{"id":15202,"date":"2021-10-29T13:59:11","date_gmt":"2021-10-29T15:59:11","guid":{"rendered":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/?p=15202"},"modified":"2023-01-05T13:07:06","modified_gmt":"2023-01-05T16:07:06","slug":"mind-the-graph-and-3d-protein-imaging-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/mindthegraph.com\/blog\/da\/mind-the-graph-og-3d-protein-billeddannelse-2\/","title":{"rendered":"Mind the Graph og 3D-billeddannelse af proteiner"},"content":{"rendered":"

Har du nogensinde pr\u00f8vet at lave en molekyl\u00e6r illustration med klassiske molekyl\u00e6re viewers? Hvis svaret er ja, s\u00e5 kender du allerede kampen. <\/p>\n\n\n\n

Du er n\u00f8dt til at finde en gratis version, der ikke f\u00e5r din computer til at g\u00e5 ned, og bruge timer p\u00e5 at finde ud af, hvordan det fungerer, muligvis med lidt kodning involveret. K\u00e6mpe med programmer, der er komplicerede, uintuitive og ofte kr\u00e6ver en licens.<\/p>\n\n\n\n

Der findes en l\u00f8sning, og den hedder Protein-imager<\/a>!<\/p>\n\n\n\n

\n
Lav effektive videnskabsfigurer p\u00e5 f\u00e5 minutter<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Om Protein Imager<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein-imager<\/a> er en gratis webbaseret molekyl\u00e6r viewer, der kan skabe molekyl\u00e6re illustrationer med et par klik. Den er udviklet af forskere fra Studie til 3D-billeddannelse af proteiner<\/a> med det form\u00e5l at str\u00f8mline proteinillustrationen.<\/p>\n\n\n\n

Hvorfor Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Det, der adskiller Protein Imager fra andre molekyl\u00e6re viewere, er dens enkelhed og tilg\u00e6ngelighed. Du beh\u00f8ver kun at logge ind med din e-mail og en internetforbindelse for at f\u00e5 adgang til alle Protein Imagers funktioner.<\/p>\n\n\n\n

Protein Imager har en brugervenlig gr\u00e6nseflade, der g\u00f8r det muligt at tilpasse den molekyl\u00e6re illustration i alle detaljer. Brugeren kan v\u00e6lge mellem forskellige forudindstillede stilarter (tegneserieagtig, realistisk, grovkornet overflade) eller tilpasse visualiseringen, som de vil.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a>
Eksempler p\u00e5 forudindstillede stilarter, der kan bruges p\u00e5 Protein Imager.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Molekyl\u00e6re repr\u00e6sentationer (overflade, tegneserie, kugler, pinde osv.), farvetilstande, baggrundsfarver, skygge og omgivende okklusion er blot nogle af de justerbare parametre, som brugerne kan lege med.<\/p>\n\n\n\n

\"\"\/<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Dataanalysev\u00e6rkt\u00f8jer som strukturoverlejring, sekvensfremviser og selektioner er ogs\u00e5 tilg\u00e6ngelige for eksperter.<\/p>\n\n\n\n

Desuden er det helt online, hvilket betyder ingen lokal installation, ingen h\u00e5ndtering af for\u00e6ldede versioner eller kompatibilitetsproblemer med dine operativsystemer. Hver gengivelse er afh\u00e6ngig af en dedikeret server, og gengivelsestiden er typisk mindre end 1 minut, afh\u00e6ngigt af illustrationens kompleksitet.<\/p>\n\n\n\n

\n
Begynd at skabe hos Mind the Graph nu<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Hvem bruger Protein Imager?<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Protein Imager er s\u00e5 nemt og intuitivt, at alle kan f\u00e5 gavn af det, lige fra studerende til erfarne forskere. Brugerne kan frit slippe deres kreativitet l\u00f8s og skabe videnskabelige illustrationer til forskellige form\u00e5l. <\/p>\n\n\n\n

Mange forskere har brugt Protein Imager til at illustrere deres forskningsresultater i deres artikler eller grafiske sammendrag. <\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Protein Imager brugt af videnskabsmand Matteo Oliverio<\/a> til at skabe grafiske abstrakter.<\/p>\n\n\n\n

De mere kreative designer omslag til tidsskrifter med Protein Imager. De, der br\u00e6nder for videnskabskommunikation, bruger Protein Imager til at designe i\u00f8jnefaldende billeder til deres opslag p\u00e5 de sociale medier.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Professor Syma Khalid fra University of Oxford har produceret designet til forsiden af tidsskriftet Structure, Volume 29, Issue 5, maj 2021<\/a>.<\/p>\n\n\n\n

