{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/et\/mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph ja 3D-valgu kujutamine"},"content":{"rendered":"

Kas olete kunagi proovinud luua molekulaarillustratsiooni klassikaliste molekulaarvaatajatega? Kui vastus on jaatav, siis teate juba, millega tuleb v\u00f5idelda. <\/p>\n\n\n\n

Sa pead leidma tasuta versiooni, mis ei lammuta su arvutit, ja kulutama tunde, et aru saada, kuidas see t\u00f6\u00f6tab, ja v\u00f5ib-olla on vaja natuke kodeerida. V\u00f5idelda programmidega, mis on keerulised, ebatsensuursed ja n\u00f5uavad sageli litsentsi.<\/p>\n\n\n\n

On olemas lahendus, seda nimetatakse Valgu Imager<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Loo efektiivseid teadusfiguurid minutitega<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Protein Imager'i kohta<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Valgu Imager<\/a> on tasuta veebip\u00f5hine molekulaarvaatleja, millega saab paari klikiga luua molekulaarseid illustratsioone. Selle on v\u00e4lja t\u00f6\u00f6tanud teadlased 3D valgu kujutamise stuudio<\/a> eesm\u00e4rgiga \u00fchtlustada valkude illustreerimist.<\/p>\n\n\n\n

Miks Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager erineb teistest molekulaarvaatlustest selle lihtsuse ja ligip\u00e4\u00e4setavuse poolest. K\u00f5ikide Protein Imager'i funktsioonide kasutamiseks on vaja ainult oma e-posti ja interneti\u00fchenduse abil sisse logida.<\/p>\n\n\n\n

Protein Imageril on kasutajas\u00f5bralik kasutajaliides, mis v\u00f5imaldab molekulaarillustratsiooni iga detaili kohandamist. Kasutaja saab valida erinevate eelseadistatud stiilide vahel (karikatuurne, realistlik, j\u00e4medateraline pind) v\u00f5i kohandada visualiseerimist oma \u00e4ran\u00e4gemise j\u00e4rgi.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
N\u00e4iteid eelseadistatud stiilidest, mida saab kasutada Protein Imageris.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Molekulide kujutised (pind, karikatuur, kerad, pulgad jne), v\u00e4rvimisre\u017eiimid, taustav\u00e4rvid, varjutamine ja \u00fcmbritseva keskkonna oklusioon on vaid m\u00f5ned h\u00e4\u00e4lestatavad parameetrid, millega kasutajad saavad m\u00e4ngida.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Ekspertidele on k\u00e4ttesaadavad ka sellised andmeanal\u00fc\u00fcsi vahendid nagu struktuuride \u00fclesseadmine, j\u00e4rjestuse vaatamine ja valikud.<\/p>\n\n\n\n

Lisaks on see t\u00e4ielikult veebip\u00f5hine, mis t\u00e4hendab, et ei ole vaja kohalikku paigaldust, ei ole vaja tegeleda vananenud versioonidega ega \u00fchilduvusprobleeme teie operatsioonis\u00fcsteemidega. Iga renderdamine tugineb spetsiaalsele serverile ja renderdamise aeg on tavaliselt alla 1 minuti, s\u00f5ltuvalt illustratsiooni keerukusest.<\/p>\n\n\n\n

\n
Alustage Mind the Graph loomisega kohe<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Kes kasutab Protein Imager'i?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager on nii lihtne ja intuitiivne, et sellest saavad kasu k\u00f5ik, alates \u00fcli\u00f5pilastest kuni kogenud teadlasteni. Kasutajad saavad vabalt kasutada oma loovust ja luua teaduslikke illustratsioone erinevatel eesm\u00e4rkidel. <\/p>\n\n\n\n

Paljud teadlased v\u00f5tsid Protein Imager'i kasutusele, et illustreerida oma uurimistulemusi oma t\u00f6\u00f6des v\u00f5i graafilistes kokkuv\u00f5tetes. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Protein Imager, mida kasutab teadlane Matteo Oliverio<\/a> graafiliste kokkuv\u00f5tete loomiseks.<\/p>\n\n\n\n

Loovamad kujundavad ajakirjade kaaned Protein Imageriga. Teaduskommunikatsiooniga kirglikult tegelejad kasutavad Protein Imagerit, et kujundada oma sotsiaalmeediapostituste jaoks pilkup\u00fc\u00fcdvaid visuaalseid kujundusi.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Professor Syma Khalid Oxfordi \u00dclikoolist koostas ajakirja Structure, 29. k\u00f6ide, 5. number, mai 2021 kaane kujunduse.<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

