Jotta saataisiin selville COVID-19-viruksen saastuttaman tai saastuttamattoman n\u00e4ytteen tulokset, k\u00e4ytet\u00e4\u00e4n fluoresoivia v\u00e4riaineita yhdess\u00e4 RT-PCR-testin kanssa. M\u00e4\u00e4ritys perustuu n\u00e4ytteen fluoresoivan signaalin esiintymiseen tai puuttumiseen. Jos signaalia ei esiinny, testi voidaan todeta negatiiviseksi tai v\u00e4\u00e4r\u00e4n negatiiviseksi. Voimakkaan signaalin esiintyess\u00e4 voidaan todeta, ett\u00e4 virus on positiivinen ja ett\u00e4 kyseess\u00e4 on my\u00f6s pitk\u00e4lle edennyt tauti.<\/span><\/p>\n

Sekoita kaikki ainekset kesken\u00e4\u00e4n ja laita se l\u00e4mp\u00f6kiertokoneeseen.\u00a0<\/b><\/span><\/p>\n

Testin ensimm\u00e4inen vaihe on esitetty seuraavassa infograafissa. RT-entsyymi tekee ensimm\u00e4isen kopion n\u00e4ytteess\u00e4 olevan viruksen geneettisest\u00e4 materiaalista. Seuraavaksi n\u00e4et RT-PCR-menetelm\u00e4n toisen vaiheen. Aloitin osoittaa aloituspaikan ja DNA-polymeraasi alkaa entsymaattisen reaktion avulla pident\u00e4\u00e4 DNA-juosteita.<\/span><\/p>\n

\"Koronaviruksen<\/a><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

\"\"<\/a><\/p>\n

Lopuksi, t\u00e4m\u00e4 kuva on elektronimikroskooppikuva SARS-CoV-2 -viruksesta, ja siin\u00e4 on mahdollista n\u00e4hd\u00e4 t\u00e4ydellisesti viruksen rakenne. Eik\u00f6 olekin kaunista?\u00a0\u00a0<\/span><\/p>\n

Testi on monimutkainen, eik\u00e4 se ole niin yksinkertainen kuin milt\u00e4 se n\u00e4ytt\u00e4\u00e4, mutta veikkaan, ett\u00e4 infografiikan avulla oli paljon helpompi ymm\u00e4rt\u00e4\u00e4 kokonaiskuva siit\u00e4, miten se toimii, eik\u00f6 niin?<\/span><\/p>\n

Voit tehd\u00e4 sen mink\u00e4 tahansa tieteellisen tiedon kanssa k\u00e4ytt\u00e4m\u00e4ll\u00e4 seuraavia v\u00e4lineit\u00e4.\u00a0<\/span> Mind the Graph<\/span><\/a>. Alustan tarkoituksena on antaa sinulle itsen\u00e4isyytt\u00e4, jotta voit paremmin v\u00e4litt\u00e4\u00e4 tieteellist\u00e4 tietoa. Lue lis\u00e4\u00e4 alustan k\u00e4yt\u00f6st\u00e4, ja jos tarvitset apua, ota meihin yhteytt\u00e4.<\/span>!<\/b><\/p>\n

Viite<\/b><\/p>\n

AI, T. et al. Rintakeh\u00e4n TT- ja RT-PCR-testauksen korrelaatio vuoden 2019 koronavirustautia (COVID-19) varten Kiinassa: A Report of 1014 Cases. Radiology, v. 296, n. 2, s. E32-E40, 26 fev. 2020.<\/span><\/p>\n

GIBELLINI, D. et al. Ihmisen immuunikatoviruksen tyypin 1 (HIV-1) viruskuorman kvantitatiivinen toteaminen SYBR green reaaliaikaisella RT-PCR-tekniikalla HIV-1-seropositiivisilla potilailla. Journal of Virological Methods, v. 115, n. 2, s. 183-189, 1 fev. 2004.<\/span><\/p>\n

JAMES, D. Yksinkertainen ja luotettava protokolla omenan kantojen uritusviruksen havaitsemiseksi RT-PCR:ll\u00e4 ja moninkertaisella PCR-m\u00e4\u00e4rityksell\u00e4. Journal of Virological Methods, v. 83, n. 1, s. 1-9, 1 dez. 1999.<\/span><\/p>\n

LI, Y. ym. SARS-CoV-2:n RT-PCR-testien stabiilisuusongelmat sairaalahoidossa olevilla potilailla, joilla on kliinisesti diagnosoitu COVID-19. Journal of Medical Virology, v. 92, n. 7, s. 903-908, 2020.<\/span><\/p>\n

LIAO, C.-S. et al. Miniatyyri-RT-PCR-j\u00e4rjestelm\u00e4 RNA-pohjaisten virusten diagnosoimiseksi. Nucleic Acids Research, v. 33, n. 18, s. e156-e156, 1 out. 2005.<\/span><\/p>\n

MOHAN, A. et al. PCR:ll\u00e4 ja RT-PCR:ll\u00e4 havaittujen virusinfektioiden esiintyvyys potilailla, joilla on keuhkoahtaumataudin akuutti pahenemisvaihe: j\u00e4rjestelm\u00e4llinen katsaus. Respirology, v. 15, n. 3, s. 536-542, 2010.<\/span><\/p>\n

NOLAN, T.; HANDS, R. E.; BUSTIN, S. A. mRNA:n kvantitatiivinen m\u00e4\u00e4ritt\u00e4minen reaaliaikaisella RT-PCR:ll\u00e4. Nature Protocols, v. 1, n. 3, s. 1559-1582, sitten. 2006.<\/span><\/p>\n