Endelig har Protein Imager mulighed for at eksportere molekylerne som volumetriske filer (VRML2-format), der bruges af medicinske illustratorer i 3D-grafikprogrammer som Blender, Cinema 4D, Maya.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

Portfoliobillede fra BioSciVisuals' videnskabelige illustrationsstudie.<\/a> Protein Imager blev brugt til at illustrere de molekyler, der indgik i den endelige plakatgrafik, sammen med professionelle illustrationsv\u00e6rkt\u00f8jer.<\/p>\n\n\n\n

\n
Er du klar til at komme i gang hos Mind the Graph?<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Kickstart dine illustrationer<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Lad os gennemg\u00e5 de grundl\u00e6ggende trin til at starte din illustrationsrejse, skal vi?<\/p>\n\n\n\n

1 - Indl\u00e6s den molekyl\u00e6re struktur<\/h3>\n\n\n\n

G\u00e5 til Protein-imager<\/a> og uploade enhver molekyl\u00e6r struktur fra din computer eller hente den fra biologiske databaser som Protein Data Bank eller OPM-databasen (Orientations of Proteins in Membranes).<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

2 - Tilpas<\/h3>\n\n\n\n

I strukturpanelet til h\u00f8jre kan du v\u00e6lge molekyl\u00e6r repr\u00e6sentation og farveskemaer, og i visualiseringspanelerne kan du indstille skygger, lys og omgivende okklusion og v\u00e6lge en forudindstillet stil.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

3 - Hent billedet<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e5r du er tilfreds med udseendet af din konstruktion, kan du bede om en rendering.<\/p>\n\n\n\n

Om f\u00e5 minutter vil du kunne downloade illustrationen i h\u00f8j kvalitet fra renderingspanelet. Bem\u00e6rk, at du skal tilmelde dig med en gyldig e-mailadresse for at anmode om en gengivelse.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n

4 - Del den med dine samarbejdspartnere<\/h3>\n\n\n\n

N\u00e5r du er tilfreds med dit arbejde, kan du gemme det i brugermappen, der gemmer op til 25 MB. Du kan f\u00e5 et link til hvert projekt, som du kan dele med samarbejdspartnere, s\u00e5 alle er p\u00e5 samme side.<\/p>\n\n\n\n

\"\"<\/a><\/figure>\n\n\n\n
\n
Begynd at bruge Mind The Graph gratis lige nu!<\/a><\/div>\n<\/div>\n\n\n\n

Mind the Graph og 3D-billeddannelse af proteiner<\/strong><\/h2>\n\n\n\n

Selvf\u00f8lgelig udg\u00f8r 3D Protein Imaging og Mind the Graph det bedste partnerskab nogensinde! <\/p>\n\n\n\n

Du kan bruge dit 3D-proteinbillede og uploade det til din kreation p\u00e5 Mind the Graph p\u00e5 et sekund. For at l\u00e6re at uploade billeder kan du se en tutorial-video lige her<\/a>. <\/p>\n\n\n\n

Eller g\u00e5 til din Mind the Graph-oprettelse, klik p\u00e5 Mere<\/strong> i bunden af din venstre menu, og derefter Upload<\/strong>v\u00e6lg dit billede, og n\u00e5r det er indl\u00e6st, skal du v\u00e6lge og tr\u00e6kke billedet til dit arbejdsomr\u00e5de - og f\u00e6rdig! <\/p>\n\n\n\n

Desuden kan du v\u00e6lge enhver illustration, der er tilg\u00e6ngelig p\u00e5 Mind the Graph Gallery, til brug sammen med dine proteinbilleder. <\/p>\n\n\n\n

Mind the Graph Gallery har mange visuelt tiltalende figurer til din forskning, med 40.000+ videnskabeligt n\u00f8jagtige illustrationer inden for 80+ popul\u00e6re omr\u00e5der. Hvis du har brug for en illustration, kan du finde den hos Mind the Graph. <\/p>\n\n\n\n

Men hvis du ikke fandt, hvad du havde brug for, eller hvis du har brug for en meget specifik illustration, kan du anmode om en personlig illustration, og Mind the Graph's illustrationsteam vil designe den til dig. Alt, hvad du skal g\u00f8re, er at udfylde Mind the Graph Anmod om et ikon<\/strong> formular, inde i dit arbejdsomr\u00e5de, med en kort forklaring og et referencebillede. Inden for en uge vil du modtage din personlige illustration. <\/p>\n\n\n\n

Utroligt, ikke? <\/p>\n\n\n\n

Se videoen om, hvordan du kan skabe din videnskabelige figur ved hj\u00e6lp af Mind the Graph og bruge eksterne billeder fra 3D Protein Imaging.<\/p>\n\n\n\n

\n