L\u00f5puks on Protein Imageril v\u00f5imalus eksportida molekule mahufailidena (VRML2-vormingus), mida kasutavad meditsiinilised illustraatorid 3D-graafikaprogrammides, nagu Blender, Cinema 4D, Maya.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Portfoolio pilt BioSciVisuals teadusliku illustratsiooni stuudio portfooliost.<\/a> Protein Imager'i kasutati molekulide illustreerimiseks, mis sisalduvad l\u00f5plikus plakatigraafikas koos professionaalsete illustreerimisvahenditega.<\/p>\n\n\n\n

\n
Kas olete valmis Mind the Graph-sse t\u00f6\u00f6le asuma?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

K\u00e4ivitage oma illustratsioonid<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Vaatame \u00fcle p\u00f5hilised sammud, et alustada oma illustratsiooniteekonda.<\/p>\n\n\n\n

1 - Molekulaarstruktuuri laadimine<\/h3>\n\n\n\n

Mine edasi Valgu Imager<\/a> ja laadida \u00fcles mis tahes molekulaarstruktuuri oma arvutist v\u00f5i otsida seda bioloogilistest andmebaasidest, nagu Protein Data Bank v\u00f5i OPM (Orientations of Proteins in Membranes) andmebaas.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Kohandamine<\/h3>\n\n\n\n

Paremal asuva struktuuri paneeli kaudu valige molekulaarsed kujutised ja v\u00e4rviskeemid, visualiseerimispaneelide kaudu h\u00e4\u00e4lestage varjud, tuled, \u00fcmbritsev oklusioon, valige lihtsalt eelseadistatud stiil.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - Hangi pilt<\/h3>\n\n\n\n

Kui olete oma konstruktsiooni v\u00e4limusega rahul, k\u00fcsige renderdamist.<\/p>\n\n\n\n

M\u00f5ne minuti p\u00e4rast saate illustratsiooni kvaliteetselt alla laadida renderduspaneelilt. Pange t\u00e4hele, et renderduse taotlemiseks peate registreeruma kehtiva e-posti aadressiga.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Jaga seda oma koost\u00f6\u00f6partneritega<\/h3>\n\n\n\n

Kui olete oma t\u00f6\u00f6ga rahul, saate selle salvestada kasutaja kausta, mis salvestab kuni 25 MB. Saate iga projekti kohta lingi, mida saate jagada kaast\u00f6\u00f6tajatega, nii et k\u00f5ik on \u00fchel ja samal lehel.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
Alusta kohe tasuta Mind The Graphi kasutamist!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph ja 3D-valgu kujutamine<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Loomulikult moodustavad 3D Protein Imaging ja Mind the Graph parima partnerluse \u00fcldse! <\/p>\n\n\n\n

Saate kasutada oma 3D-valgu kujutist ja laadida selle oma loomingusse Mind the Graph-sse \u00fcles sekundiga. Piltide \u00fcleslaadimise \u00f5ppimiseks saate vaadata \u00f5ppevideot siinsamas<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

V\u00f5i minge oma Mind the Graph loomisele, kl\u00f5psake nupule Rohkem<\/strong> vasakpoolse men\u00fc\u00fc allosas, seej\u00e4rel Laadige \u00fcles<\/strong>, valige oma pilt, ja p\u00e4rast laadimist valige ja lohistage pilt oma t\u00f6\u00f6ruumi, ja valmis! <\/p>\n\n\n\n

Lisaks saate valida Mind the Graph galeriis saadaval oleva illustratsiooni, mida saate kasutada koos oma valkude piltidega. <\/p>\n\n\n\n

Mind the Graph galeriis on palju visuaalselt atraktiivseid arvandmeid teie uurimist\u00f6\u00f6de jaoks. 40 000+ teaduslikult t\u00e4pset illustratsiooni 80+ populaarse valdkonna kohta. Kui vajate illustratsiooni, leiate selle Mind the Graph-st. <\/p>\n\n\n\n

Kui te siiski ei leidnud seda, mida vajate, v\u00f5i kui vajate v\u00e4ga spetsiifilist illustratsiooni, v\u00f5ite taotleda isikup\u00e4rastatud illustratsiooni ja Mind the Graph illustratsioonimeeskond kujundab selle teie jaoks. K\u00f5ik, mida peate tegema, on t\u00e4ita Mind the Graph Ikooni taotlemine<\/strong> vorm, mis asub teie t\u00f6\u00f6ruumis, koos l\u00fchikese selgituse ja v\u00f5rdluspildiga. N\u00e4dala jooksul saate oma isikup\u00e4rastatud illustratsiooni. <\/p>\n\n\n\n

H\u00e4mmastav, eks ole? <\/p>\n\n\n\n

Vaadake videot selle kohta, kuidas saate luua oma teadusliku joonise Mind the Graph abil ja kasutada v\u00e4liseid pilte 3D Protein Imaging'ist.<\/p>\n\n\n\n

\n