Uusi koronavirus SARS-CoV-2 | T\u00e4m\u00e4 siirtoelektroni... | Flickr. Dispon\u00edvel em: . Acesso em: 23 jul. 2020. <\/span><\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"","protected":false},"author":4,"featured_media":11847,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":[],"categories":[959,28],"tags":[388,799,554,798,250],"yoast_head":"\nThe RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog<\/title>\n<meta name=\"description\" content=\"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. You will get in-depth information about this test of Coronavirus.\" \/>\n<meta name=\"robots\" content=\"index, follow, max-snippet:-1, max-image-preview:large, max-video-preview:-1\" \/>\n<link rel=\"canonical\" href=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/\" \/>\n<meta property=\"og:locale\" content=\"fi_FI\" \/>\n<meta property=\"og:type\" content=\"article\" \/>\n<meta property=\"og:title\" content=\"The RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog\" \/>\n<meta property=\"og:description\" content=\"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. You will get in-depth information about this test of Coronavirus.\" \/>\n<meta property=\"og:url\" content=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/\" \/>\n<meta property=\"og:site_name\" content=\"Mind the Graph Blog\" \/>\n<meta property=\"article:published_time\" content=\"2020-10-28T11:30:35+00:00\" \/>\n<meta property=\"article:modified_time\" content=\"2022-10-18T11:09:32+00:00\" \/>\n<meta property=\"og:image\" content=\"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/the-rt-pcr-test-for-coronavirus-2.png\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:width\" content=\"1110\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:height\" content=\"600\" \/>\n\t<meta property=\"og:image:type\" content=\"image\/png\" \/>\n<meta name=\"author\" content=\"Fabricio Pamplona\" \/>\n<meta name=\"twitter:card\" content=\"summary_large_image\" \/>\n<meta name=\"twitter:label1\" content=\"Written by\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data1\" content=\"Fabricio Pamplona\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:label2\" content=\"Est. reading time\" \/>\n\t<meta name=\"twitter:data2\" content=\"5 minutes\" \/>\n<!-- \/ Yoast SEO plugin. -->","yoast_head_json":{"title":"The RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog","description":"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. You will get in-depth information about this test of Coronavirus.","robots":{"index":"index","follow":"follow","max-snippet":"max-snippet:-1","max-image-preview":"max-image-preview:large","max-video-preview":"max-video-preview:-1"},"canonical":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/","og_locale":"fi_FI","og_type":"article","og_title":"The RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog","og_description":"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. You will get in-depth information about this test of Coronavirus.","og_url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/","og_site_name":"Mind the Graph Blog","article_published_time":"2020-10-28T11:30:35+00:00","article_modified_time":"2022-10-18T11:09:32+00:00","og_image":[{"width":1110,"height":600,"url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/wp-content\/uploads\/2020\/10\/the-rt-pcr-test-for-coronavirus-2.png","type":"image\/png"}],"author":"Fabricio Pamplona","twitter_card":"summary_large_image","twitter_misc":{"Written by":"Fabricio Pamplona","Est. reading time":"5 minutes"},"schema":{"@context":"https:\/\/schema.org","@graph":[{"@type":"WebPage","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/tr\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/","url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/tr\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/","name":"The RT-PCR Test for Coronavirus - Mind the Graph Blog","isPartOf":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#website"},"datePublished":"2020-10-28T11:30:35+00:00","dateModified":"2022-10-18T11:09:32+00:00","author":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/c8eaee6d8007ac319523c3ddc98cedd3"},"description":"Read this blog to know everything related to the popular COVID-19 test, RT-PCR or only PCR. You will get in-depth information about this test of Coronavirus.","breadcrumb":{"@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/tr\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/#breadcrumb"},"inLanguage":"fi","potentialAction":[{"@type":"ReadAction","target":["https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/tr\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/"]}]},{"@type":"BreadcrumbList","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/tr\/rt-pcr-test-for-coronavirus\/#breadcrumb","itemListElement":[{"@type":"ListItem","position":1,"name":"Home","item":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/"},{"@type":"ListItem","position":2,"name":"The RT-PCR Test for Coronavirus"}]},{"@type":"WebSite","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#website","url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/","name":"Mind the Graph Blog","description":"Your science can be beautiful!","potentialAction":[{"@type":"SearchAction","target":{"@type":"EntryPoint","urlTemplate":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?s={search_term_string}"},"query-input":"required name=search_term_string"}],"inLanguage":"fi"},{"@type":"Person","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/c8eaee6d8007ac319523c3ddc98cedd3","name":"Fabricio Pamplona","image":{"@type":"ImageObject","inLanguage":"fi","@id":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/#\/schema\/person\/image\/","url":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/da6985d9f20ecb24f3238df103a638ac?s=96&d=mm&r=g","contentUrl":"https:\/\/secure.gravatar.com\/avatar\/da6985d9f20ecb24f3238df103a638ac?s=96&d=mm&r=g","caption":"Fabricio Pamplona"},"description":"Fabricio Pamplona is the founder of Mind the Graph - a tool used by over 400K users in 60 countries. He has a Ph.D. and solid scientific background in Psychopharmacology and experience as a Guest Researcher at the Max Planck Institute of Psychiatry (Germany) and Researcher in D'Or Institute for Research and Education (IDOR, Brazil). Fabricio holds over 2500 citations in Google Scholar. He has 10 years of experience in small innovative businesses, with relevant experience in product design and innovation management. Connect with him on LinkedIn - Fabricio Pamplona.","sameAs":["http:\/\/mindthegraph.com","https:\/\/www.linkedin.com\/in\/fabriciopamplona"],"url":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/author\/fabricio\/"}]}},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11803"}],"collection":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/users\/4"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=11803"}],"version-history":[{"count":3,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11803\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":11850,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/11803\/revisions\/11850"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/media\/11847"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=11803"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=11803"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/fi\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=11803"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}